Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G032500.1
Synonym Sb04g002820
Functional annotation membrane associated DUF588 domain containing protein, putative, expressed
UniProt C5XTX2
Pfam PF04535
Panther DB PTHR11615 PTHR11615:SF147
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G36330 : Uncharacterised protein family (UPF0497)
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g47200.1 : retrotransposon protein, putative, unclassified, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a035009 , Zm00025a018901
Brachypodium -
Barley HORVU6Hr1G017850.3
Wheat TraesCS6D02G083000
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.004G032500


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G019901 - -
2 Sobic.010G035300 WRKY73, expressed -
3 Sobic.007G174100 carrier, putative, expressed -
4 Sobic.006G162300 expressed protein -
5 Sobic.007G161450 - -
6 Sobic.006G222800 NBS-LRR disease resistance protein, putative, expressed -
7 Sobic.009G031300 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@pentatricopeptide containing protein, putative, expressed -
8 Sobic.002G116300 poly synthetase 1, putative, expressed K10798: poly [ADP-ribose] polymerase 2/3/4
9 Sobic.009G039300 short-chain dehydrogenase/reductase, putative, expressed -
10 Sobic.001G520700 expressed protein -
11 Sobic.008G119000 cysteine protease, putative, expressed -
12 Sobic.004G302400 NAC domain containing protein, putative, expressed -
13 Sobic.006G222650 - -
14 Sobic.009G238200 transcription factor(PubMedID : 30367619)@WRKY19, expressed -
15 Sobic.007G204500 expressed protein -
16 Sobic.006G037000 - -
17 Sobic.002G396900 csAtPR5, putative, expressed -
18 Sobic.005G076100 rp3 protein, putative, expressed -
19 Sobic.002G231800 purine permease, putative, expressed -
20 Sobic.004G177400 T-complex protein 11, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic004G032500 Sobic004G032500 Sobic006G019901 Sobic006G019901 Sobic004G032500--Sobic006G019901 Sobic010G035300 Sobic010G035300 Sobic004G032500--Sobic010G035300 Sobic007G174100 Sobic007G174100 Sobic004G032500--Sobic007G174100 Sobic006G162300 Sobic006G162300 Sobic004G032500--Sobic006G162300 Sobic007G161450 Sobic007G161450 Sobic004G032500--Sobic007G161450 Sobic006G222800 Sobic006G222800 Sobic004G032500--Sobic006G222800 Sobic009G031300 Sobic009G031300 Sobic004G032500--Sobic009G031300 Sobic002G116300 Sobic002G116300 Sobic004G032500--Sobic002G116300 Sobic009G039300 Sobic009G039300 Sobic004G032500--Sobic009G039300 Sobic001G481201 Sobic001G481201 Sobic006G019901--Sobic001G481201 Sobic002G165401 Sobic002G165401 Sobic006G019901--Sobic002G165401 Sobic009G127600 Sobic009G127600 Sobic006G019901--Sobic009G127600 Sobic003G008850 Sobic003G008850 Sobic006G019901--Sobic003G008850 Sobic002G231800 Sobic002G231800 Sobic006G019901--Sobic002G231800 Sobic005G076100 Sobic005G076100 Sobic006G019901--Sobic005G076100 Sobic006G019901--Sobic006G222800 Sobic006G256801 Sobic006G256801 Sobic006G019901--Sobic006G256801 Sobic001G537900 Sobic001G537900 Sobic006G019901--Sobic001G537900 Sobic006G222650 Sobic006G222650 Sobic010G035300--Sobic006G222650 Sobic010G035300--Sobic002G116300 Sobic004G302400 Sobic004G302400 Sobic010G035300--Sobic004G302400 Sobic010G035300--Sobic006G162300 Sobic010G035300--Sobic006G222800 Sobic010G035300--Sobic007G161450 Sobic004G001900 Sobic004G001900 Sobic010G035300--Sobic004G001900 Sobic005G091400 Sobic005G091400 Sobic010G035300--Sobic005G091400 Sobic004G269500 Sobic004G269500 Sobic010G035300--Sobic004G269500 Sobic007G174100--Sobic005G076100 Sobic010G132300 Sobic010G132300 Sobic007G174100--Sobic010G132300 Sobic003G149900 Sobic003G149900 Sobic007G174100--Sobic003G149900 Sobic002G326200 Sobic002G326200 Sobic007G174100--Sobic002G326200 Sobic004G160950 Sobic004G160950 Sobic007G174100--Sobic004G160950 Sobic008G096150 Sobic008G096150 Sobic007G174100--Sobic008G096150 Sobic006G058300 Sobic006G058300 Sobic007G174100--Sobic006G058300 Sobic008G096900 Sobic008G096900 Sobic007G174100--Sobic008G096900 Sobic007G174100--Sobic003G008850 Sobic006G162300--Sobic005G091400 Sobic004G211501 Sobic004G211501 Sobic006G162300--Sobic004G211501 Sobic006G162300--Sobic007G161450 Sobic006G162300--Sobic010G035300 Sobic006G162300--Sobic004G302400 Sobic006G162300--Sobic006G222650 Sobic006G180500 Sobic006G180500 Sobic006G162300--Sobic006G180500 Sobic008G119000 Sobic008G119000 Sobic006G162300--Sobic008G119000 Sobic009G085600 Sobic009G085600 Sobic006G162300--Sobic009G085600 Sobic007G204500 Sobic007G204500 Sobic007G161450--Sobic007G204500 Sobic007G161450--Sobic006G222800 Sobic007G161450--Sobic006G180500 Sobic007G161450--Sobic008G119000 Sobic007G111600 Sobic007G111600 Sobic007G161450--Sobic007G111600 Sobic007G116600 Sobic007G116600 Sobic007G161450--Sobic007G116600 Sobic007G161450--Sobic006G162300 Sobic007G161450--Sobic009G085600 Sobic007G161450--Sobic004G001900 Sobic006G222800--Sobic006G180500 Sobic006G222800--Sobic002G165401 Sobic006G222800--Sobic008G119000 Sobic006G222800--Sobic007G204500 Sobic006G222800--Sobic007G161450 Sobic006G222800--Sobic006G256801 Sobic006G222800--Sobic004G001900 Sobic006G222800--Sobic009G085600 Sobic006G222800--Sobic003G008850 Sobic006G037000 Sobic006G037000 Sobic009G031300--Sobic006G037000 Sobic002G396900 Sobic002G396900 Sobic009G031300--Sobic002G396900 Sobic010G200800 Sobic010G200800 Sobic009G031300--Sobic010G200800 Sobic009G031300--Sobic003G149900 Sobic009G031300--Sobic007G174100 Sobic009G031300--Sobic008G096900 Sobic009G031300--Sobic005G076100 Sobic001G523300 Sobic001G523300 Sobic009G031300--Sobic001G523300 Sobic001G115900 Sobic001G115900 Sobic009G031300--Sobic001G115900 Sobic002G116300--Sobic010G035300 Sobic002G116300--Sobic004G302400 Sobic002G116300--Sobic006G222650 Sobic009G238200 Sobic009G238200 Sobic002G116300--Sobic009G238200 Sobic006G146400 Sobic006G146400 Sobic002G116300--Sobic006G146400 Sobic002G116300--Sobic008G119000 Sobic002G116300--Sobic006G222800 Sobic002G247100 Sobic002G247100 Sobic002G116300--Sobic002G247100 Sobic009G174600 Sobic009G174600 Sobic002G116300--Sobic009G174600 Sobic001G344450 Sobic001G344450 Sobic009G039300--Sobic001G344450 Sobic005G002500 Sobic005G002500 Sobic009G039300--Sobic005G002500 Sobic009G039300--Sobic008G096900 Sobic006G280900 Sobic006G280900 Sobic009G039300--Sobic006G280900 Sobic009G039300--Sobic002G116300 Sobic001G541166 Sobic001G541166 Sobic009G039300--Sobic001G541166 Sobic009G039300--Sobic009G238200 Sobic009G039300--Sobic004G302400 Sobic009G039300--Sobic006G146400
Octagon: transcription factors


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