Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G353700.1,Sobic.001G353700.3,Sobic.001G353700.2
Synonym Sb01g033850
Functional annotation expressed protein
UniProt C5WYJ8 , A0A1Z5S988
Pfam -
Panther DB PTHR23155 PTHR23155:SF509
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G14460 : LRR and NB-ARC domains-containing disease resistance protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os10g04540.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium KQK17422 , PNT75543 , KQJ81491
Barley -
Wheat TraesCS4B02G294600
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G163000 hypothetical protein -
2 Sobic.006G044866 - -
3 Sobic.006G165900 cyclin, putative, expressed -
4 Sobic.007G114401 - -
5 Sobic.001G501500 DUF584 domain containing protein, putative, expressed -
6 Sobic.004G230500 - -
7 Sobic.003G159000 - -
8 Sobic.009G247100 OsSCP31 - Putative Serine Carboxypeptidase homologue, expressed K09645: vitellogenic carboxypeptidase-like protein
9 Sobic.005G169900 CDK5RAP1, putative, expressed -
10 Sobic.003G123500 - -
11 Sobic.009G046500 NBS-LRR disease resistance protein, putative, expressed -
12 Sobic.001G344450 - K02998: RP-SAe, small subunit ribosomal protein SAe
13 Sobic.009G250000 helix-loop-helix DNA-binding protein, putative, expressed -
14 Sobic.008G120066 - -
15 Sobic.007G085966 - -
16 Sobic.001G520200 glycosylphosphatidylinositol anchor biosynthesis protein 11, putative, expressed K05287: GPI ethanolamine phosphate transferase 2/3 subunit F
17 Sobic.008G152400 H-BTB9 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with H family conserved sequence, expressed -
18 Sobic.003G139100 - -
19 Sobic.010G009532 - -
20 Sobic.003G068700 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic001G353700 Sobic001G353700 Sobic001G163000 Sobic001G163000 Sobic001G353700--Sobic001G163000 Sobic006G044866 Sobic006G044866 Sobic001G353700--Sobic006G044866 Sobic006G165900 Sobic006G165900 Sobic001G353700--Sobic006G165900 Sobic007G114401 Sobic007G114401 Sobic001G353700--Sobic007G114401 Sobic001G501500 Sobic001G501500 Sobic001G353700--Sobic001G501500 Sobic004G230500 Sobic004G230500 Sobic001G353700--Sobic004G230500 Sobic003G159000 Sobic003G159000 Sobic001G353700--Sobic003G159000 Sobic009G247100 Sobic009G247100 Sobic001G353700--Sobic009G247100 Sobic005G169900 Sobic005G169900 Sobic001G353700--Sobic005G169900 Sobic001G163000--Sobic006G165900 Sobic001G163000--Sobic001G353700 Sobic009G250000 Sobic009G250000 Sobic001G163000--Sobic009G250000 Sobic001G163000--Sobic005G169900 Sobic001G344450 Sobic001G344450 Sobic001G163000--Sobic001G344450 Sobic001G163000--Sobic001G501500 Sobic008G120066 Sobic008G120066 Sobic001G163000--Sobic008G120066 Sobic001G520200 Sobic001G520200 Sobic001G163000--Sobic001G520200 Sobic001G163000--Sobic004G230500 Sobic006G044866--Sobic009G247100 Sobic006G044866--Sobic001G353700 Sobic004G302500 Sobic004G302500 Sobic006G044866--Sobic004G302500 Sobic006G044866--Sobic001G344450 Sobic006G044866--Sobic001G501500 Sobic004G337700 Sobic004G337700 Sobic006G044866--Sobic004G337700 Sobic006G044866--Sobic004G230500 Sobic003G139100 Sobic003G139100 Sobic006G044866--Sobic003G139100 Sobic006G044866--Sobic008G120066 Sobic006G165900--Sobic001G163000 Sobic006G165900--Sobic001G501500 Sobic006G165900--Sobic001G353700 Sobic006G165900--Sobic005G169900 Sobic006G165900--Sobic004G230500 Sobic008G152400 Sobic008G152400 Sobic006G165900--Sobic008G152400 Sobic009G046500 Sobic009G046500 Sobic006G165900--Sobic009G046500 Sobic004G179000 Sobic004G179000 Sobic006G165900--Sobic004G179000 Sobic006G165900--Sobic001G344450 Sobic007G114401--Sobic001G353700 Sobic003G123500 Sobic003G123500 Sobic007G114401--Sobic003G123500 Sobic007G135301 Sobic007G135301 Sobic007G114401--Sobic007G135301 Sobic007G114401--Sobic006G165900 Sobic007G114401--Sobic003G159000 Sobic006G087250 Sobic006G087250 Sobic007G114401--Sobic006G087250 Sobic007G114401--Sobic008G152400 Sobic007G114401--Sobic001G163000 Sobic001G195550 Sobic001G195550 Sobic007G114401--Sobic001G195550 Sobic001G501500--Sobic004G230500 Sobic005G077532 Sobic005G077532 Sobic001G501500--Sobic005G077532 Sobic001G501500--Sobic006G165900 Sobic010G009532 Sobic010G009532 Sobic001G501500--Sobic010G009532 Sobic001G501500--Sobic001G163000 Sobic008G152100 Sobic008G152100 Sobic001G501500--Sobic008G152100 Sobic001G501500--Sobic001G344450 Sobic009G039300 Sobic009G039300 Sobic001G501500--Sobic009G039300 Sobic001G501500--Sobic004G179000 Sobic004G230500--Sobic001G501500 Sobic004G230500--Sobic005G077532 Sobic004G230500--Sobic008G152100 Sobic001G180500 Sobic001G180500 Sobic004G230500--Sobic001G180500 Sobic004G230500--Sobic010G009532 Sobic004G230500--Sobic006G165900 Sobic003G385800 Sobic003G385800 Sobic004G230500--Sobic003G385800 Sobic004G230500--Sobic001G353700 Sobic004G230500--Sobic004G179000 Sobic003G159000--Sobic005G169900 Sobic003G194900 Sobic003G194900 Sobic003G159000--Sobic003G194900 Sobic007G084400 Sobic007G084400 Sobic003G159000--Sobic007G084400 Sobic003G137300 Sobic003G137300 Sobic003G159000--Sobic003G137300 Sobic003G159000--Sobic009G250000 Sobic003G159000--Sobic001G353700 Sobic009G177901 Sobic009G177901 Sobic003G159000--Sobic009G177901 Sobic003G159000--Sobic007G114401 Sobic003G159000--Sobic006G087250 Sobic009G247100--Sobic006G044866 Sobic009G247100--Sobic004G302500 Sobic009G247100--Sobic001G353700 Sobic009G247100--Sobic001G501500 Sobic009G247100--Sobic004G230500 Sobic009G247100--Sobic001G344450 Sobic003G159400 Sobic003G159400 Sobic009G247100--Sobic003G159400 Sobic009G247100--Sobic004G337700 Sobic009G247100--Sobic010G009532 Sobic005G169900--Sobic009G250000 Sobic001G124500 Sobic001G124500 Sobic005G169900--Sobic001G124500 Sobic005G169900--Sobic001G163000 Sobic005G169900--Sobic003G194900 Sobic002G038200 Sobic002G038200 Sobic005G169900--Sobic002G038200 Sobic006G142700 Sobic006G142700 Sobic005G169900--Sobic006G142700 Sobic008G013700 Sobic008G013700 Sobic005G169900--Sobic008G013700 Sobic010G150000 Sobic010G150000 Sobic005G169900--Sobic010G150000 Sobic005G169900--Sobic003G159000
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.