Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G163000.1
Synonym
Functional annotation hypothetical protein
UniProt A0A1B6QJ87
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
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Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G165900 cyclin, putative, expressed -
2 Sobic.001G353700 expressed protein -
3 Sobic.009G250000 helix-loop-helix DNA-binding protein, putative, expressed -
4 Sobic.005G169900 CDK5RAP1, putative, expressed -
5 Sobic.001G344450 - K02998: RP-SAe, small subunit ribosomal protein SAe
6 Sobic.001G501500 DUF584 domain containing protein, putative, expressed -
7 Sobic.008G120066 - -
8 Sobic.001G520200 glycosylphosphatidylinositol anchor biosynthesis protein 11, putative, expressed K05287: GPI ethanolamine phosphate transferase 2/3 subunit F
9 Sobic.004G230500 - -
10 Sobic.009G038800 SLD5 - Putative GINS complex subunit, expressed K10735: GINS4, GINS complex subunit 4
11 Sobic.008G024550 - -
12 Sobic.009G046500 NBS-LRR disease resistance protein, putative, expressed -
13 Sobic.005G077532 - -
14 Sobic.002G038200 deoxyribonuclease tatD, putative, expressed K03424: TatD DNase family protein
15 Sobic.007G085966 - -
16 Sobic.003G159000 - -
17 Sobic.007G114401 - -
18 Sobic.001G300750 - -
19 Sobic.006G044866 - -
20 Sobic.009G039300 short-chain dehydrogenase/reductase, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic001G163000 Sobic001G163000 Sobic006G165900 Sobic006G165900 Sobic001G163000--Sobic006G165900 Sobic001G353700 Sobic001G353700 Sobic001G163000--Sobic001G353700 Sobic009G250000 Sobic009G250000 Sobic001G163000--Sobic009G250000 Sobic005G169900 Sobic005G169900 Sobic001G163000--Sobic005G169900 Sobic001G344450 Sobic001G344450 Sobic001G163000--Sobic001G344450 Sobic001G501500 Sobic001G501500 Sobic001G163000--Sobic001G501500 Sobic008G120066 Sobic008G120066 Sobic001G163000--Sobic008G120066 Sobic001G520200 Sobic001G520200 Sobic001G163000--Sobic001G520200 Sobic004G230500 Sobic004G230500 Sobic001G163000--Sobic004G230500 Sobic006G165900--Sobic001G163000 Sobic006G165900--Sobic001G501500 Sobic006G165900--Sobic001G353700 Sobic006G165900--Sobic005G169900 Sobic006G165900--Sobic004G230500 Sobic008G152400 Sobic008G152400 Sobic006G165900--Sobic008G152400 Sobic009G046500 Sobic009G046500 Sobic006G165900--Sobic009G046500 Sobic004G179000 Sobic004G179000 Sobic006G165900--Sobic004G179000 Sobic006G165900--Sobic001G344450 Sobic001G353700--Sobic001G163000 Sobic006G044866 Sobic006G044866 Sobic001G353700--Sobic006G044866 Sobic001G353700--Sobic006G165900 Sobic007G114401 Sobic007G114401 Sobic001G353700--Sobic007G114401 Sobic001G353700--Sobic001G501500 Sobic001G353700--Sobic004G230500 Sobic003G159000 Sobic003G159000 Sobic001G353700--Sobic003G159000 Sobic009G247100 Sobic009G247100 Sobic001G353700--Sobic009G247100 Sobic001G353700--Sobic005G169900 Sobic002G038200 Sobic002G038200 Sobic009G250000--Sobic002G038200 Sobic009G250000--Sobic005G169900 Sobic006G142700 Sobic006G142700 Sobic009G250000--Sobic006G142700 Sobic009G250000--Sobic001G520200 Sobic001G124500 Sobic001G124500 Sobic009G250000--Sobic001G124500 Sobic006G181150 Sobic006G181150 Sobic009G250000--Sobic006G181150 Sobic003G194900 Sobic003G194900 Sobic009G250000--Sobic003G194900 Sobic009G250000--Sobic001G163000 Sobic009G038800 Sobic009G038800 Sobic009G250000--Sobic009G038800 Sobic005G169900--Sobic009G250000 Sobic005G169900--Sobic001G124500 Sobic005G169900--Sobic001G163000 Sobic005G169900--Sobic003G194900 Sobic005G169900--Sobic002G038200 Sobic005G169900--Sobic006G142700 Sobic008G013700 Sobic008G013700 Sobic005G169900--Sobic008G013700 Sobic010G150000 Sobic010G150000 Sobic005G169900--Sobic010G150000 Sobic005G169900--Sobic003G159000 Sobic001G344450--Sobic008G120066 Sobic009G039300 Sobic009G039300 Sobic001G344450--Sobic009G039300 Sobic001G096800 Sobic001G096800 Sobic001G344450--Sobic001G096800 Sobic005G002500 Sobic005G002500 Sobic001G344450--Sobic005G002500 Sobic001G344450--Sobic001G163000 Sobic001G344450--Sobic001G501500 Sobic009G114900 Sobic009G114900 Sobic001G344450--Sobic009G114900 Sobic009G236000 Sobic009G236000 Sobic001G344450--Sobic009G236000 Sobic008G192800 Sobic008G192800 Sobic001G344450--Sobic008G192800 Sobic001G501500--Sobic004G230500 Sobic005G077532 Sobic005G077532 Sobic001G501500--Sobic005G077532 Sobic001G501500--Sobic006G165900 Sobic010G009532 Sobic010G009532 Sobic001G501500--Sobic010G009532 Sobic001G501500--Sobic001G163000 Sobic008G152100 Sobic008G152100 Sobic001G501500--Sobic008G152100 Sobic001G501500--Sobic001G344450 Sobic001G501500--Sobic009G039300 Sobic001G501500--Sobic004G179000 Sobic008G120066--Sobic001G344450 Sobic008G120066--Sobic009G039300 Sobic001G300750 Sobic001G300750 Sobic008G120066--Sobic001G300750 Sobic008G120066--Sobic001G096800 Sobic008G120066--Sobic001G163000 Sobic008G120066--Sobic005G002500 Sobic008G120066--Sobic009G114900 Sobic008G120066--Sobic009G236000 Sobic008G120066--Sobic002G038200 Sobic001G520200--Sobic009G250000 Sobic001G520200--Sobic002G038200 Sobic001G520200--Sobic010G150000 Sobic001G520200--Sobic001G124500 Sobic010G178700 Sobic010G178700 Sobic001G520200--Sobic010G178700 Sobic001G520200--Sobic006G142700 Sobic001G520200--Sobic009G038800 Sobic001G520200--Sobic008G013700 Sobic004G125701 Sobic004G125701 Sobic001G520200--Sobic004G125701 Sobic004G230500--Sobic001G501500 Sobic004G230500--Sobic005G077532 Sobic004G230500--Sobic008G152100 Sobic001G180500 Sobic001G180500 Sobic004G230500--Sobic001G180500 Sobic004G230500--Sobic010G009532 Sobic004G230500--Sobic006G165900 Sobic003G385800 Sobic003G385800 Sobic004G230500--Sobic003G385800 Sobic004G230500--Sobic001G353700 Sobic004G230500--Sobic004G179000
Octagon: transcription factors


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