Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G024550.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5R4F9
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G244000 expressed protein -
2 Sobic.001G520200 glycosylphosphatidylinositol anchor biosynthesis protein 11, putative, expressed K05287: GPI ethanolamine phosphate transferase 2/3 subunit F
3 Sobic.001G163000 hypothetical protein -
4 Sobic.001G344450 - K02998: RP-SAe, small subunit ribosomal protein SAe
5 Sobic.009G038800 SLD5 - Putative GINS complex subunit, expressed K10735: GINS4, GINS complex subunit 4
6 Sobic.009G039300 short-chain dehydrogenase/reductase, putative, expressed -
7 Sobic.005G002500 beta,beta-carotene 9,10-dioxygenase, putative, expressed K17913: carlactone synthase / all-trans-10'-apo-beta-carotenal 13,14-cleaving dioxygenase
8 Sobic.009G215350 - -
9 Sobic.002G038200 deoxyribonuclease tatD, putative, expressed K03424: TatD DNase family protein
10 Sobic.009G250000 helix-loop-helix DNA-binding protein, putative, expressed -
11 Sobic.001G501500 DUF584 domain containing protein, putative, expressed -
12 Sobic.009G049900 peptide transporter PTR2, putative, expressed -
13 Sobic.004G032500 membrane associated DUF588 domain containing protein, putative, expressed -
14 Sobic.004G177400 T-complex protein 11, putative, expressed -
15 Sobic.008G173700 cyclic nucleotide-gated ion channel, putative, expressed K05391: cyclic nucleotide gated channel, plant
16 Sobic.008G120066 - -
17 Sobic.005G077532 - -
18 Sobic.008G064900 growth regulator related protein, putative, expressed -
19 Sobic.006G165900 cyclin, putative, expressed -
20 Sobic.008G192800 CK1_CaseinKinase_1a.5 - CK1 includes the casein kinase 1 kinases, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic008G024550 Sobic008G024550 Sobic010G244000 Sobic010G244000 Sobic008G024550--Sobic010G244000 Sobic001G520200 Sobic001G520200 Sobic008G024550--Sobic001G520200 Sobic001G163000 Sobic001G163000 Sobic008G024550--Sobic001G163000 Sobic001G344450 Sobic001G344450 Sobic008G024550--Sobic001G344450 Sobic009G038800 Sobic009G038800 Sobic008G024550--Sobic009G038800 Sobic009G039300 Sobic009G039300 Sobic008G024550--Sobic009G039300 Sobic005G002500 Sobic005G002500 Sobic008G024550--Sobic005G002500 Sobic009G215350 Sobic009G215350 Sobic008G024550--Sobic009G215350 Sobic002G038200 Sobic002G038200 Sobic008G024550--Sobic002G038200 Sobic008G173700 Sobic008G173700 Sobic010G244000--Sobic008G173700 Sobic004G177400 Sobic004G177400 Sobic010G244000--Sobic004G177400 Sobic010G244000--Sobic008G024550 Sobic008G064900 Sobic008G064900 Sobic010G244000--Sobic008G064900 Sobic003G378500 Sobic003G378500 Sobic010G244000--Sobic003G378500 Sobic004G032500 Sobic004G032500 Sobic010G244000--Sobic004G032500 Sobic010G244000--Sobic001G520200 Sobic004G302550 Sobic004G302550 Sobic010G244000--Sobic004G302550 Sobic006G222650 Sobic006G222650 Sobic010G244000--Sobic006G222650 Sobic009G250000 Sobic009G250000 Sobic001G520200--Sobic009G250000 Sobic001G520200--Sobic002G038200 Sobic010G150000 Sobic010G150000 Sobic001G520200--Sobic010G150000 Sobic001G124500 Sobic001G124500 Sobic001G520200--Sobic001G124500 Sobic010G178700 Sobic010G178700 Sobic001G520200--Sobic010G178700 Sobic006G142700 Sobic006G142700 Sobic001G520200--Sobic006G142700 Sobic001G520200--Sobic009G038800 Sobic008G013700 Sobic008G013700 Sobic001G520200--Sobic008G013700 Sobic004G125701 Sobic004G125701 Sobic001G520200--Sobic004G125701 Sobic006G165900 Sobic006G165900 Sobic001G163000--Sobic006G165900 Sobic001G353700 Sobic001G353700 Sobic001G163000--Sobic001G353700 Sobic001G163000--Sobic009G250000 Sobic005G169900 Sobic005G169900 Sobic001G163000--Sobic005G169900 Sobic001G163000--Sobic001G344450 Sobic001G501500 Sobic001G501500 Sobic001G163000--Sobic001G501500 Sobic008G120066 Sobic008G120066 Sobic001G163000--Sobic008G120066 Sobic001G163000--Sobic001G520200 Sobic004G230500 Sobic004G230500 Sobic001G163000--Sobic004G230500 Sobic001G344450--Sobic008G120066 Sobic001G344450--Sobic009G039300 Sobic001G096800 Sobic001G096800 Sobic001G344450--Sobic001G096800 Sobic001G344450--Sobic005G002500 Sobic001G344450--Sobic001G163000 Sobic001G344450--Sobic001G501500 Sobic009G114900 Sobic009G114900 Sobic001G344450--Sobic009G114900 Sobic009G236000 Sobic009G236000 Sobic001G344450--Sobic009G236000 Sobic008G192800 Sobic008G192800 Sobic001G344450--Sobic008G192800 Sobic009G038800--Sobic008G013700 Sobic009G038800--Sobic001G124500 Sobic009G038800--Sobic009G250000 Sobic009G038800--Sobic002G038200 Sobic009G038800--Sobic001G520200 Sobic009G038800--Sobic010G178700 Sobic004G019700 Sobic004G019700 Sobic009G038800--Sobic004G019700 Sobic005G001600 Sobic005G001600 Sobic009G038800--Sobic005G001600 Sobic009G038800--Sobic008G173700 Sobic009G039300--Sobic001G344450 Sobic009G039300--Sobic005G002500 Sobic008G096900 Sobic008G096900 Sobic009G039300--Sobic008G096900 Sobic006G280900 Sobic006G280900 Sobic009G039300--Sobic006G280900 Sobic002G116300 Sobic002G116300 Sobic009G039300--Sobic002G116300 Sobic001G541166 Sobic001G541166 Sobic009G039300--Sobic001G541166 Sobic009G238200 Sobic009G238200 Sobic009G039300--Sobic009G238200 Sobic004G302400 Sobic004G302400 Sobic009G039300--Sobic004G302400 Sobic006G146400 Sobic006G146400 Sobic009G039300--Sobic006G146400 Sobic005G002500--Sobic009G039300 Sobic001G537600 Sobic001G537600 Sobic005G002500--Sobic001G537600 Sobic005G002500--Sobic006G280900 Sobic005G002500--Sobic006G146400 Sobic005G002500--Sobic009G238200 Sobic006G065200 Sobic006G065200 Sobic005G002500--Sobic006G065200 Sobic010G106400 Sobic010G106400 Sobic005G002500--Sobic010G106400 Sobic005G002500--Sobic001G344450 Sobic005G002500--Sobic004G302400 Sobic009G215350--Sobic010G150000 Sobic004G342600 Sobic004G342600 Sobic009G215350--Sobic004G342600 Sobic003G139100 Sobic003G139100 Sobic009G215350--Sobic003G139100 Sobic005G096201 Sobic005G096201 Sobic009G215350--Sobic005G096201 Sobic002G013600 Sobic002G013600 Sobic009G215350--Sobic002G013600 Sobic004G224100 Sobic004G224100 Sobic009G215350--Sobic004G224100 Sobic009G080000 Sobic009G080000 Sobic009G215350--Sobic009G080000 Sobic003G429600 Sobic003G429600 Sobic009G215350--Sobic003G429600 Sobic009G215350--Sobic001G520200 Sobic006G152900 Sobic006G152900 Sobic002G038200--Sobic006G152900 Sobic002G038200--Sobic009G250000 Sobic002G038200--Sobic004G342600 Sobic009G082500 Sobic009G082500 Sobic002G038200--Sobic009G082500 Sobic002G038200--Sobic006G142700 Sobic002G038200--Sobic010G150000 Sobic004G165600 Sobic004G165600 Sobic002G038200--Sobic004G165600 Sobic001G494400 Sobic001G494400 Sobic002G038200--Sobic001G494400 Sobic002G282000 Sobic002G282000 Sobic002G038200--Sobic002G282000
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.