Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G279600.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6Q5S3
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G178400 - -
2 Sobic.004G160950 - -
3 Sobic.001G309000 glycosyl hydrolases family 16, putative, expressed K08235: xyloglucan:xyloglucosyl transferase
4 Sobic.002G284701 - -
5 Sobic.010G132300 CDK5RAP3, putative, expressed -
6 Sobic.007G157200 - -
7 Sobic.002G188100 - -
8 Sobic.004G069600 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed -
9 Sobic.001G212701 - -
10 Sobic.003G119266 - -
11 Sobic.010G097800 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@expressed protein -
12 Sobic.010G045300 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during salt-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@expressed protein -
13 Sobic.010G055600 ThiF family domain containing protein, putative, expressed K11996: MOCS3, adenylyltransferase and sulfurtransferase
14 Sobic.006G019901 - -
15 Sobic.009G053201 - -
16 Sobic.006G167200 ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase, family 1, putative, expressed -
17 Sobic.010G040000 expressed protein -
18 Sobic.004G279150 - -
19 Sobic.007G174100 carrier, putative, expressed -
20 Sobic.006G133650 - -


Gene co-expression network
sample Sobic003G279600 Sobic003G279600 Sobic003G178400 Sobic003G178400 Sobic003G279600--Sobic003G178400 Sobic004G160950 Sobic004G160950 Sobic003G279600--Sobic004G160950 Sobic001G309000 Sobic001G309000 Sobic003G279600--Sobic001G309000 Sobic002G284701 Sobic002G284701 Sobic003G279600--Sobic002G284701 Sobic010G132300 Sobic010G132300 Sobic003G279600--Sobic010G132300 Sobic007G157200 Sobic007G157200 Sobic003G279600--Sobic007G157200 Sobic002G188100 Sobic002G188100 Sobic003G279600--Sobic002G188100 Sobic004G069600 Sobic004G069600 Sobic003G279600--Sobic004G069600 Sobic001G212701 Sobic001G212701 Sobic003G279600--Sobic001G212701 Sobic003G178400--Sobic003G279600 Sobic003G178400--Sobic004G160950 Sobic003G119266 Sobic003G119266 Sobic003G178400--Sobic003G119266 Sobic003G178400--Sobic002G188100 Sobic003G178400--Sobic004G069600 Sobic002G234900 Sobic002G234900 Sobic003G178400--Sobic002G234900 Sobic006G167200 Sobic006G167200 Sobic003G178400--Sobic006G167200 Sobic003G178400--Sobic001G309000 Sobic006G133650 Sobic006G133650 Sobic003G178400--Sobic006G133650 Sobic004G160950--Sobic010G132300 Sobic007G174100 Sobic007G174100 Sobic004G160950--Sobic007G174100 Sobic002G231800 Sobic002G231800 Sobic004G160950--Sobic002G231800 Sobic004G160950--Sobic003G279600 Sobic008G020300 Sobic008G020300 Sobic004G160950--Sobic008G020300 Sobic004G160950--Sobic002G284701 Sobic003G149900 Sobic003G149900 Sobic004G160950--Sobic003G149900 Sobic006G019901 Sobic006G019901 Sobic004G160950--Sobic006G019901 Sobic003G008850 Sobic003G008850 Sobic004G160950--Sobic003G008850 Sobic001G309000--Sobic003G279600 Sobic001G309000--Sobic004G160950 Sobic008G096150 Sobic008G096150 Sobic001G309000--Sobic008G096150 Sobic001G309000--Sobic001G212701 Sobic001G309000--Sobic007G174100 Sobic001G309000--Sobic003G178400 Sobic001G309000--Sobic010G132300 Sobic010G055600 Sobic010G055600 Sobic001G309000--Sobic010G055600 Sobic006G110600 Sobic006G110600 Sobic001G309000--Sobic006G110600 Sobic001G145300 Sobic001G145300 Sobic002G284701--Sobic001G145300 Sobic002G284701--Sobic003G119266 Sobic004G279150 Sobic004G279150 Sobic002G284701--Sobic004G279150 Sobic002G284701--Sobic004G160950 Sobic002G284701--Sobic003G279600 Sobic009G053201 Sobic009G053201 Sobic002G284701--Sobic009G053201 Sobic002G284701--Sobic010G132300 Sobic010G045300 Sobic010G045300 Sobic002G284701--Sobic010G045300 Sobic002G284701--Sobic002G188100 Sobic010G132300--Sobic007G174100 Sobic010G132300--Sobic004G160950 Sobic010G155901 Sobic010G155901 Sobic010G132300--Sobic010G155901 Sobic010G132300--Sobic001G212701 Sobic005G076100 Sobic005G076100 Sobic010G132300--Sobic005G076100 Sobic002G114600 Sobic002G114600 Sobic010G132300--Sobic002G114600 Sobic010G132300--Sobic003G008850 Sobic002G373200 Sobic002G373200 Sobic010G132300--Sobic002G373200 Sobic002G165401 Sobic002G165401 Sobic010G132300--Sobic002G165401 Sobic010G097800 Sobic010G097800 Sobic007G157200--Sobic010G097800 Sobic007G157200--Sobic001G212701 Sobic007G157200--Sobic003G279600 Sobic004G184500 Sobic004G184500 Sobic007G157200--Sobic004G184500 Sobic007G157200--Sobic002G114600 Sobic007G157200--Sobic010G132300 Sobic001G176800 Sobic001G176800 Sobic007G157200--Sobic001G176800 Sobic009G184500 Sobic009G184500 Sobic007G157200--Sobic009G184500 Sobic002G018133 Sobic002G018133 Sobic007G157200--Sobic002G018133 Sobic002G188100--Sobic006G133650 Sobic002G188100--Sobic010G045300 Sobic002G188100--Sobic006G167200 Sobic009G039400 Sobic009G039400 Sobic002G188100--Sobic009G039400 Sobic010G040000 Sobic010G040000 Sobic002G188100--Sobic010G040000 Sobic010G029200 Sobic010G029200 Sobic002G188100--Sobic010G029200 Sobic002G188100--Sobic004G069600 Sobic010G122533 Sobic010G122533 Sobic002G188100--Sobic010G122533 Sobic003G081400 Sobic003G081400 Sobic002G188100--Sobic003G081400 Sobic004G069600--Sobic010G029200 Sobic004G069600--Sobic009G039400 Sobic004G069600--Sobic006G133650 Sobic004G069600--Sobic010G045300 Sobic004G069600--Sobic002G188100 Sobic010G208300 Sobic010G208300 Sobic004G069600--Sobic010G208300 Sobic003G142900 Sobic003G142900 Sobic004G069600--Sobic003G142900 Sobic010G068300 Sobic010G068300 Sobic004G069600--Sobic010G068300 Sobic004G069600--Sobic006G167200 Sobic001G212701--Sobic007G157200 Sobic001G212701--Sobic002G114600 Sobic001G212701--Sobic010G132300 Sobic001G212701--Sobic004G184500 Sobic004G314750 Sobic004G314750 Sobic001G212701--Sobic004G314750 Sobic001G212701--Sobic007G174100 Sobic002G326200 Sobic002G326200 Sobic001G212701--Sobic002G326200 Sobic001G212701--Sobic001G176800 Sobic005G094500 Sobic005G094500 Sobic001G212701--Sobic005G094500
Octagon: transcription factors


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