Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G501500.1
Synonym
Functional annotation DUF584 domain containing protein, putative, expressed
UniProt A0A1B6QQH1
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) Zm00025a053920
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G230500 - -
2 Sobic.005G077532 - -
3 Sobic.006G165900 cyclin, putative, expressed -
4 Sobic.010G009532 - -
5 Sobic.001G163000 hypothetical protein -
6 Sobic.008G152100 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed -
7 Sobic.001G344450 - K02998: RP-SAe, small subunit ribosomal protein SAe
8 Sobic.009G039300 short-chain dehydrogenase/reductase, putative, expressed -
9 Sobic.004G179000 chalcone synthase, putative, expressed -
10 Sobic.001G353700 expressed protein -
11 Sobic.001G180500 expressed protein -
12 Sobic.009G250000 helix-loop-helix DNA-binding protein, putative, expressed -
13 Sobic.009G046500 NBS-LRR disease resistance protein, putative, expressed -
14 Sobic.001G520200 glycosylphosphatidylinositol anchor biosynthesis protein 11, putative, expressed K05287: GPI ethanolamine phosphate transferase 2/3 subunit F
15 Sobic.006G044866 - -
16 Sobic.009G038800 SLD5 - Putative GINS complex subunit, expressed K10735: GINS4, GINS complex subunit 4
17 Sobic.006G181150 - -
18 Sobic.003G385800 - -
19 Sobic.004G047001 - -
20 Sobic.009G247100 OsSCP31 - Putative Serine Carboxypeptidase homologue, expressed K09645: vitellogenic carboxypeptidase-like protein


Gene co-expression network
sample Sobic001G501500 Sobic001G501500 Sobic004G230500 Sobic004G230500 Sobic001G501500--Sobic004G230500 Sobic005G077532 Sobic005G077532 Sobic001G501500--Sobic005G077532 Sobic006G165900 Sobic006G165900 Sobic001G501500--Sobic006G165900 Sobic010G009532 Sobic010G009532 Sobic001G501500--Sobic010G009532 Sobic001G163000 Sobic001G163000 Sobic001G501500--Sobic001G163000 Sobic008G152100 Sobic008G152100 Sobic001G501500--Sobic008G152100 Sobic001G344450 Sobic001G344450 Sobic001G501500--Sobic001G344450 Sobic009G039300 Sobic009G039300 Sobic001G501500--Sobic009G039300 Sobic004G179000 Sobic004G179000 Sobic001G501500--Sobic004G179000 Sobic004G230500--Sobic001G501500 Sobic004G230500--Sobic005G077532 Sobic004G230500--Sobic008G152100 Sobic001G180500 Sobic001G180500 Sobic004G230500--Sobic001G180500 Sobic004G230500--Sobic010G009532 Sobic004G230500--Sobic006G165900 Sobic003G385800 Sobic003G385800 Sobic004G230500--Sobic003G385800 Sobic001G353700 Sobic001G353700 Sobic004G230500--Sobic001G353700 Sobic004G230500--Sobic004G179000 Sobic005G077532--Sobic008G152100 Sobic005G077532--Sobic001G501500 Sobic005G077532--Sobic004G230500 Sobic006G181150 Sobic006G181150 Sobic005G077532--Sobic006G181150 Sobic005G077532--Sobic010G009532 Sobic005G077532--Sobic001G180500 Sobic001G541166 Sobic001G541166 Sobic005G077532--Sobic001G541166 Sobic007G045800 Sobic007G045800 Sobic005G077532--Sobic007G045800 Sobic005G077532--Sobic003G385800 Sobic006G165900--Sobic001G163000 Sobic006G165900--Sobic001G501500 Sobic006G165900--Sobic001G353700 Sobic005G169900 Sobic005G169900 Sobic006G165900--Sobic005G169900 Sobic006G165900--Sobic004G230500 Sobic008G152400 Sobic008G152400 Sobic006G165900--Sobic008G152400 Sobic009G046500 Sobic009G046500 Sobic006G165900--Sobic009G046500 Sobic006G165900--Sobic004G179000 Sobic006G165900--Sobic001G344450 Sobic010G009532--Sobic008G152100 Sobic004G047001 Sobic004G047001 Sobic010G009532--Sobic004G047001 Sobic001G214400 Sobic001G214400 Sobic010G009532--Sobic001G214400 Sobic010G009532--Sobic001G501500 Sobic007G090406 Sobic007G090406 Sobic010G009532--Sobic007G090406 Sobic010G097800 Sobic010G097800 Sobic010G009532--Sobic010G097800 Sobic010G009532--Sobic005G077532 Sobic008G192800 Sobic008G192800 Sobic010G009532--Sobic008G192800 Sobic001G176800 Sobic001G176800 Sobic010G009532--Sobic001G176800 Sobic001G163000--Sobic006G165900 Sobic001G163000--Sobic001G353700 Sobic009G250000 Sobic009G250000 Sobic001G163000--Sobic009G250000 Sobic001G163000--Sobic005G169900 Sobic001G163000--Sobic001G344450 Sobic001G163000--Sobic001G501500 Sobic008G120066 Sobic008G120066 Sobic001G163000--Sobic008G120066 Sobic001G520200 Sobic001G520200 Sobic001G163000--Sobic001G520200 Sobic001G163000--Sobic004G230500 Sobic008G152100--Sobic005G077532 Sobic008G152100--Sobic003G385800 Sobic008G152100--Sobic001G541166 Sobic008G152100--Sobic010G009532 Sobic008G152100--Sobic006G181150 Sobic005G091400 Sobic005G091400 Sobic008G152100--Sobic005G091400 Sobic008G152100--Sobic004G230500 Sobic008G152100--Sobic007G045800 Sobic002G165401 Sobic002G165401 Sobic008G152100--Sobic002G165401 Sobic001G344450--Sobic008G120066 Sobic001G344450--Sobic009G039300 Sobic001G096800 Sobic001G096800 Sobic001G344450--Sobic001G096800 Sobic005G002500 Sobic005G002500 Sobic001G344450--Sobic005G002500 Sobic001G344450--Sobic001G163000 Sobic001G344450--Sobic001G501500 Sobic009G114900 Sobic009G114900 Sobic001G344450--Sobic009G114900 Sobic009G236000 Sobic009G236000 Sobic001G344450--Sobic009G236000 Sobic001G344450--Sobic008G192800 Sobic009G039300--Sobic001G344450 Sobic009G039300--Sobic005G002500 Sobic008G096900 Sobic008G096900 Sobic009G039300--Sobic008G096900 Sobic006G280900 Sobic006G280900 Sobic009G039300--Sobic006G280900 Sobic002G116300 Sobic002G116300 Sobic009G039300--Sobic002G116300 Sobic009G039300--Sobic001G541166 Sobic009G238200 Sobic009G238200 Sobic009G039300--Sobic009G238200 Sobic004G302400 Sobic004G302400 Sobic009G039300--Sobic004G302400 Sobic006G146400 Sobic006G146400 Sobic009G039300--Sobic006G146400 Sobic004G179000--Sobic001G501500 Sobic004G179000--Sobic005G077532 Sobic004G179000--Sobic010G009532 Sobic004G179000--Sobic004G230500 Sobic004G179000--Sobic006G165900 Sobic004G179000--Sobic001G176800 Sobic004G179000--Sobic008G152100 Sobic004G179000--Sobic010G097800 Sobic007G157200 Sobic007G157200 Sobic004G179000--Sobic007G157200
Octagon: transcription factors


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