Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G132300.1,Sobic.010G132300.2
Synonym Sb10g012210
Functional annotation CDK5RAP3, putative, expressed
UniProt A0A1W0VST9 , C5Z1N8
Pfam PF05600
Panther DB PTHR14894
NCBI CDD KOG2607; CDK5 activator-binding protein
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G06830 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os06g21560.1 : CDK5RAP3, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a050630
Brachypodium KQK18471
Barley HORVU7Hr1G046270.8 , HORVU7Hr1G046270.9 , HORVU7Hr1G046270.4 , HORVU7Hr1G046270.5 , HORVU7Hr1G046270.6 , HORVU7Hr1G046270.7 , HORVU7Hr1G046270.1 , HORVU7Hr1G046270.2 , HORVU7Hr1G046270.3 , HORVU7Hr1G046270.12 , HORVU7Hr1G046270.10 , HORVU7Hr1G046270.11
Wheat TraesCS7A02G227400 , TraesCS7B02G192100 , TraesCS7D02G227000
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.010G132300


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G174100 carrier, putative, expressed -
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20 Sobic.001G481201 - -


Gene co-expression network
sample Sobic010G132300 Sobic010G132300 Sobic007G174100 Sobic007G174100 Sobic010G132300--Sobic007G174100 Sobic004G160950 Sobic004G160950 Sobic010G132300--Sobic004G160950 Sobic010G155901 Sobic010G155901 Sobic010G132300--Sobic010G155901 Sobic001G212701 Sobic001G212701 Sobic010G132300--Sobic001G212701 Sobic005G076100 Sobic005G076100 Sobic010G132300--Sobic005G076100 Sobic002G114600 Sobic002G114600 Sobic010G132300--Sobic002G114600 Sobic003G008850 Sobic003G008850 Sobic010G132300--Sobic003G008850 Sobic002G373200 Sobic002G373200 Sobic010G132300--Sobic002G373200 Sobic002G165401 Sobic002G165401 Sobic010G132300--Sobic002G165401 Sobic007G174100--Sobic005G076100 Sobic007G174100--Sobic010G132300 Sobic003G149900 Sobic003G149900 Sobic007G174100--Sobic003G149900 Sobic002G326200 Sobic002G326200 Sobic007G174100--Sobic002G326200 Sobic007G174100--Sobic004G160950 Sobic008G096150 Sobic008G096150 Sobic007G174100--Sobic008G096150 Sobic006G058300 Sobic006G058300 Sobic007G174100--Sobic006G058300 Sobic008G096900 Sobic008G096900 Sobic007G174100--Sobic008G096900 Sobic007G174100--Sobic003G008850 Sobic004G160950--Sobic010G132300 Sobic004G160950--Sobic007G174100 Sobic002G231800 Sobic002G231800 Sobic004G160950--Sobic002G231800 Sobic003G279600 Sobic003G279600 Sobic004G160950--Sobic003G279600 Sobic008G020300 Sobic008G020300 Sobic004G160950--Sobic008G020300 Sobic002G284701 Sobic002G284701 Sobic004G160950--Sobic002G284701 Sobic004G160950--Sobic003G149900 Sobic006G019901 Sobic006G019901 Sobic004G160950--Sobic006G019901 Sobic004G160950--Sobic003G008850 Sobic003G400332 Sobic003G400332 Sobic010G155901--Sobic003G400332 Sobic010G155901--Sobic006G058300 Sobic001G407000 Sobic001G407000 Sobic010G155901--Sobic001G407000 Sobic010G155901--Sobic010G132300 Sobic010G155901--Sobic008G020300 Sobic010G155901--Sobic003G149900 Sobic001G139750 Sobic001G139750 Sobic010G155901--Sobic001G139750 Sobic001G541900 Sobic001G541900 Sobic010G155901--Sobic001G541900 Sobic003G105300 Sobic003G105300 Sobic010G155901--Sobic003G105300 Sobic007G157200 Sobic007G157200 Sobic001G212701--Sobic007G157200 Sobic001G212701--Sobic002G114600 Sobic001G212701--Sobic010G132300 Sobic004G184500 Sobic004G184500 Sobic001G212701--Sobic004G184500 Sobic004G314750 Sobic004G314750 Sobic001G212701--Sobic004G314750 Sobic001G212701--Sobic007G174100 Sobic001G212701--Sobic002G326200 Sobic001G176800 Sobic001G176800 Sobic001G212701--Sobic001G176800 Sobic005G094500 Sobic005G094500 Sobic001G212701--Sobic005G094500 Sobic009G082400 Sobic009G082400 Sobic005G076100--Sobic009G082400 Sobic004G016600 Sobic004G016600 Sobic005G076100--Sobic004G016600 Sobic001G537900 Sobic001G537900 Sobic005G076100--Sobic001G537900 Sobic005G076100--Sobic003G008850 Sobic005G076100--Sobic007G174100 Sobic004G354800 Sobic004G354800 Sobic005G076100--Sobic004G354800 Sobic005G076100--Sobic002G165401 Sobic005G076100--Sobic003G149900 Sobic005G076100--Sobic006G058300 Sobic002G114600--Sobic004G314750 Sobic010G035300 Sobic010G035300 Sobic002G114600--Sobic010G035300 Sobic004G001900 Sobic004G001900 Sobic002G114600--Sobic004G001900 Sobic002G114600--Sobic001G212701 Sobic002G114600--Sobic002G165401 Sobic002G114600--Sobic010G132300 Sobic002G114600--Sobic004G184500 Sobic002G116300 Sobic002G116300 Sobic002G114600--Sobic002G116300 Sobic006G222800 Sobic006G222800 Sobic002G114600--Sobic006G222800 Sobic003G008850--Sobic001G537900 Sobic001G120100 Sobic001G120100 Sobic003G008850--Sobic001G120100 Sobic006G256801 Sobic006G256801 Sobic003G008850--Sobic006G256801 Sobic003G008850--Sobic004G016600 Sobic003G008850--Sobic008G020300 Sobic008G164525 Sobic008G164525 Sobic003G008850--Sobic008G164525 Sobic007G204500 Sobic007G204500 Sobic003G008850--Sobic007G204500 Sobic008G119000 Sobic008G119000 Sobic003G008850--Sobic008G119000 Sobic004G251350 Sobic004G251350 Sobic003G008850--Sobic004G251350 Sobic002G373200--Sobic010G132300 Sobic002G373200--Sobic010G155901 Sobic002G373200--Sobic003G400332 Sobic002G373200--Sobic007G174100 Sobic002G373200--Sobic005G076100 Sobic002G373200--Sobic009G082400 Sobic009G202900 Sobic009G202900 Sobic002G373200--Sobic009G202900 Sobic002G373200--Sobic006G058300 Sobic002G373200--Sobic003G149900 Sobic001G481201 Sobic001G481201 Sobic002G165401--Sobic001G481201 Sobic002G165401--Sobic006G222800 Sobic002G165401--Sobic004G001900 Sobic006G180500 Sobic006G180500 Sobic002G165401--Sobic006G180500 Sobic002G165401--Sobic009G082400 Sobic002G165401--Sobic006G256801 Sobic002G165401--Sobic007G204500 Sobic002G165401--Sobic003G008850 Sobic006G094400 Sobic006G094400 Sobic002G165401--Sobic006G094400
Octagon: transcription factors


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