Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G194900.1
Synonym Sb03g025810
Functional annotation expressed protein
UniProt C5XNS4
Pfam -
Panther DB PTHR32133 PTHR32133:SF82
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g39690.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G142700 expressed protein -
2 Sobic.010G150000 - -
3 Sobic.007G094000 - -
4 Sobic.002G038200 deoxyribonuclease tatD, putative, expressed K03424: TatD DNase family protein
5 Sobic.009G250000 helix-loop-helix DNA-binding protein, putative, expressed -
6 Sobic.001G124500 elongation of fatty acids protein 2, putative, expressed -
7 Sobic.005G169900 CDK5RAP1, putative, expressed -
8 Sobic.004G342600 cytidylyltransferase domain containing protein, expressed K06210: nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase
9 Sobic.007G052500 - -
10 Sobic.003G159000 - -
11 Sobic.006G152900 - -
12 Sobic.007G099300 - -
13 Sobic.001G018550 - -
14 Sobic.004G165600 glycosyl hydrolases family 17, putative, expressed -
15 Sobic.008G013700 - -
16 Sobic.005G160600 OsFBO15 - F-box and other domain containing protein, expressed -
17 Sobic.001G169950 - -
18 Sobic.004G118000 glutamate receptor 2.6 precursor, putative, expressed K05387: glutamate receptor, ionotropic, plant
19 Sobic.010G219700 fructose-1,6-bisphosphatase, putative, expressed K03841: FBP, fructose-1,6-bisphosphatase I
20 Sobic.001G494400 DUF593 domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic003G194900 Sobic003G194900 Sobic006G142700 Sobic006G142700 Sobic003G194900--Sobic006G142700 Sobic010G150000 Sobic010G150000 Sobic003G194900--Sobic010G150000 Sobic007G094000 Sobic007G094000 Sobic003G194900--Sobic007G094000 Sobic002G038200 Sobic002G038200 Sobic003G194900--Sobic002G038200 Sobic009G250000 Sobic009G250000 Sobic003G194900--Sobic009G250000 Sobic001G124500 Sobic001G124500 Sobic003G194900--Sobic001G124500 Sobic005G169900 Sobic005G169900 Sobic003G194900--Sobic005G169900 Sobic004G342600 Sobic004G342600 Sobic003G194900--Sobic004G342600 Sobic007G052500 Sobic007G052500 Sobic003G194900--Sobic007G052500 Sobic006G142700--Sobic001G124500 Sobic007G099300 Sobic007G099300 Sobic006G142700--Sobic007G099300 Sobic006G152900 Sobic006G152900 Sobic006G142700--Sobic006G152900 Sobic006G142700--Sobic009G250000 Sobic006G142700--Sobic002G038200 Sobic010G219700 Sobic010G219700 Sobic006G142700--Sobic010G219700 Sobic006G142700--Sobic003G194900 Sobic006G142700--Sobic010G150000 Sobic004G019700 Sobic004G019700 Sobic006G142700--Sobic004G019700 Sobic010G150000--Sobic006G152900 Sobic004G165600 Sobic004G165600 Sobic010G150000--Sobic004G165600 Sobic005G096201 Sobic005G096201 Sobic010G150000--Sobic005G096201 Sobic010G150000--Sobic004G342600 Sobic002G209450 Sobic002G209450 Sobic010G150000--Sobic002G209450 Sobic010G150000--Sobic002G038200 Sobic009G215350 Sobic009G215350 Sobic010G150000--Sobic009G215350 Sobic010G150000--Sobic007G099300 Sobic003G429600 Sobic003G429600 Sobic010G150000--Sobic003G429600 Sobic003G303800 Sobic003G303800 Sobic007G094000--Sobic003G303800 Sobic003G305250 Sobic003G305250 Sobic007G094000--Sobic003G305250 Sobic001G283800 Sobic001G283800 Sobic007G094000--Sobic001G283800 Sobic007G094000--Sobic007G052500 Sobic004G260700 Sobic004G260700 Sobic007G094000--Sobic004G260700 Sobic007G094000--Sobic007G099300 Sobic007G094000--Sobic003G194900 Sobic007G094000--Sobic010G150000 Sobic008G013700 Sobic008G013700 Sobic007G094000--Sobic008G013700 Sobic002G038200--Sobic006G152900 Sobic002G038200--Sobic009G250000 Sobic002G038200--Sobic004G342600 Sobic009G082500 Sobic009G082500 Sobic002G038200--Sobic009G082500 Sobic002G038200--Sobic006G142700 Sobic002G038200--Sobic010G150000 Sobic002G038200--Sobic004G165600 Sobic001G494400 Sobic001G494400 Sobic002G038200--Sobic001G494400 Sobic002G282000 Sobic002G282000 Sobic002G038200--Sobic002G282000 Sobic009G250000--Sobic002G038200 Sobic009G250000--Sobic005G169900 Sobic009G250000--Sobic006G142700 Sobic001G520200 Sobic001G520200 Sobic009G250000--Sobic001G520200 Sobic009G250000--Sobic001G124500 Sobic006G181150 Sobic006G181150 Sobic009G250000--Sobic006G181150 Sobic009G250000--Sobic003G194900 Sobic001G163000 Sobic001G163000 Sobic009G250000--Sobic001G163000 Sobic009G038800 Sobic009G038800 Sobic009G250000--Sobic009G038800 Sobic001G124500--Sobic007G099300 Sobic001G124500--Sobic008G013700 Sobic001G124500--Sobic004G019700 Sobic001G124500--Sobic006G142700 Sobic004G192001 Sobic004G192001 Sobic001G124500--Sobic004G192001 Sobic004G125600 Sobic004G125600 Sobic001G124500--Sobic004G125600 Sobic004G125701 Sobic004G125701 Sobic001G124500--Sobic004G125701 Sobic010G178700 Sobic010G178700 Sobic001G124500--Sobic010G178700 Sobic001G124500--Sobic004G342600 Sobic005G169900--Sobic009G250000 Sobic005G169900--Sobic001G124500 Sobic005G169900--Sobic001G163000 Sobic005G169900--Sobic003G194900 Sobic005G169900--Sobic002G038200 Sobic005G169900--Sobic006G142700 Sobic005G169900--Sobic008G013700 Sobic005G169900--Sobic010G150000 Sobic003G159000 Sobic003G159000 Sobic005G169900--Sobic003G159000 Sobic004G342600--Sobic004G165600 Sobic004G342600--Sobic002G038200 Sobic004G342600--Sobic006G152900 Sobic004G342600--Sobic010G150000 Sobic004G342600--Sobic001G124500 Sobic002G013600 Sobic002G013600 Sobic004G342600--Sobic002G013600 Sobic004G342600--Sobic010G219700 Sobic004G342600--Sobic006G142700 Sobic004G342600--Sobic008G013700 Sobic003G253100 Sobic003G253100 Sobic007G052500--Sobic003G253100 Sobic001G523150 Sobic001G523150 Sobic007G052500--Sobic001G523150 Sobic009G029100 Sobic009G029100 Sobic007G052500--Sobic009G029100 Sobic008G039200 Sobic008G039200 Sobic007G052500--Sobic008G039200 Sobic007G052500--Sobic001G283800 Sobic009G160300 Sobic009G160300 Sobic007G052500--Sobic009G160300 Sobic007G052500--Sobic007G094000 Sobic004G044401 Sobic004G044401 Sobic007G052500--Sobic004G044401 Sobic003G412500 Sobic003G412500 Sobic007G052500--Sobic003G412500
Octagon: transcription factors


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