Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G239000.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A194YRA9
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G099500 invertase/pectin methylesterase inhibitor family protein, putative, expressed -
2 Sobic.008G131800 zinc knuckle family protein, expressed -
3 Sobic.002G284800 expressed protein -
4 Sobic.002G430200 PSF2 - Putative GINS complex subunit, expressed K10733: GINS2, GINS complex subunit 2
5 Sobic.001G016900 RNA-binding protein Luc7-like, putative, expressed -
6 Sobic.003G368150 - -
7 Sobic.001G255700 - -
8 Sobic.002G387100 X8 domain containing protein, expressed -
9 Sobic.007G122300 - -
10 Sobic.007G111600 WRKY89, expressed -
11 Sobic.003G367401 - -
12 Sobic.009G152901 - -
13 Sobic.001G441800 hydroxyproline-rich glycoprotein family protein, putative, expressed -
14 Sobic.008G133100 OsWAK13 - OsWAK receptor-like protein kinase, expressed -
15 Sobic.007G116600 5-AMP-activated protein kinase beta-1 subunit-related, putative, expressed -
16 Sobic.010G201000 - -
17 Sobic.010G179150 - -
18 Sobic.001G525000 polygalacturonase, putative, expressed -
19 Sobic.003G105300 - -
20 Sobic.007G013100 OsFBX142 - F-box domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic004G239000 Sobic004G239000 Sobic003G099500 Sobic003G099500 Sobic004G239000--Sobic003G099500 Sobic008G131800 Sobic008G131800 Sobic004G239000--Sobic008G131800 Sobic002G284800 Sobic002G284800 Sobic004G239000--Sobic002G284800 Sobic002G430200 Sobic002G430200 Sobic004G239000--Sobic002G430200 Sobic001G016900 Sobic001G016900 Sobic004G239000--Sobic001G016900 Sobic003G368150 Sobic003G368150 Sobic004G239000--Sobic003G368150 Sobic001G255700 Sobic001G255700 Sobic004G239000--Sobic001G255700 Sobic002G387100 Sobic002G387100 Sobic004G239000--Sobic002G387100 Sobic007G122300 Sobic007G122300 Sobic004G239000--Sobic007G122300 Sobic003G099500--Sobic004G239000 Sobic003G099500--Sobic002G387100 Sobic003G099500--Sobic002G430200 Sobic003G099500--Sobic001G016900 Sobic003G099500--Sobic007G122300 Sobic003G099500--Sobic002G284800 Sobic003G099500--Sobic008G131800 Sobic003G099500--Sobic003G368150 Sobic007G111600 Sobic007G111600 Sobic003G099500--Sobic007G111600 Sobic008G131800--Sobic004G239000 Sobic008G131800--Sobic002G284800 Sobic008G131800--Sobic001G255700 Sobic008G131800--Sobic003G368150 Sobic008G131800--Sobic007G111600 Sobic010G179150 Sobic010G179150 Sobic008G131800--Sobic010G179150 Sobic008G131800--Sobic007G122300 Sobic008G131800--Sobic003G099500 Sobic008G131800--Sobic001G016900 Sobic002G284800--Sobic003G368150 Sobic002G284800--Sobic001G255700 Sobic002G284800--Sobic004G239000 Sobic002G284800--Sobic008G131800 Sobic008G133100 Sobic008G133100 Sobic002G284800--Sobic008G133100 Sobic002G284800--Sobic003G099500 Sobic002G284800--Sobic002G387100 Sobic002G284800--Sobic007G122300 Sobic003G105300 Sobic003G105300 Sobic002G284800--Sobic003G105300 Sobic002G430200--Sobic002G387100 Sobic002G430200--Sobic007G122300 Sobic002G430200--Sobic003G099500 Sobic003G367401 Sobic003G367401 Sobic002G430200--Sobic003G367401 Sobic001G525000 Sobic001G525000 Sobic002G430200--Sobic001G525000 Sobic002G430200--Sobic004G239000 Sobic003G120400 Sobic003G120400 Sobic002G430200--Sobic003G120400 Sobic010G201000 Sobic010G201000 Sobic002G430200--Sobic010G201000 Sobic002G430200--Sobic002G284800 Sobic001G016900--Sobic004G239000 Sobic001G016900--Sobic003G099500 Sobic001G016900--Sobic003G367401 Sobic001G016900--Sobic007G111600 Sobic001G016900--Sobic008G131800 Sobic001G016900--Sobic002G430200 Sobic001G016900--Sobic010G201000 Sobic002G004100 Sobic002G004100 Sobic001G016900--Sobic002G004100 Sobic004G016600 Sobic004G016600 Sobic001G016900--Sobic004G016600 Sobic003G368150--Sobic002G284800 Sobic003G368150--Sobic001G255700 Sobic003G368150--Sobic008G131800 Sobic003G368150--Sobic007G122300 Sobic003G368150--Sobic004G239000 Sobic003G368150--Sobic008G133100 Sobic003G368150--Sobic002G387100 Sobic004G197300 Sobic004G197300 Sobic003G368150--Sobic004G197300 Sobic003G368150--Sobic003G099500 Sobic001G255700--Sobic002G284800 Sobic001G255700--Sobic003G368150 Sobic001G255700--Sobic008G131800 Sobic001G255700--Sobic004G239000 Sobic001G255700--Sobic008G133100 Sobic001G255700--Sobic003G105300 Sobic001G255700--Sobic004G197300 Sobic001G255700--Sobic010G179150 Sobic009G163500 Sobic009G163500 Sobic001G255700--Sobic009G163500 Sobic002G387100--Sobic002G430200 Sobic002G387100--Sobic007G122300 Sobic002G387100--Sobic003G099500 Sobic002G387100--Sobic004G239000 Sobic002G387100--Sobic001G525000 Sobic002G387100--Sobic003G367401 Sobic002G387100--Sobic002G284800 Sobic002G387100--Sobic003G368150 Sobic002G387100--Sobic003G120400 Sobic007G122300--Sobic002G430200 Sobic007G122300--Sobic002G387100 Sobic007G122300--Sobic003G368150 Sobic007G122300--Sobic004G239000 Sobic007G122300--Sobic003G099500 Sobic007G122300--Sobic003G367401 Sobic007G122300--Sobic008G131800 Sobic007G122300--Sobic002G284800 Sobic001G441800 Sobic001G441800 Sobic007G122300--Sobic001G441800
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.