Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G540250.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5SBY9
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G249300 expressed protein -
2 Sobic.001G217800 - -
3 Sobic.005G101400 pyruvate kinase, putative, expressed K00873: PK, pyruvate kinase
4 Sobic.004G125701 - -
5 Sobic.001G302100 holliday junction resolvase, putative, expressed K07447: putative holliday junction resolvase
6 Sobic.002G341600 lipase, putative, expressed -
7 Sobic.009G104850 - -
8 Sobic.005G167450 - -
9 Sobic.008G013700 - -
10 Sobic.007G085966 - -
11 Sobic.007G047450 - -
12 Sobic.007G052500 - -
13 Sobic.009G029100 serine/threonine-protein kinase receptor precursor, putative, expressed -
14 Sobic.001G124500 elongation of fatty acids protein 2, putative, expressed -
15 Sobic.004G125600 - -
16 Sobic.003G137300 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@LOI1, putative, expressed -
17 Sobic.007G099300 - -
18 Sobic.003G412500 - -
19 Sobic.004G272500 ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase, family 1, putative, expressed -
20 Sobic.004G224400 UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic001G540250 Sobic001G540250 Sobic003G249300 Sobic003G249300 Sobic001G540250--Sobic003G249300 Sobic001G217800 Sobic001G217800 Sobic001G540250--Sobic001G217800 Sobic005G101400 Sobic005G101400 Sobic001G540250--Sobic005G101400 Sobic004G125701 Sobic004G125701 Sobic001G540250--Sobic004G125701 Sobic001G302100 Sobic001G302100 Sobic001G540250--Sobic001G302100 Sobic002G341600 Sobic002G341600 Sobic001G540250--Sobic002G341600 Sobic009G104850 Sobic009G104850 Sobic001G540250--Sobic009G104850 Sobic005G167450 Sobic005G167450 Sobic001G540250--Sobic005G167450 Sobic008G013700 Sobic008G013700 Sobic001G540250--Sobic008G013700 Sobic003G249300--Sobic001G540250 Sobic003G249300--Sobic001G217800 Sobic003G249300--Sobic001G302100 Sobic003G249300--Sobic005G167450 Sobic003G249300--Sobic002G341600 Sobic003G249300--Sobic004G125701 Sobic003G249300--Sobic005G101400 Sobic004G125600 Sobic004G125600 Sobic003G249300--Sobic004G125600 Sobic003G249300--Sobic009G104850 Sobic001G217800--Sobic005G101400 Sobic001G217800--Sobic009G104850 Sobic001G217800--Sobic003G249300 Sobic001G217800--Sobic005G167450 Sobic001G217800--Sobic001G540250 Sobic004G272500 Sobic004G272500 Sobic001G217800--Sobic004G272500 Sobic001G217800--Sobic002G341600 Sobic009G029100 Sobic009G029100 Sobic001G217800--Sobic009G029100 Sobic001G217800--Sobic001G302100 Sobic005G101400--Sobic001G217800 Sobic005G101400--Sobic009G104850 Sobic005G101400--Sobic005G167450 Sobic005G101400--Sobic004G272500 Sobic005G101400--Sobic001G540250 Sobic009G069450 Sobic009G069450 Sobic005G101400--Sobic009G069450 Sobic005G101400--Sobic003G249300 Sobic002G322101 Sobic002G322101 Sobic005G101400--Sobic002G322101 Sobic003G169400 Sobic003G169400 Sobic005G101400--Sobic003G169400 Sobic004G125701--Sobic004G125600 Sobic002G275400 Sobic002G275400 Sobic004G125701--Sobic002G275400 Sobic007G099300 Sobic007G099300 Sobic004G125701--Sobic007G099300 Sobic001G124500 Sobic001G124500 Sobic004G125701--Sobic001G124500 Sobic004G125701--Sobic001G540250 Sobic004G125701--Sobic008G013700 Sobic004G125701--Sobic001G302100 Sobic004G125701--Sobic003G249300 Sobic004G125701--Sobic002G341600 Sobic001G302100--Sobic003G249300 Sobic001G302100--Sobic002G341600 Sobic001G302100--Sobic004G125701 Sobic001G302100--Sobic001G540250 Sobic001G302100--Sobic004G125600 Sobic001G302100--Sobic001G217800 Sobic004G019700 Sobic004G019700 Sobic001G302100--Sobic004G019700 Sobic001G302100--Sobic007G099300 Sobic001G302100--Sobic001G124500 Sobic002G341600--Sobic001G302100 Sobic006G258600 Sobic006G258600 Sobic002G341600--Sobic006G258600 Sobic002G341600--Sobic003G249300 Sobic002G341600--Sobic001G217800 Sobic002G341600--Sobic001G540250 Sobic002G341600--Sobic004G125701 Sobic002G341600--Sobic009G029100 Sobic002G341600--Sobic007G099300 Sobic003G325000 Sobic003G325000 Sobic002G341600--Sobic003G325000 Sobic009G104850--Sobic004G272500 Sobic009G104850--Sobic001G217800 Sobic010G225400 Sobic010G225400 Sobic009G104850--Sobic010G225400 Sobic009G104850--Sobic005G101400 Sobic003G160400 Sobic003G160400 Sobic009G104850--Sobic003G160400 Sobic005G167100 Sobic005G167100 Sobic009G104850--Sobic005G167100 Sobic009G104850--Sobic005G167450 Sobic010G107601 Sobic010G107601 Sobic009G104850--Sobic010G107601 Sobic004G234766 Sobic004G234766 Sobic009G104850--Sobic004G234766 Sobic005G167450--Sobic001G217800 Sobic005G167450--Sobic005G101400 Sobic005G167450--Sobic009G104850 Sobic005G167450--Sobic003G249300 Sobic005G167450--Sobic004G272500 Sobic005G167450--Sobic010G225400 Sobic005G167450--Sobic004G234766 Sobic010G107901 Sobic010G107901 Sobic005G167450--Sobic010G107901 Sobic006G093550 Sobic006G093550 Sobic005G167450--Sobic006G093550 Sobic008G013700--Sobic001G124500 Sobic008G013700--Sobic004G019700 Sobic004G192001 Sobic004G192001 Sobic008G013700--Sobic004G192001 Sobic008G013700--Sobic004G125701 Sobic008G013700--Sobic007G099300 Sobic008G013700--Sobic004G125600 Sobic010G178700 Sobic010G178700 Sobic008G013700--Sobic010G178700 Sobic004G224400 Sobic004G224400 Sobic008G013700--Sobic004G224400 Sobic009G038800 Sobic009G038800 Sobic008G013700--Sobic009G038800
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.