Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G344450.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5S917
Pfam -
Panther DB PTHR11489
NCBI CDD -
KEGG Orthology K02998; RP-SAe, small subunit ribosomal protein SAe
Gene Ontology GO:0015935; small ribosomal subunit GO:0006412translation GO:0003735structural constituent of ribosome


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G72370 : 40s ribosomal protein SA
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g08440.1 : ribosomal protein S2, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G120066 - -
2 Sobic.009G039300 short-chain dehydrogenase/reductase, putative, expressed -
3 Sobic.001G096800 uncharacterized UPF0114 domain containing protein, expressed -
4 Sobic.005G002500 beta,beta-carotene 9,10-dioxygenase, putative, expressed K17913: carlactone synthase / all-trans-10'-apo-beta-carotenal 13,14-cleaving dioxygenase
5 Sobic.001G163000 hypothetical protein -
6 Sobic.001G501500 DUF584 domain containing protein, putative, expressed -
7 Sobic.009G114900 - -
8 Sobic.009G236000 GATA zinc finger domain containing protein, expressed -
9 Sobic.008G192800 CK1_CaseinKinase_1a.5 - CK1 includes the casein kinase 1 kinases, expressed -
10 Sobic.009G083100 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@expressed protein -
11 Sobic.006G280900 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed -
12 Sobic.001G541166 - -
13 Sobic.009G250000 helix-loop-helix DNA-binding protein, putative, expressed -
14 Sobic.002G038200 deoxyribonuclease tatD, putative, expressed K03424: TatD DNase family protein
15 Sobic.010G009532 - -
16 Sobic.007G090406 - -
17 Sobic.008G096900 protein of unknown function DUF502 domain containing protein, expressed -
18 Sobic.006G044866 - -
19 Sobic.005G001600 IBR domain containing protein, expressed -
20 Sobic.002G252700 vignain precursor, putative, expressed -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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