Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G045800.2
Synonym Sb07g003780
Functional annotation serine/threonine-protein kinase receptor precursor, putative, expressed
UniProt A0A1Z5R8K9
Pfam PF08276 PF01453 PF00954 PF00069
Panther DB PTHR27002 PTHR27002:SF49
NCBI CDD KOG1187; Serine/threonine protein kinase
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0006468; protein phosphorylation GO:0005524ATP binding GO:0004672protein kinase activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G19130 : S-locus lectin protein kinase family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g34270.1 : serine/threonine-protein kinase receptor precursor, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a043273 , Zm00025a016057 , Zm00025a030311
Brachypodium KQK04426
Barley HORVU1Hr1G002000.1 , HORVU1Hr1G002000.2 , HORVU2Hr1G088570.11 , HORVU2Hr1G088570.16 , HORVU2Hr1G088570.15 , HORVU2Hr1G121310.1 , HORVU1Hr1G077350.1 , HORVU1Hr1G077350.2 , HORVU2Hr1G121310.2 , HORVU2Hr1G121310.3 , HORVU3Hr1G013390.1
Wheat TraesCS3A02G261700 , TraesCS1D02G443600
Populus PNS91636


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G152100 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed -
2 Sobic.009G151500 cinnamoyl-CoA reductase-related, putative, expressed -
3 Sobic.005G077532 - -
4 Sobic.001G180500 expressed protein -
5 Sobic.010G009532 - -
6 Sobic.001G214400 - -
7 Sobic.009G031000 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@ferroportin1 domain containing protein, expressed -
8 Sobic.003G294000 protein kinase domain containing protein, expressed -
9 Sobic.003G235300 AAA family ATPase, putative, expressed -
10 Sobic.002G180501 - -
11 Sobic.004G279150 - -
12 Sobic.006G181150 - -
13 Sobic.004G230500 - -
14 Sobic.006G019901 - -
15 Sobic.004G007032 - -
16 Sobic.002G331200 - -
17 Sobic.008G173700 cyclic nucleotide-gated ion channel, putative, expressed K05391: cyclic nucleotide gated channel, plant
18 Sobic.004G001900 expressed protein -
19 Sobic.002G165401 - -
20 Sobic.009G094000 - -


Gene co-expression network
sample Sobic007G045800 Sobic007G045800 Sobic008G152100 Sobic008G152100 Sobic007G045800--Sobic008G152100 Sobic009G151500 Sobic009G151500 Sobic007G045800--Sobic009G151500 Sobic005G077532 Sobic005G077532 Sobic007G045800--Sobic005G077532 Sobic001G180500 Sobic001G180500 Sobic007G045800--Sobic001G180500 Sobic010G009532 Sobic010G009532 Sobic007G045800--Sobic010G009532 Sobic001G214400 Sobic001G214400 Sobic007G045800--Sobic001G214400 Sobic009G031000 Sobic009G031000 Sobic007G045800--Sobic009G031000 Sobic003G294000 Sobic003G294000 Sobic007G045800--Sobic003G294000 Sobic003G235300 Sobic003G235300 Sobic007G045800--Sobic003G235300 Sobic008G152100--Sobic005G077532 Sobic003G385800 Sobic003G385800 Sobic008G152100--Sobic003G385800 Sobic001G541166 Sobic001G541166 Sobic008G152100--Sobic001G541166 Sobic008G152100--Sobic010G009532 Sobic006G181150 Sobic006G181150 Sobic008G152100--Sobic006G181150 Sobic005G091400 Sobic005G091400 Sobic008G152100--Sobic005G091400 Sobic004G230500 Sobic004G230500 Sobic008G152100--Sobic004G230500 Sobic008G152100--Sobic007G045800 Sobic002G165401 Sobic002G165401 Sobic008G152100--Sobic002G165401 Sobic009G151500--Sobic001G214400 Sobic004G310000 Sobic004G310000 Sobic009G151500--Sobic004G310000 Sobic002G331200 Sobic002G331200 Sobic009G151500--Sobic002G331200 Sobic004G279150 Sobic004G279150 Sobic009G151500--Sobic004G279150 Sobic009G151500--Sobic007G045800 Sobic009G094000 Sobic009G094000 Sobic009G151500--Sobic009G094000 Sobic009G151500--Sobic003G294000 Sobic007G157200 Sobic007G157200 Sobic009G151500--Sobic007G157200 Sobic010G059900 Sobic010G059900 Sobic009G151500--Sobic010G059900 Sobic005G077532--Sobic008G152100 Sobic001G501500 Sobic001G501500 Sobic005G077532--Sobic001G501500 Sobic005G077532--Sobic004G230500 Sobic005G077532--Sobic006G181150 Sobic005G077532--Sobic010G009532 Sobic005G077532--Sobic001G180500 Sobic005G077532--Sobic001G541166 Sobic005G077532--Sobic007G045800 Sobic005G077532--Sobic003G385800 Sobic001G180500--Sobic005G077532 Sobic001G180500--Sobic004G230500 Sobic001G180500--Sobic008G152100 Sobic001G180500--Sobic007G045800 Sobic006G167200 Sobic006G167200 Sobic001G180500--Sobic006G167200 Sobic009G039400 Sobic009G039400 Sobic001G180500--Sobic009G039400 Sobic006G019901 Sobic006G019901 Sobic001G180500--Sobic006G019901 Sobic004G132700 Sobic004G132700 Sobic001G180500--Sobic004G132700 Sobic001G180500--Sobic004G279150 Sobic010G009532--Sobic008G152100 Sobic004G047001 Sobic004G047001 Sobic010G009532--Sobic004G047001 Sobic010G009532--Sobic001G214400 Sobic010G009532--Sobic001G501500 Sobic007G090406 Sobic007G090406 Sobic010G009532--Sobic007G090406 Sobic010G097800 Sobic010G097800 Sobic010G009532--Sobic010G097800 Sobic010G009532--Sobic005G077532 Sobic008G192800 Sobic008G192800 Sobic010G009532--Sobic008G192800 Sobic001G176800 Sobic001G176800 Sobic010G009532--Sobic001G176800 Sobic001G214400--Sobic009G151500 Sobic001G214400--Sobic002G331200 Sobic010G001700 Sobic010G001700 Sobic001G214400--Sobic010G001700 Sobic002G138200 Sobic002G138200 Sobic001G214400--Sobic002G138200 Sobic004G200000 Sobic004G200000 Sobic001G214400--Sobic004G200000 Sobic002G284300 Sobic002G284300 Sobic001G214400--Sobic002G284300 Sobic001G214400--Sobic010G009532 Sobic003G043650 Sobic003G043650 Sobic001G214400--Sobic003G043650 Sobic002G018133 Sobic002G018133 Sobic001G214400--Sobic002G018133 Sobic004G007032 Sobic004G007032 Sobic009G031000--Sobic004G007032 Sobic009G031000--Sobic007G045800 Sobic009G031000--Sobic003G235300 Sobic002G121701 Sobic002G121701 Sobic009G031000--Sobic002G121701 Sobic003G265300 Sobic003G265300 Sobic009G031000--Sobic003G265300 Sobic002G120250 Sobic002G120250 Sobic009G031000--Sobic002G120250 Sobic003G337700 Sobic003G337700 Sobic009G031000--Sobic003G337700 Sobic009G031000--Sobic001G180500 Sobic010G208300 Sobic010G208300 Sobic009G031000--Sobic010G208300 Sobic003G294000--Sobic004G279150 Sobic002G245600 Sobic002G245600 Sobic003G294000--Sobic002G245600 Sobic003G294000--Sobic009G094000 Sobic002G180501 Sobic002G180501 Sobic003G294000--Sobic002G180501 Sobic003G294000--Sobic006G167200 Sobic009G127600 Sobic009G127600 Sobic003G294000--Sobic009G127600 Sobic003G294000--Sobic006G019901 Sobic003G294000--Sobic002G165401 Sobic001G481201 Sobic001G481201 Sobic003G294000--Sobic001G481201 Sobic003G235300--Sobic009G031000 Sobic003G235300--Sobic007G045800 Sobic003G235300--Sobic001G180500 Sobic003G235300--Sobic005G077532 Sobic009G236500 Sobic009G236500 Sobic003G235300--Sobic009G236500 Sobic003G235300--Sobic010G208300 Sobic003G235300--Sobic002G180501 Sobic003G235300--Sobic003G294000 Sobic003G235300--Sobic009G039400
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.