Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G125600.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A194YPB3
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


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cDNA sequences
Sobic.004G125600


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G125701 - -
2 Sobic.002G275400 - -
3 Sobic.001G124500 elongation of fatty acids protein 2, putative, expressed -
4 Sobic.007G099300 - -
5 Sobic.008G013700 - -
6 Sobic.001G302100 holliday junction resolvase, putative, expressed K07447: putative holliday junction resolvase
7 Sobic.010G178700 transferase family protein, putative, expressed -
8 Sobic.004G019700 expressed protein -
9 Sobic.003G249300 expressed protein -
10 Sobic.004G192001 - -
11 Sobic.003G386400 - -
12 Sobic.001G540250 - -
13 Sobic.005G169900 CDK5RAP1, putative, expressed -
14 Sobic.001G520200 glycosylphosphatidylinositol anchor biosynthesis protein 11, putative, expressed K05287: GPI ethanolamine phosphate transferase 2/3 subunit F
15 Sobic.002G341600 lipase, putative, expressed -
16 Sobic.010G150000 - -
17 Sobic.006G142700 expressed protein -
18 Sobic.010G111900 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during dark-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@flavin-containing monooxygenase family protein, putative, expressed -
19 Sobic.001G523932 - -
20 Sobic.001G217800 - -


Gene co-expression network
sample Sobic004G125600 Sobic004G125600 Sobic004G125701 Sobic004G125701 Sobic004G125600--Sobic004G125701 Sobic002G275400 Sobic002G275400 Sobic004G125600--Sobic002G275400 Sobic001G124500 Sobic001G124500 Sobic004G125600--Sobic001G124500 Sobic007G099300 Sobic007G099300 Sobic004G125600--Sobic007G099300 Sobic008G013700 Sobic008G013700 Sobic004G125600--Sobic008G013700 Sobic001G302100 Sobic001G302100 Sobic004G125600--Sobic001G302100 Sobic010G178700 Sobic010G178700 Sobic004G125600--Sobic010G178700 Sobic004G019700 Sobic004G019700 Sobic004G125600--Sobic004G019700 Sobic003G249300 Sobic003G249300 Sobic004G125600--Sobic003G249300 Sobic004G125701--Sobic004G125600 Sobic004G125701--Sobic002G275400 Sobic004G125701--Sobic007G099300 Sobic004G125701--Sobic001G124500 Sobic001G540250 Sobic001G540250 Sobic004G125701--Sobic001G540250 Sobic004G125701--Sobic008G013700 Sobic004G125701--Sobic001G302100 Sobic004G125701--Sobic003G249300 Sobic002G341600 Sobic002G341600 Sobic004G125701--Sobic002G341600 Sobic002G275400--Sobic004G125701 Sobic002G275400--Sobic004G125600 Sobic003G386400 Sobic003G386400 Sobic002G275400--Sobic003G386400 Sobic004G299850 Sobic004G299850 Sobic002G275400--Sobic004G299850 Sobic002G275400--Sobic007G099300 Sobic003G412500 Sobic003G412500 Sobic002G275400--Sobic003G412500 Sobic009G029100 Sobic009G029100 Sobic002G275400--Sobic009G029100 Sobic002G275400--Sobic002G341600 Sobic001G523932 Sobic001G523932 Sobic002G275400--Sobic001G523932 Sobic001G124500--Sobic007G099300 Sobic001G124500--Sobic008G013700 Sobic001G124500--Sobic004G019700 Sobic006G142700 Sobic006G142700 Sobic001G124500--Sobic006G142700 Sobic004G192001 Sobic004G192001 Sobic001G124500--Sobic004G192001 Sobic001G124500--Sobic004G125600 Sobic001G124500--Sobic004G125701 Sobic001G124500--Sobic010G178700 Sobic004G342600 Sobic004G342600 Sobic001G124500--Sobic004G342600 Sobic007G099300--Sobic001G124500 Sobic007G099300--Sobic004G192001 Sobic007G099300--Sobic006G142700 Sobic007G099300--Sobic004G125701 Sobic004G260700 Sobic004G260700 Sobic007G099300--Sobic004G260700 Sobic007G099300--Sobic008G013700 Sobic007G099300--Sobic004G125600 Sobic007G099300--Sobic004G019700 Sobic010G150000 Sobic010G150000 Sobic007G099300--Sobic010G150000 Sobic008G013700--Sobic001G124500 Sobic008G013700--Sobic004G019700 Sobic008G013700--Sobic004G192001 Sobic008G013700--Sobic004G125701 Sobic008G013700--Sobic007G099300 Sobic008G013700--Sobic004G125600 Sobic008G013700--Sobic010G178700 Sobic004G224400 Sobic004G224400 Sobic008G013700--Sobic004G224400 Sobic009G038800 Sobic009G038800 Sobic008G013700--Sobic009G038800 Sobic001G302100--Sobic003G249300 Sobic001G302100--Sobic002G341600 Sobic001G302100--Sobic004G125701 Sobic001G302100--Sobic001G540250 Sobic001G302100--Sobic004G125600 Sobic001G217800 Sobic001G217800 Sobic001G302100--Sobic001G217800 Sobic001G302100--Sobic004G019700 Sobic001G302100--Sobic007G099300 Sobic001G302100--Sobic001G124500 Sobic010G178700--Sobic001G124500 Sobic010G178700--Sobic008G013700 Sobic010G178700--Sobic004G019700 Sobic010G178700--Sobic004G125600 Sobic010G178700--Sobic004G192001 Sobic010G178700--Sobic007G099300 Sobic001G520200 Sobic001G520200 Sobic010G178700--Sobic001G520200 Sobic010G178700--Sobic009G038800 Sobic010G178700--Sobic004G125701 Sobic004G019700--Sobic001G124500 Sobic004G019700--Sobic004G192001 Sobic004G019700--Sobic008G013700 Sobic003G378500 Sobic003G378500 Sobic004G019700--Sobic003G378500 Sobic004G019700--Sobic007G099300 Sobic004G019700--Sobic010G178700 Sobic004G019700--Sobic001G302100 Sobic004G019700--Sobic004G125600 Sobic004G019700--Sobic006G142700 Sobic003G249300--Sobic001G540250 Sobic003G249300--Sobic001G217800 Sobic003G249300--Sobic001G302100 Sobic005G167450 Sobic005G167450 Sobic003G249300--Sobic005G167450 Sobic003G249300--Sobic002G341600 Sobic003G249300--Sobic004G125701 Sobic005G101400 Sobic005G101400 Sobic003G249300--Sobic005G101400 Sobic003G249300--Sobic004G125600 Sobic009G104850 Sobic009G104850 Sobic003G249300--Sobic009G104850
Octagon: transcription factors


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