Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G083100.1
Synonym Sb09g007290
Functional annotation SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence. (PubMedID : 27586543)
expressed protein
UniProt A0A1Z5R2Q8 , H0I4F3
Pfam -
Panther DB PTHR33781 PTHR33781:SF2
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os05g13360.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G280900 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed -
2 Sobic.007G090406 - -
3 Sobic.006G146400 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@pentatricopeptide, putative, expressed -
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5 Sobic.009G236000 GATA zinc finger domain containing protein, expressed -
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7 Sobic.009G114900 - -
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11 Sobic.010G106400 - -
12 Sobic.002G116300 poly synthetase 1, putative, expressed K10798: poly [ADP-ribose] polymerase 2/3/4
13 Sobic.006G103601 - -
14 Sobic.001G543600 tetraspanin family protein, putative, expressed -
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16 Sobic.006G065200 SAM domain family protein, expressed -
17 Sobic.005G001600 IBR domain containing protein, expressed -
18 Sobic.008G096900 protein of unknown function DUF502 domain containing protein, expressed -
19 Sobic.010G035300 WRKY73, expressed -
20 Sobic.010G253700 - -


Gene co-expression network
sample Sobic009G083100 Sobic009G083100 Sobic006G280900 Sobic006G280900 Sobic009G083100--Sobic006G280900 Sobic007G090406 Sobic007G090406 Sobic009G083100--Sobic007G090406 Sobic006G146400 Sobic006G146400 Sobic009G083100--Sobic006G146400 Sobic001G537600 Sobic001G537600 Sobic009G083100--Sobic001G537600 Sobic009G236000 Sobic009G236000 Sobic009G083100--Sobic009G236000 Sobic001G096800 Sobic001G096800 Sobic009G083100--Sobic001G096800 Sobic009G114900 Sobic009G114900 Sobic009G083100--Sobic009G114900 Sobic008G192800 Sobic008G192800 Sobic009G083100--Sobic008G192800 Sobic006G222650 Sobic006G222650 Sobic009G083100--Sobic006G222650 Sobic006G280900--Sobic006G146400 Sobic006G280900--Sobic006G222650 Sobic004G302400 Sobic004G302400 Sobic006G280900--Sobic004G302400 Sobic006G280900--Sobic001G537600 Sobic006G280900--Sobic009G083100 Sobic009G238200 Sobic009G238200 Sobic006G280900--Sobic009G238200 Sobic002G116300 Sobic002G116300 Sobic006G280900--Sobic002G116300 Sobic010G106400 Sobic010G106400 Sobic006G280900--Sobic010G106400 Sobic010G035300 Sobic010G035300 Sobic006G280900--Sobic010G035300 Sobic007G090406--Sobic008G192800 Sobic007G090406--Sobic009G114900 Sobic005G155001 Sobic005G155001 Sobic007G090406--Sobic005G155001 Sobic001G176800 Sobic001G176800 Sobic007G090406--Sobic001G176800 Sobic009G004500 Sobic009G004500 Sobic007G090406--Sobic009G004500 Sobic010G021401 Sobic010G021401 Sobic007G090406--Sobic010G021401 Sobic007G090406--Sobic006G280900 Sobic007G090406--Sobic009G083100 Sobic004G184500 Sobic004G184500 Sobic007G090406--Sobic004G184500 Sobic006G146400--Sobic006G280900 Sobic006G146400--Sobic006G222650 Sobic006G146400--Sobic002G116300 Sobic006G146400--Sobic009G238200 Sobic006G146400--Sobic001G537600 Sobic006G146400--Sobic004G302400 Sobic006G146400--Sobic010G035300 Sobic006G103601 Sobic006G103601 Sobic006G146400--Sobic006G103601 Sobic003G379500 Sobic003G379500 Sobic006G146400--Sobic003G379500 Sobic001G537600--Sobic010G106400 Sobic001G068901 Sobic001G068901 Sobic001G537600--Sobic001G068901 Sobic001G537600--Sobic006G146400 Sobic001G537600--Sobic009G238200 Sobic001G537600--Sobic006G280900 Sobic006G065200 Sobic006G065200 Sobic001G537600--Sobic006G065200 Sobic010G257300 Sobic010G257300 Sobic001G537600--Sobic010G257300 Sobic004G012100 Sobic004G012100 Sobic001G537600--Sobic004G012100 Sobic001G537600--Sobic006G103601 Sobic002G282000 Sobic002G282000 Sobic009G236000--Sobic002G282000 Sobic009G082500 Sobic009G082500 Sobic009G236000--Sobic009G082500 Sobic009G236000--Sobic001G096800 Sobic009G236000--Sobic006G146400 Sobic009G236000--Sobic009G083100 Sobic009G236000--Sobic006G280900 Sobic005G001600 Sobic005G001600 Sobic009G236000--Sobic005G001600 Sobic009G236000--Sobic008G192800 Sobic009G236000--Sobic009G114900 Sobic001G096800--Sobic009G236000 Sobic001G096800--Sobic005G001600 Sobic001G096800--Sobic009G083100 Sobic001G096800--Sobic006G280900 Sobic001G096800--Sobic002G282000 Sobic001G096800--Sobic006G222650 Sobic001G096800--Sobic006G146400 Sobic001G096800--Sobic008G192800 Sobic001G096800--Sobic009G114900 Sobic009G114900--Sobic005G155001 Sobic009G114900--Sobic010G021401 Sobic009G114900--Sobic007G090406 Sobic002G252700 Sobic002G252700 Sobic009G114900--Sobic002G252700 Sobic009G114900--Sobic009G004500 Sobic006G093400 Sobic006G093400 Sobic009G114900--Sobic006G093400 Sobic009G114900--Sobic008G192800 Sobic001G527900 Sobic001G527900 Sobic009G114900--Sobic001G527900 Sobic001G483200 Sobic001G483200 Sobic009G114900--Sobic001G483200 Sobic008G192800--Sobic007G090406 Sobic008G192800--Sobic009G004500 Sobic003G093500 Sobic003G093500 Sobic008G192800--Sobic003G093500 Sobic008G192800--Sobic001G176800 Sobic008G192800--Sobic009G114900 Sobic008G192800--Sobic005G155001 Sobic007G017300 Sobic007G017300 Sobic008G192800--Sobic007G017300 Sobic007G061500 Sobic007G061500 Sobic008G192800--Sobic007G061500 Sobic001G368000 Sobic001G368000 Sobic008G192800--Sobic001G368000 Sobic006G222650--Sobic004G302400 Sobic006G222650--Sobic010G035300 Sobic006G222650--Sobic002G116300 Sobic006G222650--Sobic006G146400 Sobic004G269500 Sobic004G269500 Sobic006G222650--Sobic004G269500 Sobic006G222650--Sobic006G280900 Sobic004G302550 Sobic004G302550 Sobic006G222650--Sobic004G302550 Sobic006G162300 Sobic006G162300 Sobic006G222650--Sobic006G162300 Sobic002G065300 Sobic002G065300 Sobic006G222650--Sobic002G065300
Octagon: transcription factors


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