Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G076100.1
Synonym
Functional annotation rp3 protein, putative, expressed
UniProt A0A1B6PQS1
Pfam PF00931
Panther DB PTHR23155 PTHR23155:SF455
NCBI CDD KOG4658; Apoptotic ATPase
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G14460 : LRR and NB-ARC domains-containing disease resistance protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os05g23990.1 : rp3 protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a035225
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G082400 - -
2 Sobic.004G016600 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -
3 Sobic.001G537900 AGAP010609-PA, putative, expressed K17867: DPH4, diphthamide biosynthesis protein 4
4 Sobic.003G008850 - -
5 Sobic.007G174100 carrier, putative, expressed -
6 Sobic.004G354800 - -
7 Sobic.002G165401 - -
8 Sobic.003G149900 PPR repeat domain containing protein, putative, expressed -
9 Sobic.006G058300 expressed protein -
10 Sobic.001G120100 DUF1295 domain containing protein, putative, expressed -
11 Sobic.003G136700 - -
12 Sobic.004G251350 - -
13 Sobic.008G119000 cysteine protease, putative, expressed -
14 Sobic.009G085600 acetyltransferase, GNAT family, putative, expressed -
15 Sobic.008G020300 myb-like DNA-binding domain containing protein, putative, expressed K09422: transcription factor MYB, plant
16 Sobic.007G204500 expressed protein -
17 Sobic.006G256801 - -
18 Sobic.001G541900 "similar to Nitrate/chlorate transporter, putative, expressed"(PubMedID : 29862293)@peptide transporter PTR2, putative, expressed K14638: SLC15A3_4, solute carrier family 15 (peptide/histidine transporter), member 3/4
19 Sobic.001G139750 - -
20 Sobic.006G222800 NBS-LRR disease resistance protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic005G076100 Sobic005G076100 Sobic009G082400 Sobic009G082400 Sobic005G076100--Sobic009G082400 Sobic004G016600 Sobic004G016600 Sobic005G076100--Sobic004G016600 Sobic001G537900 Sobic001G537900 Sobic005G076100--Sobic001G537900 Sobic003G008850 Sobic003G008850 Sobic005G076100--Sobic003G008850 Sobic007G174100 Sobic007G174100 Sobic005G076100--Sobic007G174100 Sobic004G354800 Sobic004G354800 Sobic005G076100--Sobic004G354800 Sobic002G165401 Sobic002G165401 Sobic005G076100--Sobic002G165401 Sobic003G149900 Sobic003G149900 Sobic005G076100--Sobic003G149900 Sobic006G058300 Sobic006G058300 Sobic005G076100--Sobic006G058300 Sobic004G251350 Sobic004G251350 Sobic009G082400--Sobic004G251350 Sobic009G082400--Sobic005G076100 Sobic009G082400--Sobic001G537900 Sobic009G082400--Sobic004G016600 Sobic007G204500 Sobic007G204500 Sobic009G082400--Sobic007G204500 Sobic001G481201 Sobic001G481201 Sobic009G082400--Sobic001G481201 Sobic008G119000 Sobic008G119000 Sobic009G082400--Sobic008G119000 Sobic009G085600 Sobic009G085600 Sobic009G082400--Sobic009G085600 Sobic009G082400--Sobic004G354800 Sobic001G120100 Sobic001G120100 Sobic004G016600--Sobic001G120100 Sobic001G016900 Sobic001G016900 Sobic004G016600--Sobic001G016900 Sobic004G016600--Sobic009G085600 Sobic004G016600--Sobic004G251350 Sobic004G016600--Sobic001G537900 Sobic007G013100 Sobic007G013100 Sobic004G016600--Sobic007G013100 Sobic003G167825 Sobic003G167825 Sobic004G016600--Sobic003G167825 Sobic007G111600 Sobic007G111600 Sobic004G016600--Sobic007G111600 Sobic009G152901 Sobic009G152901 Sobic004G016600--Sobic009G152901 Sobic008G020300 Sobic008G020300 Sobic001G537900--Sobic008G020300 Sobic001G537900--Sobic001G120100 Sobic010G179150 Sobic010G179150 Sobic001G537900--Sobic010G179150 Sobic001G537900--Sobic004G354800 Sobic001G537900--Sobic004G251350 Sobic004G197300 Sobic004G197300 Sobic001G537900--Sobic004G197300 Sobic009G163500 Sobic009G163500 Sobic001G537900--Sobic009G163500 Sobic001G537900--Sobic003G008850 Sobic001G537900--Sobic007G111600 Sobic003G008850--Sobic001G537900 Sobic003G008850--Sobic001G120100 Sobic006G256801 Sobic006G256801 Sobic003G008850--Sobic006G256801 Sobic003G008850--Sobic004G016600 Sobic003G008850--Sobic008G020300 Sobic008G164525 Sobic008G164525 Sobic003G008850--Sobic008G164525 Sobic003G008850--Sobic007G204500 Sobic003G008850--Sobic008G119000 Sobic003G008850--Sobic004G251350 Sobic007G174100--Sobic005G076100 Sobic010G132300 Sobic010G132300 Sobic007G174100--Sobic010G132300 Sobic007G174100--Sobic003G149900 Sobic002G326200 Sobic002G326200 Sobic007G174100--Sobic002G326200 Sobic004G160950 Sobic004G160950 Sobic007G174100--Sobic004G160950 Sobic008G096150 Sobic008G096150 Sobic007G174100--Sobic008G096150 Sobic007G174100--Sobic006G058300 Sobic008G096900 Sobic008G096900 Sobic007G174100--Sobic008G096900 Sobic007G174100--Sobic003G008850 Sobic004G354800--Sobic009G163500 Sobic004G354800--Sobic001G537900 Sobic003G109400 Sobic003G109400 Sobic004G354800--Sobic003G109400 Sobic004G354800--Sobic008G020300 Sobic003G136700 Sobic003G136700 Sobic004G354800--Sobic003G136700 Sobic004G354800--Sobic004G197300 Sobic008G131800 Sobic008G131800 Sobic004G354800--Sobic008G131800 Sobic004G354800--Sobic009G152901 Sobic001G255700 Sobic001G255700 Sobic004G354800--Sobic001G255700 Sobic002G165401--Sobic001G481201 Sobic006G222800 Sobic006G222800 Sobic002G165401--Sobic006G222800 Sobic004G001900 Sobic004G001900 Sobic002G165401--Sobic004G001900 Sobic006G180500 Sobic006G180500 Sobic002G165401--Sobic006G180500 Sobic002G165401--Sobic009G082400 Sobic002G165401--Sobic006G256801 Sobic002G165401--Sobic007G204500 Sobic002G165401--Sobic003G008850 Sobic006G094400 Sobic006G094400 Sobic002G165401--Sobic006G094400 Sobic003G149900--Sobic006G058300 Sobic003G149900--Sobic009G152901 Sobic003G149900--Sobic001G537900 Sobic003G149900--Sobic008G020300 Sobic003G149900--Sobic004G016600 Sobic003G149900--Sobic004G354800 Sobic003G149900--Sobic001G016900 Sobic003G149900--Sobic001G120100 Sobic003G038300 Sobic003G038300 Sobic003G149900--Sobic003G038300 Sobic006G058300--Sobic003G149900 Sobic006G058300--Sobic004G016600 Sobic006G058300--Sobic003G038300 Sobic003G126400 Sobic003G126400 Sobic006G058300--Sobic003G126400 Sobic006G069050 Sobic006G069050 Sobic006G058300--Sobic006G069050 Sobic006G058300--Sobic008G020300 Sobic006G058300--Sobic009G152901 Sobic006G058300--Sobic001G537900 Sobic001G407000 Sobic001G407000 Sobic006G058300--Sobic001G407000
Octagon: transcription factors


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