Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G165900.1
Synonym 1, Sb06g024180, CYCP4
Functional annotation cyclin, putative, expressed
UniProt Q9XE88 , C5YD35
Pfam PF08613
Panther DB PTHR15615 PTHR15615:SF18
NCBI CDD KOG1674; Cyclin
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0000079; regulation of cyclin-dependent protein serine/threonine kinase activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G44740 : cyclin p4;1
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g46000.1 : cyclin, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a010372 , Zm00025a020917 , Zm00025a003400
Brachypodium PNT69162 , KQK00569 , KQJ83882 , KQJ93063
Barley HORVU1Hr1G055470.8 , HORVU1Hr1G055470.4 , HORVU1Hr1G055470.5 , HORVU1Hr1G055470.6 , HORVU1Hr1G055470.7 , HORVU1Hr1G055470.1 , HORVU1Hr1G055470.2 , HORVU1Hr1G055470.3 , HORVU2Hr1G093210.1 , HORVU2Hr1G093210.3 , HORVU2Hr1G093210.2 , HORVU2Hr1G093210.5 , HORVU2Hr1G093210.4 , HORVU2Hr1G093210.7 , HORVU2Hr1G093210.6 , HORVU2Hr1G093210.8 , HORVU6Hr1G061870.1 , HORVU6Hr1G061870.3 , HORVU6Hr1G014420.2 , HORVU6Hr1G014420.1
Wheat TraesCS1D02G218800 , TraesCS1A02G217000 , TraesCS6B02G282600 , TraesCS6A02G241800 , TraesCS2D02G389800 , TraesCS2A02G391500 , TraesCS1B02G230100 , TraesCS6D02G223800 , TraesCS6A02G083300 , TraesCS6B02G113800
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Gene co-expression network
sample Sobic006G165900 Sobic006G165900 Sobic001G163000 Sobic001G163000 Sobic006G165900--Sobic001G163000 Sobic001G501500 Sobic001G501500 Sobic006G165900--Sobic001G501500 Sobic001G353700 Sobic001G353700 Sobic006G165900--Sobic001G353700 Sobic005G169900 Sobic005G169900 Sobic006G165900--Sobic005G169900 Sobic004G230500 Sobic004G230500 Sobic006G165900--Sobic004G230500 Sobic008G152400 Sobic008G152400 Sobic006G165900--Sobic008G152400 Sobic009G046500 Sobic009G046500 Sobic006G165900--Sobic009G046500 Sobic004G179000 Sobic004G179000 Sobic006G165900--Sobic004G179000 Sobic001G344450 Sobic001G344450 Sobic006G165900--Sobic001G344450 Sobic001G163000--Sobic006G165900 Sobic001G163000--Sobic001G353700 Sobic009G250000 Sobic009G250000 Sobic001G163000--Sobic009G250000 Sobic001G163000--Sobic005G169900 Sobic001G163000--Sobic001G344450 Sobic001G163000--Sobic001G501500 Sobic008G120066 Sobic008G120066 Sobic001G163000--Sobic008G120066 Sobic001G520200 Sobic001G520200 Sobic001G163000--Sobic001G520200 Sobic001G163000--Sobic004G230500 Sobic001G501500--Sobic004G230500 Sobic005G077532 Sobic005G077532 Sobic001G501500--Sobic005G077532 Sobic001G501500--Sobic006G165900 Sobic010G009532 Sobic010G009532 Sobic001G501500--Sobic010G009532 Sobic001G501500--Sobic001G163000 Sobic008G152100 Sobic008G152100 Sobic001G501500--Sobic008G152100 Sobic001G501500--Sobic001G344450 Sobic009G039300 Sobic009G039300 Sobic001G501500--Sobic009G039300 Sobic001G501500--Sobic004G179000 Sobic001G353700--Sobic001G163000 Sobic006G044866 Sobic006G044866 Sobic001G353700--Sobic006G044866 Sobic001G353700--Sobic006G165900 Sobic007G114401 Sobic007G114401 Sobic001G353700--Sobic007G114401 Sobic001G353700--Sobic001G501500 Sobic001G353700--Sobic004G230500 Sobic003G159000 Sobic003G159000 Sobic001G353700--Sobic003G159000 Sobic009G247100 Sobic009G247100 Sobic001G353700--Sobic009G247100 Sobic001G353700--Sobic005G169900 Sobic005G169900--Sobic009G250000 Sobic001G124500 Sobic001G124500 Sobic005G169900--Sobic001G124500 Sobic005G169900--Sobic001G163000 Sobic003G194900 Sobic003G194900 Sobic005G169900--Sobic003G194900 Sobic002G038200 Sobic002G038200 Sobic005G169900--Sobic002G038200 Sobic006G142700 Sobic006G142700 Sobic005G169900--Sobic006G142700 Sobic008G013700 Sobic008G013700 Sobic005G169900--Sobic008G013700 Sobic010G150000 Sobic010G150000 Sobic005G169900--Sobic010G150000 Sobic005G169900--Sobic003G159000 Sobic004G230500--Sobic001G501500 Sobic004G230500--Sobic005G077532 Sobic004G230500--Sobic008G152100 Sobic001G180500 Sobic001G180500 Sobic004G230500--Sobic001G180500 Sobic004G230500--Sobic010G009532 Sobic004G230500--Sobic006G165900 Sobic003G385800 Sobic003G385800 Sobic004G230500--Sobic003G385800 Sobic004G230500--Sobic001G353700 Sobic004G230500--Sobic004G179000 Sobic008G152400--Sobic006G165900 Sobic004G167600 Sobic004G167600 Sobic008G152400--Sobic004G167600 Sobic008G152400--Sobic005G169900 Sobic008G152400--Sobic007G114401 Sobic004G125701 Sobic004G125701 Sobic008G152400--Sobic004G125701 Sobic001G517900 Sobic001G517900 Sobic008G152400--Sobic001G517900 Sobic002G275400 Sobic002G275400 Sobic008G152400--Sobic002G275400 Sobic003G137300 Sobic003G137300 Sobic008G152400--Sobic003G137300 Sobic004G224400 Sobic004G224400 Sobic008G152400--Sobic004G224400 Sobic002G013600 Sobic002G013600 Sobic009G046500--Sobic002G013600 Sobic009G046500--Sobic006G165900 Sobic003G139100 Sobic003G139100 Sobic009G046500--Sobic003G139100 Sobic009G046500--Sobic001G501500 Sobic009G046500--Sobic001G344450 Sobic004G224100 Sobic004G224100 Sobic009G046500--Sobic004G224100 Sobic009G046500--Sobic001G163000 Sobic009G046500--Sobic001G353700 Sobic009G046500--Sobic008G120066 Sobic004G179000--Sobic001G501500 Sobic004G179000--Sobic005G077532 Sobic004G179000--Sobic010G009532 Sobic004G179000--Sobic004G230500 Sobic004G179000--Sobic006G165900 Sobic001G176800 Sobic001G176800 Sobic004G179000--Sobic001G176800 Sobic004G179000--Sobic008G152100 Sobic010G097800 Sobic010G097800 Sobic004G179000--Sobic010G097800 Sobic007G157200 Sobic007G157200 Sobic004G179000--Sobic007G157200 Sobic001G344450--Sobic008G120066 Sobic001G344450--Sobic009G039300 Sobic001G096800 Sobic001G096800 Sobic001G344450--Sobic001G096800 Sobic005G002500 Sobic005G002500 Sobic001G344450--Sobic005G002500 Sobic001G344450--Sobic001G163000 Sobic001G344450--Sobic001G501500 Sobic009G114900 Sobic009G114900 Sobic001G344450--Sobic009G114900 Sobic009G236000 Sobic009G236000 Sobic001G344450--Sobic009G236000 Sobic008G192800 Sobic008G192800 Sobic001G344450--Sobic008G192800
Octagon: transcription factors


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