Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G142700.3,Sobic.006G142700.1,Sobic.006G142700.2
Synonym Sb06g022170
Functional annotation expressed protein
UniProt C5YBY3
Pfam -
Panther DB PTHR31996 PTHR31996:SF2
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G20770 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g43040.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a010728
Brachypodium -
Barley HORVU2Hr1G088210.14 , HORVU2Hr1G088210.11 , HORVU2Hr1G088210.10 , HORVU2Hr1G088210.13 , HORVU2Hr1G088210.12 , HORVU2Hr1G088210.9 , HORVU2Hr1G088210.8 , HORVU2Hr1G088210.1 , HORVU2Hr1G088210.3 , HORVU2Hr1G088210.2 , HORVU2Hr1G088210.5 , HORVU2Hr1G088210.4 , HORVU2Hr1G088210.7 , HORVU2Hr1G088210.6
Wheat TraesCS2D02G362600 , TraesCS2A02G364600
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G124500 elongation of fatty acids protein 2, putative, expressed -
2 Sobic.007G099300 - -
3 Sobic.006G152900 - -
4 Sobic.009G250000 helix-loop-helix DNA-binding protein, putative, expressed -
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8 Sobic.010G150000 - -
9 Sobic.004G019700 expressed protein -
10 Sobic.004G342600 cytidylyltransferase domain containing protein, expressed K06210: nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase
11 Sobic.001G520200 glycosylphosphatidylinositol anchor biosynthesis protein 11, putative, expressed K05287: GPI ethanolamine phosphate transferase 2/3 subunit F
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13 Sobic.004G192001 - -
14 Sobic.004G125701 - -
15 Sobic.008G013700 - -
16 Sobic.002G341600 lipase, putative, expressed -
17 Sobic.004G260700 - -
18 Sobic.004G125600 - -
19 Sobic.001G345366 - -
20 Sobic.004G165600 glycosyl hydrolases family 17, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic006G142700 Sobic006G142700 Sobic001G124500 Sobic001G124500 Sobic006G142700--Sobic001G124500 Sobic007G099300 Sobic007G099300 Sobic006G142700--Sobic007G099300 Sobic006G152900 Sobic006G152900 Sobic006G142700--Sobic006G152900 Sobic009G250000 Sobic009G250000 Sobic006G142700--Sobic009G250000 Sobic002G038200 Sobic002G038200 Sobic006G142700--Sobic002G038200 Sobic010G219700 Sobic010G219700 Sobic006G142700--Sobic010G219700 Sobic003G194900 Sobic003G194900 Sobic006G142700--Sobic003G194900 Sobic010G150000 Sobic010G150000 Sobic006G142700--Sobic010G150000 Sobic004G019700 Sobic004G019700 Sobic006G142700--Sobic004G019700 Sobic001G124500--Sobic007G099300 Sobic008G013700 Sobic008G013700 Sobic001G124500--Sobic008G013700 Sobic001G124500--Sobic004G019700 Sobic001G124500--Sobic006G142700 Sobic004G192001 Sobic004G192001 Sobic001G124500--Sobic004G192001 Sobic004G125600 Sobic004G125600 Sobic001G124500--Sobic004G125600 Sobic004G125701 Sobic004G125701 Sobic001G124500--Sobic004G125701 Sobic010G178700 Sobic010G178700 Sobic001G124500--Sobic010G178700 Sobic004G342600 Sobic004G342600 Sobic001G124500--Sobic004G342600 Sobic007G099300--Sobic001G124500 Sobic007G099300--Sobic004G192001 Sobic007G099300--Sobic006G142700 Sobic007G099300--Sobic004G125701 Sobic004G260700 Sobic004G260700 Sobic007G099300--Sobic004G260700 Sobic007G099300--Sobic008G013700 Sobic007G099300--Sobic004G125600 Sobic007G099300--Sobic004G019700 Sobic007G099300--Sobic010G150000 Sobic006G152900--Sobic002G038200 Sobic004G165600 Sobic004G165600 Sobic006G152900--Sobic004G165600 Sobic006G152900--Sobic010G150000 Sobic006G152900--Sobic004G342600 Sobic006G152900--Sobic010G219700 Sobic006G152900--Sobic006G142700 Sobic006G152900--Sobic001G124500 Sobic001G345366 Sobic001G345366 Sobic006G152900--Sobic001G345366 Sobic004G200000 Sobic004G200000 Sobic006G152900--Sobic004G200000 Sobic009G250000--Sobic002G038200 Sobic005G169900 Sobic005G169900 Sobic009G250000--Sobic005G169900 Sobic009G250000--Sobic006G142700 Sobic001G520200 Sobic001G520200 Sobic009G250000--Sobic001G520200 Sobic009G250000--Sobic001G124500 Sobic006G181150 Sobic006G181150 Sobic009G250000--Sobic006G181150 Sobic009G250000--Sobic003G194900 Sobic001G163000 Sobic001G163000 Sobic009G250000--Sobic001G163000 Sobic009G038800 Sobic009G038800 Sobic009G250000--Sobic009G038800 Sobic002G038200--Sobic006G152900 Sobic002G038200--Sobic009G250000 Sobic002G038200--Sobic004G342600 Sobic009G082500 Sobic009G082500 Sobic002G038200--Sobic009G082500 Sobic002G038200--Sobic006G142700 Sobic002G038200--Sobic010G150000 Sobic002G038200--Sobic004G165600 Sobic001G494400 Sobic001G494400 Sobic002G038200--Sobic001G494400 Sobic002G282000 Sobic002G282000 Sobic002G038200--Sobic002G282000 Sobic010G219700--Sobic006G152900 Sobic010G219700--Sobic006G142700 Sobic010G219700--Sobic004G165600 Sobic010G219700--Sobic010G150000 Sobic010G219700--Sobic004G342600 Sobic010G219700--Sobic002G038200 Sobic002G413700 Sobic002G413700 Sobic010G219700--Sobic002G413700 Sobic010G219700--Sobic004G200000 Sobic001G156401 Sobic001G156401 Sobic010G219700--Sobic001G156401 Sobic003G194900--Sobic006G142700 Sobic003G194900--Sobic010G150000 Sobic007G094000 Sobic007G094000 Sobic003G194900--Sobic007G094000 Sobic003G194900--Sobic002G038200 Sobic003G194900--Sobic009G250000 Sobic003G194900--Sobic001G124500 Sobic003G194900--Sobic005G169900 Sobic003G194900--Sobic004G342600 Sobic007G052500 Sobic007G052500 Sobic003G194900--Sobic007G052500 Sobic010G150000--Sobic006G152900 Sobic010G150000--Sobic004G165600 Sobic005G096201 Sobic005G096201 Sobic010G150000--Sobic005G096201 Sobic010G150000--Sobic004G342600 Sobic002G209450 Sobic002G209450 Sobic010G150000--Sobic002G209450 Sobic010G150000--Sobic002G038200 Sobic009G215350 Sobic009G215350 Sobic010G150000--Sobic009G215350 Sobic010G150000--Sobic007G099300 Sobic003G429600 Sobic003G429600 Sobic010G150000--Sobic003G429600 Sobic004G019700--Sobic001G124500 Sobic004G019700--Sobic004G192001 Sobic004G019700--Sobic008G013700 Sobic003G378500 Sobic003G378500 Sobic004G019700--Sobic003G378500 Sobic004G019700--Sobic007G099300 Sobic004G019700--Sobic010G178700 Sobic001G302100 Sobic001G302100 Sobic004G019700--Sobic001G302100 Sobic004G019700--Sobic004G125600 Sobic004G019700--Sobic006G142700
Octagon: transcription factors


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