Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G204500.2,Sobic.007G204500.1,Sobic.007G204500.3
Synonym Sb07g027190
Functional annotation expressed protein
UniProt C5YIK9
Pfam -
Panther DB PTHR33165 PTHR33165:SF1
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g02210.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium KQJ85112
Barley -
Wheat TraesCS2B02G515100
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G111600 WRKY89, expressed -
2 Sobic.004G251350 - -
3 Sobic.010G179150 - -
4 Sobic.007G161450 - -
5 Sobic.007G116600 5-AMP-activated protein kinase beta-1 subunit-related, putative, expressed -
6 Sobic.008G119000 cysteine protease, putative, expressed -
7 Sobic.001G537900 AGAP010609-PA, putative, expressed K17867: DPH4, diphthamide biosynthesis protein 4
8 Sobic.006G180500 - -
9 Sobic.001G120100 DUF1295 domain containing protein, putative, expressed -
10 Sobic.009G085600 acetyltransferase, GNAT family, putative, expressed -
11 Sobic.004G016600 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -
12 Sobic.007G013100 OsFBX142 - F-box domain containing protein, expressed -
13 Sobic.009G082400 - -
14 Sobic.008G131800 zinc knuckle family protein, expressed -
15 Sobic.001G481201 - -
16 Sobic.002G004100 kinesin motor domain containing protein, putative, expressed K10405: kinesin family member C1
17 Sobic.006G222800 NBS-LRR disease resistance protein, putative, expressed -
18 Sobic.001G016900 RNA-binding protein Luc7-like, putative, expressed -
19 Sobic.003G008850 - -
20 Sobic.004G239000 - -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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