Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G174100.1
Synonym
Functional annotation carrier, putative, expressed
UniProt A0A1B6PIC3
Pfam PF03087
Panther DB PTHR33070 PTHR33070:SF12
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G17070 : Arabidopsis protein of unknown function (DUF241)
RAP-DB (Rice) LOC_Os08g43980.1 : carrier, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a030226 , Zm00025a005660 , Zm00025a005656
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G076100 rp3 protein, putative, expressed -
2 Sobic.010G132300 CDK5RAP3, putative, expressed -
3 Sobic.003G149900 PPR repeat domain containing protein, putative, expressed -
4 Sobic.002G326200 TKL_IRAK_DUF26-la.4 - DUF26 kinases have homology to DUF26 containing loci, expressed -
5 Sobic.004G160950 - -
6 Sobic.008G096150 - -
7 Sobic.006G058300 expressed protein -
8 Sobic.008G096900 protein of unknown function DUF502 domain containing protein, expressed -
9 Sobic.003G008850 - -
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11 Sobic.006G037000 - -
12 Sobic.002G373200 strictosidine synthase, putative, expressed -
13 Sobic.009G082400 - -
14 Sobic.001G212701 - -
15 Sobic.001G537900 AGAP010609-PA, putative, expressed K17867: DPH4, diphthamide biosynthesis protein 4
16 Sobic.004G016600 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -
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18 Sobic.006G019901 - -
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20 Sobic.002G165401 - -


Gene co-expression network
sample Sobic007G174100 Sobic007G174100 Sobic005G076100 Sobic005G076100 Sobic007G174100--Sobic005G076100 Sobic010G132300 Sobic010G132300 Sobic007G174100--Sobic010G132300 Sobic003G149900 Sobic003G149900 Sobic007G174100--Sobic003G149900 Sobic002G326200 Sobic002G326200 Sobic007G174100--Sobic002G326200 Sobic004G160950 Sobic004G160950 Sobic007G174100--Sobic004G160950 Sobic008G096150 Sobic008G096150 Sobic007G174100--Sobic008G096150 Sobic006G058300 Sobic006G058300 Sobic007G174100--Sobic006G058300 Sobic008G096900 Sobic008G096900 Sobic007G174100--Sobic008G096900 Sobic003G008850 Sobic003G008850 Sobic007G174100--Sobic003G008850 Sobic009G082400 Sobic009G082400 Sobic005G076100--Sobic009G082400 Sobic004G016600 Sobic004G016600 Sobic005G076100--Sobic004G016600 Sobic001G537900 Sobic001G537900 Sobic005G076100--Sobic001G537900 Sobic005G076100--Sobic003G008850 Sobic005G076100--Sobic007G174100 Sobic004G354800 Sobic004G354800 Sobic005G076100--Sobic004G354800 Sobic002G165401 Sobic002G165401 Sobic005G076100--Sobic002G165401 Sobic005G076100--Sobic003G149900 Sobic005G076100--Sobic006G058300 Sobic010G132300--Sobic007G174100 Sobic010G132300--Sobic004G160950 Sobic010G155901 Sobic010G155901 Sobic010G132300--Sobic010G155901 Sobic001G212701 Sobic001G212701 Sobic010G132300--Sobic001G212701 Sobic010G132300--Sobic005G076100 Sobic002G114600 Sobic002G114600 Sobic010G132300--Sobic002G114600 Sobic010G132300--Sobic003G008850 Sobic002G373200 Sobic002G373200 Sobic010G132300--Sobic002G373200 Sobic010G132300--Sobic002G165401 Sobic003G149900--Sobic006G058300 Sobic009G152901 Sobic009G152901 Sobic003G149900--Sobic009G152901 Sobic003G149900--Sobic001G537900 Sobic008G020300 Sobic008G020300 Sobic003G149900--Sobic008G020300 Sobic003G149900--Sobic004G016600 Sobic003G149900--Sobic004G354800 Sobic001G016900 Sobic001G016900 Sobic003G149900--Sobic001G016900 Sobic001G120100 Sobic001G120100 Sobic003G149900--Sobic001G120100 Sobic003G038300 Sobic003G038300 Sobic003G149900--Sobic003G038300 Sobic002G326200--Sobic007G174100 Sobic010G200800 Sobic010G200800 Sobic002G326200--Sobic010G200800 Sobic002G326200--Sobic005G076100 Sobic002G326200--Sobic003G149900 Sobic002G326200--Sobic006G058300 Sobic002G326200--Sobic003G008850 Sobic010G257300 Sobic010G257300 Sobic002G326200--Sobic010G257300 Sobic001G115900 Sobic001G115900 Sobic002G326200--Sobic001G115900 Sobic009G258150 Sobic009G258150 Sobic002G326200--Sobic009G258150 Sobic004G160950--Sobic010G132300 Sobic004G160950--Sobic007G174100 Sobic002G231800 Sobic002G231800 Sobic004G160950--Sobic002G231800 Sobic003G279600 Sobic003G279600 Sobic004G160950--Sobic003G279600 Sobic004G160950--Sobic008G020300 Sobic002G284701 Sobic002G284701 Sobic004G160950--Sobic002G284701 Sobic004G160950--Sobic003G149900 Sobic006G019901 Sobic006G019901 Sobic004G160950--Sobic006G019901 Sobic004G160950--Sobic003G008850 Sobic008G096150--Sobic007G174100 Sobic010G150600 Sobic010G150600 Sobic008G096150--Sobic010G150600 Sobic001G523300 Sobic001G523300 Sobic008G096150--Sobic001G523300 Sobic008G096150--Sobic002G326200 Sobic008G096150--Sobic001G212701 Sobic002G234900 Sobic002G234900 Sobic008G096150--Sobic002G234900 Sobic009G031300 Sobic009G031300 Sobic008G096150--Sobic009G031300 Sobic008G096150--Sobic010G200800 Sobic001G309000 Sobic001G309000 Sobic008G096150--Sobic001G309000 Sobic006G058300--Sobic003G149900 Sobic006G058300--Sobic004G016600 Sobic006G058300--Sobic003G038300 Sobic003G126400 Sobic003G126400 Sobic006G058300--Sobic003G126400 Sobic006G069050 Sobic006G069050 Sobic006G058300--Sobic006G069050 Sobic006G058300--Sobic008G020300 Sobic006G058300--Sobic009G152901 Sobic006G058300--Sobic001G537900 Sobic001G407000 Sobic001G407000 Sobic006G058300--Sobic001G407000 Sobic006G037000 Sobic006G037000 Sobic008G096900--Sobic006G037000 Sobic008G096900--Sobic007G174100 Sobic008G096900--Sobic010G257300 Sobic001G537600 Sobic001G537600 Sobic008G096900--Sobic001G537600 Sobic008G096900--Sobic005G076100 Sobic004G012100 Sobic004G012100 Sobic008G096900--Sobic004G012100 Sobic010G253700 Sobic010G253700 Sobic008G096900--Sobic010G253700 Sobic008G096900--Sobic009G031300 Sobic008G096900--Sobic002G326200 Sobic003G008850--Sobic001G537900 Sobic003G008850--Sobic001G120100 Sobic006G256801 Sobic006G256801 Sobic003G008850--Sobic006G256801 Sobic003G008850--Sobic004G016600 Sobic003G008850--Sobic008G020300 Sobic008G164525 Sobic008G164525 Sobic003G008850--Sobic008G164525 Sobic007G204500 Sobic007G204500 Sobic003G008850--Sobic007G204500 Sobic008G119000 Sobic008G119000 Sobic003G008850--Sobic008G119000 Sobic004G251350 Sobic004G251350 Sobic003G008850--Sobic004G251350
Octagon: transcription factors


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