Gene annotation
Transcriptome id
Sobic.004G330400.1
Synonym
Sb04g035930
Functional annotation
expressed protein
UniProt
C5XUG6
Pfam
PF07893
Panther DB
PTHR33085
PTHR33085:SF1
NCBI CDD
-
KEGG Orthology
-
Gene Ontology
-
Orthologs (automatic annotation)
TAIR
-
RAP-DB (Rice)
LOC_Os07g10880.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn)
-
Brachypodium
KQK01148
Barley
-
Wheat
-
Populus
-
JBrowse
Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot
Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles
Rank
Gene
Function
KEGG orthology
1
Sobic.002G284800
expressed protein
-
2
Sobic.001G255700
-
-
3
Sobic.003G105300
-
-
4
Sobic.003G368150
-
-
5
Sobic.008G133100
OsWAK13 - OsWAK receptor-like protein kinase, expressed
-
6
Sobic.002G425900
expressed protein
-
7
Sobic.010G224800
patellin-5, putative, expressed
-
8
Sobic.003G109400
-
-
9
Sobic.009G163500
-
-
10
Sobic.002G156300
-
-
11
Sobic.010G179150
-
-
12
Sobic.004G197300
-
-
13
Sobic.008G131800
zinc knuckle family protein, expressed
-
14
Sobic.002G206200
monogalactosyldiacylglycerol synthase, putative, expressed
K03715 : 1,2-diacylglycerol 3-beta-galactosyltransferase
15
Sobic.007G001300
"cell wall modification, deposition of casparian strips, endodermis, transmembrane"(PubMedID : 24920445)@membrane associated DUF588 domain containing protein, putative, expressed
-
16
Sobic.004G239000
-
-
17
Sobic.009G031100
cycloeucalenol cycloisomerase, putative, expressed
K08246 : cycloeucalenol cycloisomerase
18
Sobic.003G099500
invertase/pectin methylesterase inhibitor family protein, putative, expressed
-
19
Sobic.010G114400
expressed protein
-
20
Sobic.001G407000
SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during dark-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@ proteins of unknown function domain containing protein, putative, expressed
-
Gene co-expression network
sample
Sobic004G330400
Sobic004G330400
Sobic002G284800
Sobic002G284800
Sobic004G330400--Sobic002G284800
Sobic001G255700
Sobic001G255700
Sobic004G330400--Sobic001G255700
Sobic003G105300
Sobic003G105300
Sobic004G330400--Sobic003G105300
Sobic003G368150
Sobic003G368150
Sobic004G330400--Sobic003G368150
Sobic008G133100
Sobic008G133100
Sobic004G330400--Sobic008G133100
Sobic002G425900
Sobic002G425900
Sobic004G330400--Sobic002G425900
Sobic010G224800
Sobic010G224800
Sobic004G330400--Sobic010G224800
Sobic003G109400
Sobic003G109400
Sobic004G330400--Sobic003G109400
Sobic009G163500
Sobic009G163500
Sobic004G330400--Sobic009G163500
Sobic002G284800--Sobic003G368150
Sobic002G284800--Sobic001G255700
Sobic004G239000
Sobic004G239000
Sobic002G284800--Sobic004G239000
Sobic008G131800
Sobic008G131800
Sobic002G284800--Sobic008G131800
Sobic002G284800--Sobic008G133100
Sobic003G099500
Sobic003G099500
Sobic002G284800--Sobic003G099500
Sobic002G387100
Sobic002G387100
Sobic002G284800--Sobic002G387100
Sobic007G122300
Sobic007G122300
Sobic002G284800--Sobic007G122300
Sobic002G284800--Sobic003G105300
Sobic001G255700--Sobic002G284800
Sobic001G255700--Sobic003G368150
Sobic001G255700--Sobic008G131800
Sobic001G255700--Sobic004G239000
Sobic001G255700--Sobic008G133100
Sobic001G255700--Sobic003G105300
Sobic004G197300
Sobic004G197300
Sobic001G255700--Sobic004G197300
Sobic010G179150
Sobic010G179150
Sobic001G255700--Sobic010G179150
Sobic001G255700--Sobic009G163500
Sobic001G407000
Sobic001G407000
Sobic003G105300--Sobic001G407000
Sobic008G020300
Sobic008G020300
Sobic003G105300--Sobic008G020300
Sobic003G105300--Sobic001G255700
Sobic003G105300--Sobic002G284800
Sobic003G105300--Sobic003G368150
Sobic003G105300--Sobic009G163500
Sobic003G105300--Sobic004G197300
Sobic003G105300--Sobic003G109400
Sobic001G537900
Sobic001G537900
Sobic003G105300--Sobic001G537900
Sobic003G368150--Sobic002G284800
Sobic003G368150--Sobic001G255700
Sobic003G368150--Sobic008G131800
Sobic003G368150--Sobic007G122300
Sobic003G368150--Sobic004G239000
Sobic003G368150--Sobic008G133100
Sobic003G368150--Sobic002G387100
Sobic003G368150--Sobic004G197300
Sobic003G368150--Sobic003G099500
Sobic008G133100--Sobic002G284800
Sobic008G133100--Sobic001G255700
Sobic008G133100--Sobic003G368150
Sobic001G441800
Sobic001G441800
Sobic008G133100--Sobic001G441800
Sobic008G133100--Sobic004G239000
Sobic008G133100--Sobic008G131800
Sobic008G133100--Sobic003G105300
Sobic008G133100--Sobic004G197300
Sobic001G200500
Sobic001G200500
Sobic008G133100--Sobic001G200500
Sobic002G425900--Sobic010G224800
Sobic002G425900--Sobic002G284800
Sobic002G425900--Sobic001G255700
Sobic002G425900--Sobic003G105300
Sobic010G114400
Sobic010G114400
Sobic002G425900--Sobic010G114400
Sobic002G425900--Sobic003G368150
Sobic002G425900--Sobic008G133100
Sobic002G425900--Sobic003G109400
Sobic007G001300
Sobic007G001300
Sobic002G425900--Sobic007G001300
Sobic010G224800--Sobic010G114400
Sobic010G224800--Sobic007G001300
Sobic010G224800--Sobic003G109400
Sobic002G156300
Sobic002G156300
Sobic010G224800--Sobic002G156300
Sobic009G031100
Sobic009G031100
Sobic010G224800--Sobic009G031100
Sobic010G224800--Sobic002G425900
Sobic010G224800--Sobic003G105300
Sobic010G224800--Sobic004G197300
Sobic010G224800--Sobic009G163500
Sobic003G109400--Sobic002G156300
Sobic003G109400--Sobic010G224800
Sobic003G109400--Sobic007G001300
Sobic003G109400--Sobic010G114400
Sobic003G109400--Sobic009G163500
Sobic003G109400--Sobic009G031100
Sobic003G109400--Sobic008G020300
Sobic002G206200
Sobic002G206200
Sobic003G109400--Sobic002G206200
Sobic003G109400--Sobic004G197300
Sobic004G354800
Sobic004G354800
Sobic009G163500--Sobic004G354800
Sobic009G163500--Sobic003G109400
Sobic009G163500--Sobic001G255700
Sobic009G163500--Sobic008G131800
Sobic009G163500--Sobic004G197300
Sobic009G163500--Sobic003G368150
Sobic009G163500--Sobic010G179150
Sobic009G163500--Sobic001G537900
Sobic009G163500--Sobic002G284800
Octagon: transcription factors