Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G425900.1
Synonym Sb02g043640
Functional annotation expressed protein
UniProt C5X6C5
Pfam -
Panther DB PTHR33124 PTHR33124:SF12
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G09250 : basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g19780.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a049224
Brachypodium -
Barley -
Wheat TraesCS2A02G096400
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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Gene co-expression network
sample Sobic002G425900 Sobic002G425900 Sobic010G224800 Sobic010G224800 Sobic002G425900--Sobic010G224800 Sobic002G284800 Sobic002G284800 Sobic002G425900--Sobic002G284800 Sobic001G255700 Sobic001G255700 Sobic002G425900--Sobic001G255700 Sobic003G105300 Sobic003G105300 Sobic002G425900--Sobic003G105300 Sobic010G114400 Sobic010G114400 Sobic002G425900--Sobic010G114400 Sobic003G368150 Sobic003G368150 Sobic002G425900--Sobic003G368150 Sobic008G133100 Sobic008G133100 Sobic002G425900--Sobic008G133100 Sobic003G109400 Sobic003G109400 Sobic002G425900--Sobic003G109400 Sobic007G001300 Sobic007G001300 Sobic002G425900--Sobic007G001300 Sobic010G224800--Sobic010G114400 Sobic010G224800--Sobic007G001300 Sobic010G224800--Sobic003G109400 Sobic002G156300 Sobic002G156300 Sobic010G224800--Sobic002G156300 Sobic009G031100 Sobic009G031100 Sobic010G224800--Sobic009G031100 Sobic010G224800--Sobic002G425900 Sobic010G224800--Sobic003G105300 Sobic004G197300 Sobic004G197300 Sobic010G224800--Sobic004G197300 Sobic009G163500 Sobic009G163500 Sobic010G224800--Sobic009G163500 Sobic002G284800--Sobic003G368150 Sobic002G284800--Sobic001G255700 Sobic004G239000 Sobic004G239000 Sobic002G284800--Sobic004G239000 Sobic008G131800 Sobic008G131800 Sobic002G284800--Sobic008G131800 Sobic002G284800--Sobic008G133100 Sobic003G099500 Sobic003G099500 Sobic002G284800--Sobic003G099500 Sobic002G387100 Sobic002G387100 Sobic002G284800--Sobic002G387100 Sobic007G122300 Sobic007G122300 Sobic002G284800--Sobic007G122300 Sobic002G284800--Sobic003G105300 Sobic001G255700--Sobic002G284800 Sobic001G255700--Sobic003G368150 Sobic001G255700--Sobic008G131800 Sobic001G255700--Sobic004G239000 Sobic001G255700--Sobic008G133100 Sobic001G255700--Sobic003G105300 Sobic001G255700--Sobic004G197300 Sobic010G179150 Sobic010G179150 Sobic001G255700--Sobic010G179150 Sobic001G255700--Sobic009G163500 Sobic001G407000 Sobic001G407000 Sobic003G105300--Sobic001G407000 Sobic008G020300 Sobic008G020300 Sobic003G105300--Sobic008G020300 Sobic003G105300--Sobic001G255700 Sobic003G105300--Sobic002G284800 Sobic003G105300--Sobic003G368150 Sobic003G105300--Sobic009G163500 Sobic003G105300--Sobic004G197300 Sobic003G105300--Sobic003G109400 Sobic001G537900 Sobic001G537900 Sobic003G105300--Sobic001G537900 Sobic010G114400--Sobic010G224800 Sobic010G114400--Sobic002G156300 Sobic010G114400--Sobic007G001300 Sobic010G114400--Sobic003G109400 Sobic010G114400--Sobic009G031100 Sobic010G114400--Sobic002G425900 Sobic010G114400--Sobic004G197300 Sobic010G114400--Sobic009G163500 Sobic010G114400--Sobic003G105300 Sobic003G368150--Sobic002G284800 Sobic003G368150--Sobic001G255700 Sobic003G368150--Sobic008G131800 Sobic003G368150--Sobic007G122300 Sobic003G368150--Sobic004G239000 Sobic003G368150--Sobic008G133100 Sobic003G368150--Sobic002G387100 Sobic003G368150--Sobic004G197300 Sobic003G368150--Sobic003G099500 Sobic008G133100--Sobic002G284800 Sobic008G133100--Sobic001G255700 Sobic008G133100--Sobic003G368150 Sobic001G441800 Sobic001G441800 Sobic008G133100--Sobic001G441800 Sobic008G133100--Sobic004G239000 Sobic008G133100--Sobic008G131800 Sobic008G133100--Sobic003G105300 Sobic008G133100--Sobic004G197300 Sobic001G200500 Sobic001G200500 Sobic008G133100--Sobic001G200500 Sobic003G109400--Sobic002G156300 Sobic003G109400--Sobic010G224800 Sobic003G109400--Sobic007G001300 Sobic003G109400--Sobic010G114400 Sobic003G109400--Sobic009G163500 Sobic003G109400--Sobic009G031100 Sobic003G109400--Sobic008G020300 Sobic002G206200 Sobic002G206200 Sobic003G109400--Sobic002G206200 Sobic003G109400--Sobic004G197300 Sobic007G001300--Sobic002G156300 Sobic007G001300--Sobic010G224800 Sobic007G001300--Sobic010G114400 Sobic007G001300--Sobic003G109400 Sobic007G001300--Sobic009G031100 Sobic007G001300--Sobic004G197300 Sobic007G001300--Sobic003G105300 Sobic007G001300--Sobic008G020300 Sobic007G001300--Sobic010G179150
Octagon: transcription factors


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