Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G160950.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RMX0
Pfam -
Panther DB PTHR10044 PTHR10044:SF137
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g33030.1 : protein binding protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a020494
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G132300 CDK5RAP3, putative, expressed -
2 Sobic.007G174100 carrier, putative, expressed -
3 Sobic.002G231800 purine permease, putative, expressed -
4 Sobic.003G279600 - -
5 Sobic.008G020300 myb-like DNA-binding domain containing protein, putative, expressed K09422: transcription factor MYB, plant
6 Sobic.002G284701 - -
7 Sobic.003G149900 PPR repeat domain containing protein, putative, expressed -
8 Sobic.006G019901 - -
9 Sobic.003G008850 - -
10 Sobic.005G076100 rp3 protein, putative, expressed -
11 Sobic.001G261440 - -
12 Sobic.001G145300 - -
13 Sobic.001G537900 AGAP010609-PA, putative, expressed K17867: DPH4, diphthamide biosynthesis protein 4
14 Sobic.002G188100 - -
15 Sobic.009G127600 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@tetratricopeptide-like helical, putative, expressed -
16 Sobic.006G172651 - -
17 Sobic.004G354800 - -
18 Sobic.001G309000 glycosyl hydrolases family 16, putative, expressed K08235: xyloglucan:xyloglucosyl transferase
19 Sobic.003G178400 - -
20 Sobic.006G058300 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic004G160950 Sobic004G160950 Sobic010G132300 Sobic010G132300 Sobic004G160950--Sobic010G132300 Sobic007G174100 Sobic007G174100 Sobic004G160950--Sobic007G174100 Sobic002G231800 Sobic002G231800 Sobic004G160950--Sobic002G231800 Sobic003G279600 Sobic003G279600 Sobic004G160950--Sobic003G279600 Sobic008G020300 Sobic008G020300 Sobic004G160950--Sobic008G020300 Sobic002G284701 Sobic002G284701 Sobic004G160950--Sobic002G284701 Sobic003G149900 Sobic003G149900 Sobic004G160950--Sobic003G149900 Sobic006G019901 Sobic006G019901 Sobic004G160950--Sobic006G019901 Sobic003G008850 Sobic003G008850 Sobic004G160950--Sobic003G008850 Sobic010G132300--Sobic007G174100 Sobic010G132300--Sobic004G160950 Sobic010G155901 Sobic010G155901 Sobic010G132300--Sobic010G155901 Sobic001G212701 Sobic001G212701 Sobic010G132300--Sobic001G212701 Sobic005G076100 Sobic005G076100 Sobic010G132300--Sobic005G076100 Sobic002G114600 Sobic002G114600 Sobic010G132300--Sobic002G114600 Sobic010G132300--Sobic003G008850 Sobic002G373200 Sobic002G373200 Sobic010G132300--Sobic002G373200 Sobic002G165401 Sobic002G165401 Sobic010G132300--Sobic002G165401 Sobic007G174100--Sobic005G076100 Sobic007G174100--Sobic010G132300 Sobic007G174100--Sobic003G149900 Sobic002G326200 Sobic002G326200 Sobic007G174100--Sobic002G326200 Sobic007G174100--Sobic004G160950 Sobic008G096150 Sobic008G096150 Sobic007G174100--Sobic008G096150 Sobic006G058300 Sobic006G058300 Sobic007G174100--Sobic006G058300 Sobic008G096900 Sobic008G096900 Sobic007G174100--Sobic008G096900 Sobic007G174100--Sobic003G008850 Sobic003G109400 Sobic003G109400 Sobic002G231800--Sobic003G109400 Sobic004G354800 Sobic004G354800 Sobic002G231800--Sobic004G354800 Sobic001G537900 Sobic001G537900 Sobic002G231800--Sobic001G537900 Sobic002G231800--Sobic008G020300 Sobic007G001300 Sobic007G001300 Sobic002G231800--Sobic007G001300 Sobic002G156300 Sobic002G156300 Sobic002G231800--Sobic002G156300 Sobic002G231800--Sobic006G019901 Sobic010G114400 Sobic010G114400 Sobic002G231800--Sobic010G114400 Sobic009G127600 Sobic009G127600 Sobic002G231800--Sobic009G127600 Sobic003G178400 Sobic003G178400 Sobic003G279600--Sobic003G178400 Sobic003G279600--Sobic004G160950 Sobic001G309000 Sobic001G309000 Sobic003G279600--Sobic001G309000 Sobic003G279600--Sobic002G284701 Sobic003G279600--Sobic010G132300 Sobic007G157200 Sobic007G157200 Sobic003G279600--Sobic007G157200 Sobic002G188100 Sobic002G188100 Sobic003G279600--Sobic002G188100 Sobic004G069600 Sobic004G069600 Sobic003G279600--Sobic004G069600 Sobic003G279600--Sobic001G212701 Sobic008G020300--Sobic001G537900 Sobic003G105300 Sobic003G105300 Sobic008G020300--Sobic003G105300 Sobic001G407000 Sobic001G407000 Sobic008G020300--Sobic001G407000 Sobic008G020300--Sobic003G109400 Sobic001G255700 Sobic001G255700 Sobic008G020300--Sobic001G255700 Sobic009G163500 Sobic009G163500 Sobic008G020300--Sobic009G163500 Sobic004G197300 Sobic004G197300 Sobic008G020300--Sobic004G197300 Sobic008G020300--Sobic004G354800 Sobic008G020300--Sobic007G001300 Sobic001G145300 Sobic001G145300 Sobic002G284701--Sobic001G145300 Sobic003G119266 Sobic003G119266 Sobic002G284701--Sobic003G119266 Sobic004G279150 Sobic004G279150 Sobic002G284701--Sobic004G279150 Sobic002G284701--Sobic004G160950 Sobic002G284701--Sobic003G279600 Sobic009G053201 Sobic009G053201 Sobic002G284701--Sobic009G053201 Sobic002G284701--Sobic010G132300 Sobic010G045300 Sobic010G045300 Sobic002G284701--Sobic010G045300 Sobic002G284701--Sobic002G188100 Sobic003G149900--Sobic006G058300 Sobic009G152901 Sobic009G152901 Sobic003G149900--Sobic009G152901 Sobic003G149900--Sobic001G537900 Sobic003G149900--Sobic008G020300 Sobic004G016600 Sobic004G016600 Sobic003G149900--Sobic004G016600 Sobic003G149900--Sobic004G354800 Sobic001G016900 Sobic001G016900 Sobic003G149900--Sobic001G016900 Sobic001G120100 Sobic001G120100 Sobic003G149900--Sobic001G120100 Sobic003G038300 Sobic003G038300 Sobic003G149900--Sobic003G038300 Sobic001G481201 Sobic001G481201 Sobic006G019901--Sobic001G481201 Sobic006G019901--Sobic002G165401 Sobic006G019901--Sobic009G127600 Sobic006G019901--Sobic003G008850 Sobic006G019901--Sobic002G231800 Sobic006G019901--Sobic005G076100 Sobic006G222800 Sobic006G222800 Sobic006G019901--Sobic006G222800 Sobic006G256801 Sobic006G256801 Sobic006G019901--Sobic006G256801 Sobic006G019901--Sobic001G537900 Sobic003G008850--Sobic001G537900 Sobic003G008850--Sobic001G120100 Sobic003G008850--Sobic006G256801 Sobic003G008850--Sobic004G016600 Sobic003G008850--Sobic008G020300 Sobic008G164525 Sobic008G164525 Sobic003G008850--Sobic008G164525 Sobic007G204500 Sobic007G204500 Sobic003G008850--Sobic007G204500 Sobic008G119000 Sobic008G119000 Sobic003G008850--Sobic008G119000 Sobic004G251350 Sobic004G251350 Sobic003G008850--Sobic004G251350
Octagon: transcription factors


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