Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G040000.1
Synonym Sb10g003545
Functional annotation expressed protein
UniProt C5Z4A4
Pfam -
Panther DB PTHR36801 PTHR36801:SF1
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os06g05730.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a028070 , Zm00025a050015 , Zm00025a041544
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G188100 - -
2 Sobic.006G167200 ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase, family 1, putative, expressed -
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16 Sobic.001G261440 - -
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18 Sobic.003G279600 - -
19 Sobic.005G022600 PME/invertase inhibitor, putative, expressed -
20 Sobic.008G088863 - -


Gene co-expression network
sample Sobic010G040000 Sobic010G040000 Sobic002G188100 Sobic002G188100 Sobic010G040000--Sobic002G188100 Sobic006G167200 Sobic006G167200 Sobic010G040000--Sobic006G167200 Sobic009G039400 Sobic009G039400 Sobic010G040000--Sobic009G039400 Sobic006G178700 Sobic006G178700 Sobic010G040000--Sobic006G178700 Sobic006G133650 Sobic006G133650 Sobic010G040000--Sobic006G133650 Sobic006G019901 Sobic006G019901 Sobic010G040000--Sobic006G019901 Sobic010G045300 Sobic010G045300 Sobic010G040000--Sobic010G045300 Sobic002G231800 Sobic002G231800 Sobic010G040000--Sobic002G231800 Sobic003G081400 Sobic003G081400 Sobic010G040000--Sobic003G081400 Sobic002G188100--Sobic006G133650 Sobic002G188100--Sobic010G045300 Sobic002G188100--Sobic006G167200 Sobic002G188100--Sobic009G039400 Sobic002G188100--Sobic010G040000 Sobic010G029200 Sobic010G029200 Sobic002G188100--Sobic010G029200 Sobic004G069600 Sobic004G069600 Sobic002G188100--Sobic004G069600 Sobic010G122533 Sobic010G122533 Sobic002G188100--Sobic010G122533 Sobic002G188100--Sobic003G081400 Sobic006G167200--Sobic010G122533 Sobic006G167200--Sobic002G188100 Sobic006G167200--Sobic009G039400 Sobic006G167200--Sobic006G133650 Sobic006G167200--Sobic003G081400 Sobic001G261440 Sobic001G261440 Sobic006G167200--Sobic001G261440 Sobic006G172651 Sobic006G172651 Sobic006G167200--Sobic006G172651 Sobic006G167200--Sobic010G045300 Sobic009G127600 Sobic009G127600 Sobic006G167200--Sobic009G127600 Sobic010G208300 Sobic010G208300 Sobic009G039400--Sobic010G208300 Sobic009G039400--Sobic010G029200 Sobic009G039400--Sobic006G133650 Sobic009G039400--Sobic010G045300 Sobic009G039400--Sobic003G081400 Sobic009G039400--Sobic004G069600 Sobic009G039400--Sobic002G188100 Sobic009G039400--Sobic006G167200 Sobic010G068300 Sobic010G068300 Sobic009G039400--Sobic010G068300 Sobic006G178700--Sobic010G040000 Sobic001G000900 Sobic001G000900 Sobic006G178700--Sobic001G000900 Sobic004G279150 Sobic004G279150 Sobic006G178700--Sobic004G279150 Sobic010G114500 Sobic010G114500 Sobic006G178700--Sobic010G114500 Sobic006G178700--Sobic006G167200 Sobic008G088863 Sobic008G088863 Sobic006G178700--Sobic008G088863 Sobic006G178700--Sobic009G127600 Sobic006G178700--Sobic002G188100 Sobic003G294000 Sobic003G294000 Sobic006G178700--Sobic003G294000 Sobic006G133650--Sobic009G039400 Sobic006G133650--Sobic002G188100 Sobic006G133650--Sobic010G029200 Sobic006G133650--Sobic006G167200 Sobic006G133650--Sobic004G069600 Sobic006G133650--Sobic010G208300 Sobic006G133650--Sobic010G045300 Sobic006G133650--Sobic010G122533 Sobic003G142900 Sobic003G142900 Sobic006G133650--Sobic003G142900 Sobic001G481201 Sobic001G481201 Sobic006G019901--Sobic001G481201 Sobic002G165401 Sobic002G165401 Sobic006G019901--Sobic002G165401 Sobic006G019901--Sobic009G127600 Sobic003G008850 Sobic003G008850 Sobic006G019901--Sobic003G008850 Sobic006G019901--Sobic002G231800 Sobic005G076100 Sobic005G076100 Sobic006G019901--Sobic005G076100 Sobic006G222800 Sobic006G222800 Sobic006G019901--Sobic006G222800 Sobic006G256801 Sobic006G256801 Sobic006G019901--Sobic006G256801 Sobic001G537900 Sobic001G537900 Sobic006G019901--Sobic001G537900 Sobic010G045300--Sobic010G029200 Sobic010G045300--Sobic009G039400 Sobic010G045300--Sobic010G068300 Sobic010G045300--Sobic002G188100 Sobic010G045300--Sobic004G069600 Sobic005G022600 Sobic005G022600 Sobic010G045300--Sobic005G022600 Sobic010G045300--Sobic003G081400 Sobic010G045300--Sobic010G208300 Sobic010G045300--Sobic006G133650 Sobic003G109400 Sobic003G109400 Sobic002G231800--Sobic003G109400 Sobic004G354800 Sobic004G354800 Sobic002G231800--Sobic004G354800 Sobic002G231800--Sobic001G537900 Sobic008G020300 Sobic008G020300 Sobic002G231800--Sobic008G020300 Sobic007G001300 Sobic007G001300 Sobic002G231800--Sobic007G001300 Sobic002G156300 Sobic002G156300 Sobic002G231800--Sobic002G156300 Sobic002G231800--Sobic006G019901 Sobic010G114400 Sobic010G114400 Sobic002G231800--Sobic010G114400 Sobic002G231800--Sobic009G127600 Sobic003G081400--Sobic009G039400 Sobic003G201400 Sobic003G201400 Sobic003G081400--Sobic003G201400 Sobic003G081400--Sobic006G167200 Sobic003G081400--Sobic010G045300 Sobic003G081400--Sobic010G208300 Sobic003G081400--Sobic005G022600 Sobic003G081400--Sobic010G029200 Sobic003G081400--Sobic010G068300 Sobic008G031600 Sobic008G031600 Sobic003G081400--Sobic008G031600
Octagon: transcription factors


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