Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G178700.1
Synonym Sb06g025330
Functional annotation expressed protein
UniProt C5YDZ1
Pfam PF07762
Panther DB PTHR33074 PTHR33074:SF10
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g08010.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G040000 expressed protein -
2 Sobic.001G000900 expressed protein -
3 Sobic.004G279150 - -
4 Sobic.010G114500 tetraspanin family protein, putative, expressed -
5 Sobic.006G167200 ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase, family 1, putative, expressed -
6 Sobic.008G088863 - -
7 Sobic.009G127600 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@tetratricopeptide-like helical, putative, expressed -
8 Sobic.002G188100 - -
9 Sobic.003G294000 protein kinase domain containing protein, expressed -
10 Sobic.003G081400 Ser/Thr protein kinase, putative, expressed -
11 Sobic.009G039400 jacalin-like lectin domain containing protein, expressed -
12 Sobic.001G422800 aspartic proteinase nepenthesin precursor, putative, expressed -
13 Sobic.006G019901 - -
14 Sobic.001G481201 - -
15 Sobic.010G208300 two-component response regulator, putative, expressed K14491: two-component response regulator ARR-B family
16 Sobic.010G045300 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during salt-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@expressed protein -
17 Sobic.001G145300 - -
18 Sobic.009G031100 cycloeucalenol cycloisomerase, putative, expressed K08246: cycloeucalenol cycloisomerase
19 Sobic.010G029200 OsMADS75 - MADS-box family gene with M-alpha type-box, expressed -
20 Sobic.010G068300 UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic006G178700 Sobic006G178700 Sobic010G040000 Sobic010G040000 Sobic006G178700--Sobic010G040000 Sobic001G000900 Sobic001G000900 Sobic006G178700--Sobic001G000900 Sobic004G279150 Sobic004G279150 Sobic006G178700--Sobic004G279150 Sobic010G114500 Sobic010G114500 Sobic006G178700--Sobic010G114500 Sobic006G167200 Sobic006G167200 Sobic006G178700--Sobic006G167200 Sobic008G088863 Sobic008G088863 Sobic006G178700--Sobic008G088863 Sobic009G127600 Sobic009G127600 Sobic006G178700--Sobic009G127600 Sobic002G188100 Sobic002G188100 Sobic006G178700--Sobic002G188100 Sobic003G294000 Sobic003G294000 Sobic006G178700--Sobic003G294000 Sobic010G040000--Sobic002G188100 Sobic010G040000--Sobic006G167200 Sobic009G039400 Sobic009G039400 Sobic010G040000--Sobic009G039400 Sobic010G040000--Sobic006G178700 Sobic006G133650 Sobic006G133650 Sobic010G040000--Sobic006G133650 Sobic006G019901 Sobic006G019901 Sobic010G040000--Sobic006G019901 Sobic010G045300 Sobic010G045300 Sobic010G040000--Sobic010G045300 Sobic002G231800 Sobic002G231800 Sobic010G040000--Sobic002G231800 Sobic003G081400 Sobic003G081400 Sobic010G040000--Sobic003G081400 Sobic008G098098 Sobic008G098098 Sobic001G000900--Sobic008G098098 Sobic008G119200 Sobic008G119200 Sobic001G000900--Sobic008G119200 Sobic010G029200 Sobic010G029200 Sobic001G000900--Sobic010G029200 Sobic003G142900 Sobic003G142900 Sobic001G000900--Sobic003G142900 Sobic001G000900--Sobic010G040000 Sobic001G000900--Sobic009G039400 Sobic010G208300 Sobic010G208300 Sobic001G000900--Sobic010G208300 Sobic001G000900--Sobic002G188100 Sobic001G000900--Sobic006G133650 Sobic004G279150--Sobic009G127600 Sobic001G145300 Sobic001G145300 Sobic004G279150--Sobic001G145300 Sobic001G422800 Sobic001G422800 Sobic004G279150--Sobic001G422800 Sobic009G094000 Sobic009G094000 Sobic004G279150--Sobic009G094000 Sobic004G279150--Sobic006G167200 Sobic002G284701 Sobic002G284701 Sobic004G279150--Sobic002G284701 Sobic004G279150--Sobic006G019901 Sobic004G279150--Sobic008G088863 Sobic002G165401 Sobic002G165401 Sobic004G279150--Sobic002G165401 Sobic009G031100 Sobic009G031100 Sobic010G114500--Sobic009G031100 Sobic007G001300 Sobic007G001300 Sobic010G114500--Sobic007G001300 Sobic002G156300 Sobic002G156300 Sobic010G114500--Sobic002G156300 Sobic003G109400 Sobic003G109400 Sobic010G114500--Sobic003G109400 Sobic010G224800 Sobic010G224800 Sobic010G114500--Sobic010G224800 Sobic010G114400 Sobic010G114400 Sobic010G114500--Sobic010G114400 Sobic003G105300 Sobic003G105300 Sobic010G114500--Sobic003G105300 Sobic004G197300 Sobic004G197300 Sobic010G114500--Sobic004G197300 Sobic009G163500 Sobic009G163500 Sobic010G114500--Sobic009G163500 Sobic010G122533 Sobic010G122533 Sobic006G167200--Sobic010G122533 Sobic006G167200--Sobic002G188100 Sobic006G167200--Sobic009G039400 Sobic006G167200--Sobic006G133650 Sobic006G167200--Sobic003G081400 Sobic001G261440 Sobic001G261440 Sobic006G167200--Sobic001G261440 Sobic006G172651 Sobic006G172651 Sobic006G167200--Sobic006G172651 Sobic006G167200--Sobic010G045300 Sobic006G167200--Sobic009G127600 Sobic008G088863--Sobic001G422800 Sobic008G088863--Sobic001G145300 Sobic001G084500 Sobic001G084500 Sobic008G088863--Sobic001G084500 Sobic008G088863--Sobic006G172651 Sobic008G088863--Sobic009G127600 Sobic008G088863--Sobic001G261440 Sobic008G088863--Sobic002G156300 Sobic008G088863--Sobic004G279150 Sobic008G088863--Sobic007G001300 Sobic009G127600--Sobic001G145300 Sobic009G127600--Sobic002G156300 Sobic009G127600--Sobic004G279150 Sobic001G481201 Sobic001G481201 Sobic009G127600--Sobic001G481201 Sobic009G127600--Sobic010G114400 Sobic003G008850 Sobic003G008850 Sobic009G127600--Sobic003G008850 Sobic009G127600--Sobic006G019901 Sobic009G127600--Sobic007G001300 Sobic009G127600--Sobic003G109400 Sobic002G188100--Sobic006G133650 Sobic002G188100--Sobic010G045300 Sobic002G188100--Sobic006G167200 Sobic002G188100--Sobic009G039400 Sobic002G188100--Sobic010G040000 Sobic002G188100--Sobic010G029200 Sobic004G069600 Sobic004G069600 Sobic002G188100--Sobic004G069600 Sobic002G188100--Sobic010G122533 Sobic002G188100--Sobic003G081400 Sobic003G294000--Sobic004G279150 Sobic002G245600 Sobic002G245600 Sobic003G294000--Sobic002G245600 Sobic003G294000--Sobic009G094000 Sobic002G180501 Sobic002G180501 Sobic003G294000--Sobic002G180501 Sobic003G294000--Sobic006G167200 Sobic003G294000--Sobic009G127600 Sobic003G294000--Sobic006G019901 Sobic003G294000--Sobic002G165401 Sobic003G294000--Sobic001G481201
Octagon: transcription factors


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