Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G520200.1,Sobic.001G520200.2,Sobic.001G520200.3
Synonym Sb01g048510
Functional annotation glycosylphosphatidylinositol anchor biosynthesis protein 11, putative, expressed
UniProt C5WZY2 , A0A1Z5SBL8 , A0A1Z5SBN0
Pfam PF06699
Panther DB PTHR24320
NCBI CDD -
KEGG Orthology K05287; GPI ethanolamine phosphate transferase 2/3 subunit F
Gene Ontology GO:0016021; integral component of membrane GO:0006506GPI anchor biosynthetic process GO:0005789endoplasmic reticulum membrane


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G16040 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g03690.1,LOC_Os03g03690.3 : glycosylphosphatidylinositol anchor biosynthesis protein 11, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a053471 , Zm00025a000399
Brachypodium KQK23848 , KQK23849 , KQK23847
Barley HORVU4Hr1G082720.8 , HORVU4Hr1G082720.5 , HORVU4Hr1G082720.4 , HORVU4Hr1G082720.7 , HORVU4Hr1G082720.6 , HORVU4Hr1G082720.1 , HORVU4Hr1G082720.3 , HORVU4Hr1G082720.2
Wheat TraesCS4B02G322600 , TraesCS5A02G494700 , TraesCS4D02G319000
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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20 Sobic.004G192001 - -


Gene co-expression network
sample Sobic001G520200 Sobic001G520200 Sobic009G250000 Sobic009G250000 Sobic001G520200--Sobic009G250000 Sobic002G038200 Sobic002G038200 Sobic001G520200--Sobic002G038200 Sobic010G150000 Sobic010G150000 Sobic001G520200--Sobic010G150000 Sobic001G124500 Sobic001G124500 Sobic001G520200--Sobic001G124500 Sobic010G178700 Sobic010G178700 Sobic001G520200--Sobic010G178700 Sobic006G142700 Sobic006G142700 Sobic001G520200--Sobic006G142700 Sobic009G038800 Sobic009G038800 Sobic001G520200--Sobic009G038800 Sobic008G013700 Sobic008G013700 Sobic001G520200--Sobic008G013700 Sobic004G125701 Sobic004G125701 Sobic001G520200--Sobic004G125701 Sobic009G250000--Sobic002G038200 Sobic005G169900 Sobic005G169900 Sobic009G250000--Sobic005G169900 Sobic009G250000--Sobic006G142700 Sobic009G250000--Sobic001G520200 Sobic009G250000--Sobic001G124500 Sobic006G181150 Sobic006G181150 Sobic009G250000--Sobic006G181150 Sobic003G194900 Sobic003G194900 Sobic009G250000--Sobic003G194900 Sobic001G163000 Sobic001G163000 Sobic009G250000--Sobic001G163000 Sobic009G250000--Sobic009G038800 Sobic006G152900 Sobic006G152900 Sobic002G038200--Sobic006G152900 Sobic002G038200--Sobic009G250000 Sobic004G342600 Sobic004G342600 Sobic002G038200--Sobic004G342600 Sobic009G082500 Sobic009G082500 Sobic002G038200--Sobic009G082500 Sobic002G038200--Sobic006G142700 Sobic002G038200--Sobic010G150000 Sobic004G165600 Sobic004G165600 Sobic002G038200--Sobic004G165600 Sobic001G494400 Sobic001G494400 Sobic002G038200--Sobic001G494400 Sobic002G282000 Sobic002G282000 Sobic002G038200--Sobic002G282000 Sobic010G150000--Sobic006G152900 Sobic010G150000--Sobic004G165600 Sobic005G096201 Sobic005G096201 Sobic010G150000--Sobic005G096201 Sobic010G150000--Sobic004G342600 Sobic002G209450 Sobic002G209450 Sobic010G150000--Sobic002G209450 Sobic010G150000--Sobic002G038200 Sobic009G215350 Sobic009G215350 Sobic010G150000--Sobic009G215350 Sobic007G099300 Sobic007G099300 Sobic010G150000--Sobic007G099300 Sobic003G429600 Sobic003G429600 Sobic010G150000--Sobic003G429600 Sobic001G124500--Sobic007G099300 Sobic001G124500--Sobic008G013700 Sobic004G019700 Sobic004G019700 Sobic001G124500--Sobic004G019700 Sobic001G124500--Sobic006G142700 Sobic004G192001 Sobic004G192001 Sobic001G124500--Sobic004G192001 Sobic004G125600 Sobic004G125600 Sobic001G124500--Sobic004G125600 Sobic001G124500--Sobic004G125701 Sobic001G124500--Sobic010G178700 Sobic001G124500--Sobic004G342600 Sobic010G178700--Sobic001G124500 Sobic010G178700--Sobic008G013700 Sobic010G178700--Sobic004G019700 Sobic010G178700--Sobic004G125600 Sobic010G178700--Sobic004G192001 Sobic010G178700--Sobic007G099300 Sobic010G178700--Sobic001G520200 Sobic010G178700--Sobic009G038800 Sobic010G178700--Sobic004G125701 Sobic006G142700--Sobic001G124500 Sobic006G142700--Sobic007G099300 Sobic006G142700--Sobic006G152900 Sobic006G142700--Sobic009G250000 Sobic006G142700--Sobic002G038200 Sobic010G219700 Sobic010G219700 Sobic006G142700--Sobic010G219700 Sobic006G142700--Sobic003G194900 Sobic006G142700--Sobic010G150000 Sobic006G142700--Sobic004G019700 Sobic009G038800--Sobic008G013700 Sobic009G038800--Sobic001G124500 Sobic009G038800--Sobic009G250000 Sobic009G038800--Sobic002G038200 Sobic009G038800--Sobic001G520200 Sobic009G038800--Sobic010G178700 Sobic009G038800--Sobic004G019700 Sobic005G001600 Sobic005G001600 Sobic009G038800--Sobic005G001600 Sobic008G173700 Sobic008G173700 Sobic009G038800--Sobic008G173700 Sobic008G013700--Sobic001G124500 Sobic008G013700--Sobic004G019700 Sobic008G013700--Sobic004G192001 Sobic008G013700--Sobic004G125701 Sobic008G013700--Sobic007G099300 Sobic008G013700--Sobic004G125600 Sobic008G013700--Sobic010G178700 Sobic004G224400 Sobic004G224400 Sobic008G013700--Sobic004G224400 Sobic008G013700--Sobic009G038800 Sobic004G125701--Sobic004G125600 Sobic002G275400 Sobic002G275400 Sobic004G125701--Sobic002G275400 Sobic004G125701--Sobic007G099300 Sobic004G125701--Sobic001G124500 Sobic001G540250 Sobic001G540250 Sobic004G125701--Sobic001G540250 Sobic004G125701--Sobic008G013700 Sobic001G302100 Sobic001G302100 Sobic004G125701--Sobic001G302100 Sobic003G249300 Sobic003G249300 Sobic004G125701--Sobic003G249300 Sobic002G341600 Sobic002G341600 Sobic004G125701--Sobic002G341600
Octagon: transcription factors


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