Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G013700.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6PAT5
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
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Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G124500 elongation of fatty acids protein 2, putative, expressed -
2 Sobic.004G019700 expressed protein -
3 Sobic.004G192001 - -
4 Sobic.004G125701 - -
5 Sobic.007G099300 - -
6 Sobic.004G125600 - -
7 Sobic.010G178700 transferase family protein, putative, expressed -
8 Sobic.004G224400 UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase domain containing protein, expressed -
9 Sobic.009G038800 SLD5 - Putative GINS complex subunit, expressed K10735: GINS4, GINS complex subunit 4
10 Sobic.007G047450 - -
11 Sobic.001G540250 - -
12 Sobic.003G439200 RNA polymerase IV largest subunit, putative, expressed K16251: DNA-directed RNA polymerase V subunit 1
13 Sobic.007G094000 - -
14 Sobic.004G342600 cytidylyltransferase domain containing protein, expressed K06210: nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase
15 Sobic.005G169900 CDK5RAP1, putative, expressed -
16 Sobic.003G249300 expressed protein -
17 Sobic.004G260700 - -
18 Sobic.001G302100 holliday junction resolvase, putative, expressed K07447: putative holliday junction resolvase
19 Sobic.001G520200 glycosylphosphatidylinositol anchor biosynthesis protein 11, putative, expressed K05287: GPI ethanolamine phosphate transferase 2/3 subunit F
20 Sobic.003G305250 - -


Gene co-expression network
sample Sobic008G013700 Sobic008G013700 Sobic001G124500 Sobic001G124500 Sobic008G013700--Sobic001G124500 Sobic004G019700 Sobic004G019700 Sobic008G013700--Sobic004G019700 Sobic004G192001 Sobic004G192001 Sobic008G013700--Sobic004G192001 Sobic004G125701 Sobic004G125701 Sobic008G013700--Sobic004G125701 Sobic007G099300 Sobic007G099300 Sobic008G013700--Sobic007G099300 Sobic004G125600 Sobic004G125600 Sobic008G013700--Sobic004G125600 Sobic010G178700 Sobic010G178700 Sobic008G013700--Sobic010G178700 Sobic004G224400 Sobic004G224400 Sobic008G013700--Sobic004G224400 Sobic009G038800 Sobic009G038800 Sobic008G013700--Sobic009G038800 Sobic001G124500--Sobic007G099300 Sobic001G124500--Sobic008G013700 Sobic001G124500--Sobic004G019700 Sobic006G142700 Sobic006G142700 Sobic001G124500--Sobic006G142700 Sobic001G124500--Sobic004G192001 Sobic001G124500--Sobic004G125600 Sobic001G124500--Sobic004G125701 Sobic001G124500--Sobic010G178700 Sobic004G342600 Sobic004G342600 Sobic001G124500--Sobic004G342600 Sobic004G019700--Sobic001G124500 Sobic004G019700--Sobic004G192001 Sobic004G019700--Sobic008G013700 Sobic003G378500 Sobic003G378500 Sobic004G019700--Sobic003G378500 Sobic004G019700--Sobic007G099300 Sobic004G019700--Sobic010G178700 Sobic001G302100 Sobic001G302100 Sobic004G019700--Sobic001G302100 Sobic004G019700--Sobic004G125600 Sobic004G019700--Sobic006G142700 Sobic004G192001--Sobic007G099300 Sobic004G260700 Sobic004G260700 Sobic004G192001--Sobic004G260700 Sobic004G192001--Sobic001G124500 Sobic004G192001--Sobic004G019700 Sobic004G192001--Sobic008G013700 Sobic004G192001--Sobic010G178700 Sobic010G111900 Sobic010G111900 Sobic004G192001--Sobic010G111900 Sobic004G192001--Sobic004G125600 Sobic003G439200 Sobic003G439200 Sobic004G192001--Sobic003G439200 Sobic004G125701--Sobic004G125600 Sobic002G275400 Sobic002G275400 Sobic004G125701--Sobic002G275400 Sobic004G125701--Sobic007G099300 Sobic004G125701--Sobic001G124500 Sobic001G540250 Sobic001G540250 Sobic004G125701--Sobic001G540250 Sobic004G125701--Sobic008G013700 Sobic004G125701--Sobic001G302100 Sobic003G249300 Sobic003G249300 Sobic004G125701--Sobic003G249300 Sobic002G341600 Sobic002G341600 Sobic004G125701--Sobic002G341600 Sobic007G099300--Sobic001G124500 Sobic007G099300--Sobic004G192001 Sobic007G099300--Sobic006G142700 Sobic007G099300--Sobic004G125701 Sobic007G099300--Sobic004G260700 Sobic007G099300--Sobic008G013700 Sobic007G099300--Sobic004G125600 Sobic007G099300--Sobic004G019700 Sobic010G150000 Sobic010G150000 Sobic007G099300--Sobic010G150000 Sobic004G125600--Sobic004G125701 Sobic004G125600--Sobic002G275400 Sobic004G125600--Sobic001G124500 Sobic004G125600--Sobic007G099300 Sobic004G125600--Sobic008G013700 Sobic004G125600--Sobic001G302100 Sobic004G125600--Sobic010G178700 Sobic004G125600--Sobic004G019700 Sobic004G125600--Sobic003G249300 Sobic010G178700--Sobic001G124500 Sobic010G178700--Sobic008G013700 Sobic010G178700--Sobic004G019700 Sobic010G178700--Sobic004G125600 Sobic010G178700--Sobic004G192001 Sobic010G178700--Sobic007G099300 Sobic001G520200 Sobic001G520200 Sobic010G178700--Sobic001G520200 Sobic010G178700--Sobic009G038800 Sobic010G178700--Sobic004G125701 Sobic004G224400--Sobic008G013700 Sobic004G224400--Sobic004G125701 Sobic007G094000 Sobic007G094000 Sobic004G224400--Sobic007G094000 Sobic004G224400--Sobic001G540250 Sobic007G052500 Sobic007G052500 Sobic004G224400--Sobic007G052500 Sobic004G224400--Sobic001G124500 Sobic009G255200 Sobic009G255200 Sobic004G224400--Sobic009G255200 Sobic003G305250 Sobic003G305250 Sobic004G224400--Sobic003G305250 Sobic004G224400--Sobic004G125600 Sobic009G038800--Sobic008G013700 Sobic009G038800--Sobic001G124500 Sobic009G250000 Sobic009G250000 Sobic009G038800--Sobic009G250000 Sobic002G038200 Sobic002G038200 Sobic009G038800--Sobic002G038200 Sobic009G038800--Sobic001G520200 Sobic009G038800--Sobic010G178700 Sobic009G038800--Sobic004G019700 Sobic005G001600 Sobic005G001600 Sobic009G038800--Sobic005G001600 Sobic008G173700 Sobic008G173700 Sobic009G038800--Sobic008G173700
Octagon: transcription factors


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