Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G124500.1
Synonym Sb01g010960
Functional annotation elongation of fatty acids protein 2, putative, expressed
UniProt C5WNU1
Pfam PF01151
Panther DB PTHR11157 PTHR11157:SF13
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0016021; integral component of membrane


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G06470 : GNS1/SUR4 membrane protein family
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g49480.1 : elongation of fatty acids protein 2, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a007745
Brachypodium KQK13650
Barley HORVU4Hr1G006020.2 , HORVU4Hr1G006020.3 , HORVU4Hr1G006020.1
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G099300 - -
2 Sobic.008G013700 - -
3 Sobic.004G019700 expressed protein -
4 Sobic.006G142700 expressed protein -
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6 Sobic.004G125600 - -
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9 Sobic.004G342600 cytidylyltransferase domain containing protein, expressed K06210: nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase
10 Sobic.010G150000 - -
11 Sobic.009G250000 helix-loop-helix DNA-binding protein, putative, expressed -
12 Sobic.004G260700 - -
13 Sobic.006G152900 - -
14 Sobic.005G169900 CDK5RAP1, putative, expressed -
15 Sobic.001G302100 holliday junction resolvase, putative, expressed K07447: putative holliday junction resolvase
16 Sobic.003G194900 expressed protein -
17 Sobic.009G038800 SLD5 - Putative GINS complex subunit, expressed K10735: GINS4, GINS complex subunit 4
18 Sobic.001G520200 glycosylphosphatidylinositol anchor biosynthesis protein 11, putative, expressed K05287: GPI ethanolamine phosphate transferase 2/3 subunit F
19 Sobic.003G249300 expressed protein -
20 Sobic.002G038200 deoxyribonuclease tatD, putative, expressed K03424: TatD DNase family protein


Gene co-expression network
sample Sobic001G124500 Sobic001G124500 Sobic007G099300 Sobic007G099300 Sobic001G124500--Sobic007G099300 Sobic008G013700 Sobic008G013700 Sobic001G124500--Sobic008G013700 Sobic004G019700 Sobic004G019700 Sobic001G124500--Sobic004G019700 Sobic006G142700 Sobic006G142700 Sobic001G124500--Sobic006G142700 Sobic004G192001 Sobic004G192001 Sobic001G124500--Sobic004G192001 Sobic004G125600 Sobic004G125600 Sobic001G124500--Sobic004G125600 Sobic004G125701 Sobic004G125701 Sobic001G124500--Sobic004G125701 Sobic010G178700 Sobic010G178700 Sobic001G124500--Sobic010G178700 Sobic004G342600 Sobic004G342600 Sobic001G124500--Sobic004G342600 Sobic007G099300--Sobic001G124500 Sobic007G099300--Sobic004G192001 Sobic007G099300--Sobic006G142700 Sobic007G099300--Sobic004G125701 Sobic004G260700 Sobic004G260700 Sobic007G099300--Sobic004G260700 Sobic007G099300--Sobic008G013700 Sobic007G099300--Sobic004G125600 Sobic007G099300--Sobic004G019700 Sobic010G150000 Sobic010G150000 Sobic007G099300--Sobic010G150000 Sobic008G013700--Sobic001G124500 Sobic008G013700--Sobic004G019700 Sobic008G013700--Sobic004G192001 Sobic008G013700--Sobic004G125701 Sobic008G013700--Sobic007G099300 Sobic008G013700--Sobic004G125600 Sobic008G013700--Sobic010G178700 Sobic004G224400 Sobic004G224400 Sobic008G013700--Sobic004G224400 Sobic009G038800 Sobic009G038800 Sobic008G013700--Sobic009G038800 Sobic004G019700--Sobic001G124500 Sobic004G019700--Sobic004G192001 Sobic004G019700--Sobic008G013700 Sobic003G378500 Sobic003G378500 Sobic004G019700--Sobic003G378500 Sobic004G019700--Sobic007G099300 Sobic004G019700--Sobic010G178700 Sobic001G302100 Sobic001G302100 Sobic004G019700--Sobic001G302100 Sobic004G019700--Sobic004G125600 Sobic004G019700--Sobic006G142700 Sobic006G142700--Sobic001G124500 Sobic006G142700--Sobic007G099300 Sobic006G152900 Sobic006G152900 Sobic006G142700--Sobic006G152900 Sobic009G250000 Sobic009G250000 Sobic006G142700--Sobic009G250000 Sobic002G038200 Sobic002G038200 Sobic006G142700--Sobic002G038200 Sobic010G219700 Sobic010G219700 Sobic006G142700--Sobic010G219700 Sobic003G194900 Sobic003G194900 Sobic006G142700--Sobic003G194900 Sobic006G142700--Sobic010G150000 Sobic006G142700--Sobic004G019700 Sobic004G192001--Sobic007G099300 Sobic004G192001--Sobic004G260700 Sobic004G192001--Sobic001G124500 Sobic004G192001--Sobic004G019700 Sobic004G192001--Sobic008G013700 Sobic004G192001--Sobic010G178700 Sobic010G111900 Sobic010G111900 Sobic004G192001--Sobic010G111900 Sobic004G192001--Sobic004G125600 Sobic003G439200 Sobic003G439200 Sobic004G192001--Sobic003G439200 Sobic004G125600--Sobic004G125701 Sobic002G275400 Sobic002G275400 Sobic004G125600--Sobic002G275400 Sobic004G125600--Sobic001G124500 Sobic004G125600--Sobic007G099300 Sobic004G125600--Sobic008G013700 Sobic004G125600--Sobic001G302100 Sobic004G125600--Sobic010G178700 Sobic004G125600--Sobic004G019700 Sobic003G249300 Sobic003G249300 Sobic004G125600--Sobic003G249300 Sobic004G125701--Sobic004G125600 Sobic004G125701--Sobic002G275400 Sobic004G125701--Sobic007G099300 Sobic004G125701--Sobic001G124500 Sobic001G540250 Sobic001G540250 Sobic004G125701--Sobic001G540250 Sobic004G125701--Sobic008G013700 Sobic004G125701--Sobic001G302100 Sobic004G125701--Sobic003G249300 Sobic002G341600 Sobic002G341600 Sobic004G125701--Sobic002G341600 Sobic010G178700--Sobic001G124500 Sobic010G178700--Sobic008G013700 Sobic010G178700--Sobic004G019700 Sobic010G178700--Sobic004G125600 Sobic010G178700--Sobic004G192001 Sobic010G178700--Sobic007G099300 Sobic001G520200 Sobic001G520200 Sobic010G178700--Sobic001G520200 Sobic010G178700--Sobic009G038800 Sobic010G178700--Sobic004G125701 Sobic004G165600 Sobic004G165600 Sobic004G342600--Sobic004G165600 Sobic004G342600--Sobic002G038200 Sobic004G342600--Sobic006G152900 Sobic004G342600--Sobic010G150000 Sobic004G342600--Sobic001G124500 Sobic002G013600 Sobic002G013600 Sobic004G342600--Sobic002G013600 Sobic004G342600--Sobic010G219700 Sobic004G342600--Sobic006G142700 Sobic004G342600--Sobic008G013700
Octagon: transcription factors


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