Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G180500.1
Synonym Sb01g015710
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1B6QJK5
Pfam -
Panther DB PTHR36402
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G49210 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os11g05120.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a013031
Brachypodium KQJ92310
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G077532 - -
2 Sobic.004G230500 - -
3 Sobic.008G152100 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed -
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6 Sobic.009G039400 jacalin-like lectin domain containing protein, expressed -
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8 Sobic.004G132700 ankyrin repeat family protein, putative, expressed -
9 Sobic.004G279150 - -
10 Sobic.003G385800 - -
11 Sobic.010G040000 expressed protein -
12 Sobic.006G133650 - -
13 Sobic.010G009532 - -
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15 Sobic.001G501500 DUF584 domain containing protein, putative, expressed -
16 Sobic.010G208300 two-component response regulator, putative, expressed K14491: two-component response regulator ARR-B family
17 Sobic.003G081400 Ser/Thr protein kinase, putative, expressed -
18 Sobic.004G069600 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed -
19 Sobic.009G151500 cinnamoyl-CoA reductase-related, putative, expressed -
20 Sobic.002G180501 - -


Gene co-expression network
sample Sobic001G180500 Sobic001G180500 Sobic005G077532 Sobic005G077532 Sobic001G180500--Sobic005G077532 Sobic004G230500 Sobic004G230500 Sobic001G180500--Sobic004G230500 Sobic008G152100 Sobic008G152100 Sobic001G180500--Sobic008G152100 Sobic007G045800 Sobic007G045800 Sobic001G180500--Sobic007G045800 Sobic006G167200 Sobic006G167200 Sobic001G180500--Sobic006G167200 Sobic009G039400 Sobic009G039400 Sobic001G180500--Sobic009G039400 Sobic006G019901 Sobic006G019901 Sobic001G180500--Sobic006G019901 Sobic004G132700 Sobic004G132700 Sobic001G180500--Sobic004G132700 Sobic004G279150 Sobic004G279150 Sobic001G180500--Sobic004G279150 Sobic005G077532--Sobic008G152100 Sobic001G501500 Sobic001G501500 Sobic005G077532--Sobic001G501500 Sobic005G077532--Sobic004G230500 Sobic006G181150 Sobic006G181150 Sobic005G077532--Sobic006G181150 Sobic010G009532 Sobic010G009532 Sobic005G077532--Sobic010G009532 Sobic005G077532--Sobic001G180500 Sobic001G541166 Sobic001G541166 Sobic005G077532--Sobic001G541166 Sobic005G077532--Sobic007G045800 Sobic003G385800 Sobic003G385800 Sobic005G077532--Sobic003G385800 Sobic004G230500--Sobic001G501500 Sobic004G230500--Sobic005G077532 Sobic004G230500--Sobic008G152100 Sobic004G230500--Sobic001G180500 Sobic004G230500--Sobic010G009532 Sobic006G165900 Sobic006G165900 Sobic004G230500--Sobic006G165900 Sobic004G230500--Sobic003G385800 Sobic001G353700 Sobic001G353700 Sobic004G230500--Sobic001G353700 Sobic004G179000 Sobic004G179000 Sobic004G230500--Sobic004G179000 Sobic008G152100--Sobic005G077532 Sobic008G152100--Sobic003G385800 Sobic008G152100--Sobic001G541166 Sobic008G152100--Sobic010G009532 Sobic008G152100--Sobic006G181150 Sobic005G091400 Sobic005G091400 Sobic008G152100--Sobic005G091400 Sobic008G152100--Sobic004G230500 Sobic008G152100--Sobic007G045800 Sobic002G165401 Sobic002G165401 Sobic008G152100--Sobic002G165401 Sobic007G045800--Sobic008G152100 Sobic009G151500 Sobic009G151500 Sobic007G045800--Sobic009G151500 Sobic007G045800--Sobic005G077532 Sobic007G045800--Sobic001G180500 Sobic007G045800--Sobic010G009532 Sobic001G214400 Sobic001G214400 Sobic007G045800--Sobic001G214400 Sobic009G031000 Sobic009G031000 Sobic007G045800--Sobic009G031000 Sobic003G294000 Sobic003G294000 Sobic007G045800--Sobic003G294000 Sobic003G235300 Sobic003G235300 Sobic007G045800--Sobic003G235300 Sobic010G122533 Sobic010G122533 Sobic006G167200--Sobic010G122533 Sobic002G188100 Sobic002G188100 Sobic006G167200--Sobic002G188100 Sobic006G167200--Sobic009G039400 Sobic006G133650 Sobic006G133650 Sobic006G167200--Sobic006G133650 Sobic003G081400 Sobic003G081400 Sobic006G167200--Sobic003G081400 Sobic001G261440 Sobic001G261440 Sobic006G167200--Sobic001G261440 Sobic006G172651 Sobic006G172651 Sobic006G167200--Sobic006G172651 Sobic010G045300 Sobic010G045300 Sobic006G167200--Sobic010G045300 Sobic009G127600 Sobic009G127600 Sobic006G167200--Sobic009G127600 Sobic010G208300 Sobic010G208300 Sobic009G039400--Sobic010G208300 Sobic010G029200 Sobic010G029200 Sobic009G039400--Sobic010G029200 Sobic009G039400--Sobic006G133650 Sobic009G039400--Sobic010G045300 Sobic009G039400--Sobic003G081400 Sobic004G069600 Sobic004G069600 Sobic009G039400--Sobic004G069600 Sobic009G039400--Sobic002G188100 Sobic009G039400--Sobic006G167200 Sobic010G068300 Sobic010G068300 Sobic009G039400--Sobic010G068300 Sobic001G481201 Sobic001G481201 Sobic006G019901--Sobic001G481201 Sobic006G019901--Sobic002G165401 Sobic006G019901--Sobic009G127600 Sobic003G008850 Sobic003G008850 Sobic006G019901--Sobic003G008850 Sobic002G231800 Sobic002G231800 Sobic006G019901--Sobic002G231800 Sobic005G076100 Sobic005G076100 Sobic006G019901--Sobic005G076100 Sobic006G222800 Sobic006G222800 Sobic006G019901--Sobic006G222800 Sobic006G256801 Sobic006G256801 Sobic006G019901--Sobic006G256801 Sobic001G537900 Sobic001G537900 Sobic006G019901--Sobic001G537900 Sobic004G132700--Sobic001G180500 Sobic002G121701 Sobic002G121701 Sobic004G132700--Sobic002G121701 Sobic008G065100 Sobic008G065100 Sobic004G132700--Sobic008G065100 Sobic008G144100 Sobic008G144100 Sobic004G132700--Sobic008G144100 Sobic003G265300 Sobic003G265300 Sobic004G132700--Sobic003G265300 Sobic009G236500 Sobic009G236500 Sobic004G132700--Sobic009G236500 Sobic003G337700 Sobic003G337700 Sobic004G132700--Sobic003G337700 Sobic001G391000 Sobic001G391000 Sobic004G132700--Sobic001G391000 Sobic009G184300 Sobic009G184300 Sobic004G132700--Sobic009G184300 Sobic004G279150--Sobic009G127600 Sobic001G145300 Sobic001G145300 Sobic004G279150--Sobic001G145300 Sobic001G422800 Sobic001G422800 Sobic004G279150--Sobic001G422800 Sobic009G094000 Sobic009G094000 Sobic004G279150--Sobic009G094000 Sobic004G279150--Sobic006G167200 Sobic002G284701 Sobic002G284701 Sobic004G279150--Sobic002G284701 Sobic004G279150--Sobic006G019901 Sobic008G088863 Sobic008G088863 Sobic004G279150--Sobic008G088863 Sobic004G279150--Sobic002G165401
Octagon: transcription factors


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