Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G105300.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6Q2P7
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G407000 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during dark-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@ proteins of unknown function domain containing protein, putative, expressed -
2 Sobic.008G020300 myb-like DNA-binding domain containing protein, putative, expressed K09422: transcription factor MYB, plant
3 Sobic.001G255700 - -
4 Sobic.002G284800 expressed protein -
5 Sobic.003G368150 - -
6 Sobic.009G163500 - -
7 Sobic.004G197300 - -
8 Sobic.003G109400 - -
9 Sobic.001G537900 AGAP010609-PA, putative, expressed K17867: DPH4, diphthamide biosynthesis protein 4
10 Sobic.008G133100 OsWAK13 - OsWAK receptor-like protein kinase, expressed -
11 Sobic.007G001300 "cell wall modification, deposition of casparian strips, endodermis, transmembrane"(PubMedID : 24920445)@membrane associated DUF588 domain containing protein, putative, expressed -
12 Sobic.008G131800 zinc knuckle family protein, expressed -
13 Sobic.010G224800 patellin-5, putative, expressed -
14 Sobic.004G239000 - -
15 Sobic.002G156300 - -
16 Sobic.010G179150 - -
17 Sobic.002G425900 expressed protein -
18 Sobic.004G354800 - -
19 Sobic.010G114400 expressed protein -
20 Sobic.009G031100 cycloeucalenol cycloisomerase, putative, expressed K08246: cycloeucalenol cycloisomerase


Gene co-expression network
sample Sobic003G105300 Sobic003G105300 Sobic001G407000 Sobic001G407000 Sobic003G105300--Sobic001G407000 Sobic008G020300 Sobic008G020300 Sobic003G105300--Sobic008G020300 Sobic001G255700 Sobic001G255700 Sobic003G105300--Sobic001G255700 Sobic002G284800 Sobic002G284800 Sobic003G105300--Sobic002G284800 Sobic003G368150 Sobic003G368150 Sobic003G105300--Sobic003G368150 Sobic009G163500 Sobic009G163500 Sobic003G105300--Sobic009G163500 Sobic004G197300 Sobic004G197300 Sobic003G105300--Sobic004G197300 Sobic003G109400 Sobic003G109400 Sobic003G105300--Sobic003G109400 Sobic001G537900 Sobic001G537900 Sobic003G105300--Sobic001G537900 Sobic001G407000--Sobic003G105300 Sobic001G407000--Sobic008G020300 Sobic001G407000--Sobic001G255700 Sobic001G541900 Sobic001G541900 Sobic001G407000--Sobic001G541900 Sobic001G407000--Sobic002G284800 Sobic001G407000--Sobic003G368150 Sobic001G407000--Sobic009G163500 Sobic010G224800 Sobic010G224800 Sobic001G407000--Sobic010G224800 Sobic001G407000--Sobic001G537900 Sobic008G020300--Sobic001G537900 Sobic008G020300--Sobic003G105300 Sobic008G020300--Sobic001G407000 Sobic008G020300--Sobic003G109400 Sobic008G020300--Sobic001G255700 Sobic008G020300--Sobic009G163500 Sobic008G020300--Sobic004G197300 Sobic004G354800 Sobic004G354800 Sobic008G020300--Sobic004G354800 Sobic007G001300 Sobic007G001300 Sobic008G020300--Sobic007G001300 Sobic001G255700--Sobic002G284800 Sobic001G255700--Sobic003G368150 Sobic008G131800 Sobic008G131800 Sobic001G255700--Sobic008G131800 Sobic004G239000 Sobic004G239000 Sobic001G255700--Sobic004G239000 Sobic008G133100 Sobic008G133100 Sobic001G255700--Sobic008G133100 Sobic001G255700--Sobic003G105300 Sobic001G255700--Sobic004G197300 Sobic010G179150 Sobic010G179150 Sobic001G255700--Sobic010G179150 Sobic001G255700--Sobic009G163500 Sobic002G284800--Sobic003G368150 Sobic002G284800--Sobic001G255700 Sobic002G284800--Sobic004G239000 Sobic002G284800--Sobic008G131800 Sobic002G284800--Sobic008G133100 Sobic003G099500 Sobic003G099500 Sobic002G284800--Sobic003G099500 Sobic002G387100 Sobic002G387100 Sobic002G284800--Sobic002G387100 Sobic007G122300 Sobic007G122300 Sobic002G284800--Sobic007G122300 Sobic002G284800--Sobic003G105300 Sobic003G368150--Sobic002G284800 Sobic003G368150--Sobic001G255700 Sobic003G368150--Sobic008G131800 Sobic003G368150--Sobic007G122300 Sobic003G368150--Sobic004G239000 Sobic003G368150--Sobic008G133100 Sobic003G368150--Sobic002G387100 Sobic003G368150--Sobic004G197300 Sobic003G368150--Sobic003G099500 Sobic009G163500--Sobic004G354800 Sobic009G163500--Sobic003G109400 Sobic009G163500--Sobic001G255700 Sobic009G163500--Sobic008G131800 Sobic009G163500--Sobic004G197300 Sobic009G163500--Sobic003G368150 Sobic009G163500--Sobic010G179150 Sobic009G163500--Sobic001G537900 Sobic009G163500--Sobic002G284800 Sobic004G197300--Sobic010G179150 Sobic004G197300--Sobic003G368150 Sobic004G197300--Sobic001G255700 Sobic004G197300--Sobic007G001300 Sobic004G197300--Sobic002G284800 Sobic004G197300--Sobic008G131800 Sobic004G197300--Sobic009G163500 Sobic004G197300--Sobic001G537900 Sobic004G197300--Sobic003G109400 Sobic002G156300 Sobic002G156300 Sobic003G109400--Sobic002G156300 Sobic003G109400--Sobic010G224800 Sobic003G109400--Sobic007G001300 Sobic010G114400 Sobic010G114400 Sobic003G109400--Sobic010G114400 Sobic003G109400--Sobic009G163500 Sobic009G031100 Sobic009G031100 Sobic003G109400--Sobic009G031100 Sobic003G109400--Sobic008G020300 Sobic002G206200 Sobic002G206200 Sobic003G109400--Sobic002G206200 Sobic003G109400--Sobic004G197300 Sobic001G537900--Sobic008G020300 Sobic001G120100 Sobic001G120100 Sobic001G537900--Sobic001G120100 Sobic001G537900--Sobic010G179150 Sobic001G537900--Sobic004G354800 Sobic004G251350 Sobic004G251350 Sobic001G537900--Sobic004G251350 Sobic001G537900--Sobic004G197300 Sobic001G537900--Sobic009G163500 Sobic003G008850 Sobic003G008850 Sobic001G537900--Sobic003G008850 Sobic007G111600 Sobic007G111600 Sobic001G537900--Sobic007G111600
Octagon: transcription factors


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