Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G159000.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6Q3G6
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) Zm00025a036237
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G169900 CDK5RAP1, putative, expressed -
2 Sobic.003G194900 expressed protein -
3 Sobic.007G084400 - -
4 Sobic.003G137300 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@LOI1, putative, expressed -
5 Sobic.009G250000 helix-loop-helix DNA-binding protein, putative, expressed -
6 Sobic.001G353700 expressed protein -
7 Sobic.009G177901 - -
8 Sobic.007G114401 - -
9 Sobic.006G087250 - -
10 Sobic.006G142700 expressed protein -
11 Sobic.010G150000 - -
12 Sobic.001G163000 hypothetical protein -
13 Sobic.007G052500 - -
14 Sobic.004G125701 - -
15 Sobic.007G085966 - -
16 Sobic.001G520200 glycosylphosphatidylinositol anchor biosynthesis protein 11, putative, expressed K05287: GPI ethanolamine phosphate transferase 2/3 subunit F
17 Sobic.002G038200 deoxyribonuclease tatD, putative, expressed K03424: TatD DNase family protein
18 Sobic.004G201800 expressed protein -
19 Sobic.001G540250 - -
20 Sobic.003G123500 - -


Gene co-expression network
sample Sobic003G159000 Sobic003G159000 Sobic005G169900 Sobic005G169900 Sobic003G159000--Sobic005G169900 Sobic003G194900 Sobic003G194900 Sobic003G159000--Sobic003G194900 Sobic007G084400 Sobic007G084400 Sobic003G159000--Sobic007G084400 Sobic003G137300 Sobic003G137300 Sobic003G159000--Sobic003G137300 Sobic009G250000 Sobic009G250000 Sobic003G159000--Sobic009G250000 Sobic001G353700 Sobic001G353700 Sobic003G159000--Sobic001G353700 Sobic009G177901 Sobic009G177901 Sobic003G159000--Sobic009G177901 Sobic007G114401 Sobic007G114401 Sobic003G159000--Sobic007G114401 Sobic006G087250 Sobic006G087250 Sobic003G159000--Sobic006G087250 Sobic005G169900--Sobic009G250000 Sobic001G124500 Sobic001G124500 Sobic005G169900--Sobic001G124500 Sobic001G163000 Sobic001G163000 Sobic005G169900--Sobic001G163000 Sobic005G169900--Sobic003G194900 Sobic002G038200 Sobic002G038200 Sobic005G169900--Sobic002G038200 Sobic006G142700 Sobic006G142700 Sobic005G169900--Sobic006G142700 Sobic008G013700 Sobic008G013700 Sobic005G169900--Sobic008G013700 Sobic010G150000 Sobic010G150000 Sobic005G169900--Sobic010G150000 Sobic005G169900--Sobic003G159000 Sobic003G194900--Sobic006G142700 Sobic003G194900--Sobic010G150000 Sobic007G094000 Sobic007G094000 Sobic003G194900--Sobic007G094000 Sobic003G194900--Sobic002G038200 Sobic003G194900--Sobic009G250000 Sobic003G194900--Sobic001G124500 Sobic003G194900--Sobic005G169900 Sobic004G342600 Sobic004G342600 Sobic003G194900--Sobic004G342600 Sobic007G052500 Sobic007G052500 Sobic003G194900--Sobic007G052500 Sobic007G084400--Sobic003G159000 Sobic009G160300 Sobic009G160300 Sobic007G084400--Sobic009G160300 Sobic005G048300 Sobic005G048300 Sobic007G084400--Sobic005G048300 Sobic007G084400--Sobic003G137300 Sobic006G247400 Sobic006G247400 Sobic007G084400--Sobic006G247400 Sobic002G246950 Sobic002G246950 Sobic007G084400--Sobic002G246950 Sobic007G084400--Sobic007G052500 Sobic001G540250 Sobic001G540250 Sobic007G084400--Sobic001G540250 Sobic007G084400--Sobic003G194900 Sobic009G029100 Sobic009G029100 Sobic003G137300--Sobic009G029100 Sobic003G412500 Sobic003G412500 Sobic003G137300--Sobic003G412500 Sobic005G101400 Sobic005G101400 Sobic003G137300--Sobic005G101400 Sobic009G069450 Sobic009G069450 Sobic003G137300--Sobic009G069450 Sobic003G137300--Sobic006G087250 Sobic003G423400 Sobic003G423400 Sobic003G137300--Sobic003G423400 Sobic001G217800 Sobic001G217800 Sobic003G137300--Sobic001G217800 Sobic008G108300 Sobic008G108300 Sobic003G137300--Sobic008G108300 Sobic002G165200 Sobic002G165200 Sobic003G137300--Sobic002G165200 Sobic009G250000--Sobic002G038200 Sobic009G250000--Sobic005G169900 Sobic009G250000--Sobic006G142700 Sobic001G520200 Sobic001G520200 Sobic009G250000--Sobic001G520200 Sobic009G250000--Sobic001G124500 Sobic006G181150 Sobic006G181150 Sobic009G250000--Sobic006G181150 Sobic009G250000--Sobic003G194900 Sobic009G250000--Sobic001G163000 Sobic009G038800 Sobic009G038800 Sobic009G250000--Sobic009G038800 Sobic001G353700--Sobic001G163000 Sobic006G044866 Sobic006G044866 Sobic001G353700--Sobic006G044866 Sobic006G165900 Sobic006G165900 Sobic001G353700--Sobic006G165900 Sobic001G353700--Sobic007G114401 Sobic001G501500 Sobic001G501500 Sobic001G353700--Sobic001G501500 Sobic004G230500 Sobic004G230500 Sobic001G353700--Sobic004G230500 Sobic001G353700--Sobic003G159000 Sobic009G247100 Sobic009G247100 Sobic001G353700--Sobic009G247100 Sobic001G353700--Sobic005G169900 Sobic002G275400 Sobic002G275400 Sobic009G177901--Sobic002G275400 Sobic004G125600 Sobic004G125600 Sobic009G177901--Sobic004G125600 Sobic004G299850 Sobic004G299850 Sobic009G177901--Sobic004G299850 Sobic004G125701 Sobic004G125701 Sobic009G177901--Sobic004G125701 Sobic009G177901--Sobic003G159000 Sobic006G258600 Sobic006G258600 Sobic009G177901--Sobic006G258600 Sobic008G104400 Sobic008G104400 Sobic009G177901--Sobic008G104400 Sobic009G177901--Sobic003G137300 Sobic005G068200 Sobic005G068200 Sobic009G177901--Sobic005G068200 Sobic007G114401--Sobic001G353700 Sobic003G123500 Sobic003G123500 Sobic007G114401--Sobic003G123500 Sobic007G135301 Sobic007G135301 Sobic007G114401--Sobic007G135301 Sobic007G114401--Sobic006G165900 Sobic007G114401--Sobic003G159000 Sobic007G114401--Sobic006G087250 Sobic008G152400 Sobic008G152400 Sobic007G114401--Sobic008G152400 Sobic007G114401--Sobic001G163000 Sobic001G195550 Sobic001G195550 Sobic007G114401--Sobic001G195550 Sobic006G087250--Sobic007G135301 Sobic004G346800 Sobic004G346800 Sobic006G087250--Sobic004G346800 Sobic001G048300 Sobic001G048300 Sobic006G087250--Sobic001G048300 Sobic006G087250--Sobic003G137300 Sobic001G071250 Sobic001G071250 Sobic006G087250--Sobic001G071250 Sobic007G226300 Sobic007G226300 Sobic006G087250--Sobic007G226300 Sobic006G087250--Sobic001G195550 Sobic006G087250--Sobic009G069450 Sobic003G393600 Sobic003G393600 Sobic006G087250--Sobic003G393600
Octagon: transcription factors


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