Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G300750.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5S8V7
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G03010 : RNI-like superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os11g42450.1 : leucine-rich repeat family protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G224000 - -
2 Sobic.008G120066 - -
3 Sobic.001G344450 - K02998: RP-SAe, small subunit ribosomal protein SAe
4 Sobic.010G005401 - -
5 Sobic.001G541166 - -
6 Sobic.009G250000 helix-loop-helix DNA-binding protein, putative, expressed -
7 Sobic.001G378150 - -
8 Sobic.001G163000 hypothetical protein -
9 Sobic.007G070600 purine permease, putative, expressed -
10 Sobic.010G069000 - -
11 Sobic.001G535601 - -
12 Sobic.002G188000 receptor kinase, putative, expressed -
13 Sobic.009G039300 short-chain dehydrogenase/reductase, putative, expressed -
14 Sobic.003G239200 lipase, putative, expressed -
15 Sobic.006G181150 - -
16 Sobic.009G038800 SLD5 - Putative GINS complex subunit, expressed K10735: GINS4, GINS complex subunit 4
17 Sobic.005G002500 beta,beta-carotene 9,10-dioxygenase, putative, expressed K17913: carlactone synthase / all-trans-10'-apo-beta-carotenal 13,14-cleaving dioxygenase
18 Sobic.005G091400 - -
19 Sobic.008G024550 - -
20 Sobic.008G064900 growth regulator related protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic001G300750 Sobic001G300750 Sobic003G224000 Sobic003G224000 Sobic001G300750--Sobic003G224000 Sobic008G120066 Sobic008G120066 Sobic001G300750--Sobic008G120066 Sobic001G344450 Sobic001G344450 Sobic001G300750--Sobic001G344450 Sobic010G005401 Sobic010G005401 Sobic001G300750--Sobic010G005401 Sobic001G541166 Sobic001G541166 Sobic001G300750--Sobic001G541166 Sobic009G250000 Sobic009G250000 Sobic001G300750--Sobic009G250000 Sobic001G378150 Sobic001G378150 Sobic001G300750--Sobic001G378150 Sobic001G163000 Sobic001G163000 Sobic001G300750--Sobic001G163000 Sobic007G070600 Sobic007G070600 Sobic001G300750--Sobic007G070600 Sobic001G535601 Sobic001G535601 Sobic003G224000--Sobic001G535601 Sobic002G218200 Sobic002G218200 Sobic003G224000--Sobic002G218200 Sobic003G224000--Sobic007G070600 Sobic001G410800 Sobic001G410800 Sobic003G224000--Sobic001G410800 Sobic003G224000--Sobic010G005401 Sobic006G065200 Sobic006G065200 Sobic003G224000--Sobic006G065200 Sobic010G136601 Sobic010G136601 Sobic003G224000--Sobic010G136601 Sobic003G224000--Sobic001G300750 Sobic001G543600 Sobic001G543600 Sobic003G224000--Sobic001G543600 Sobic008G120066--Sobic001G344450 Sobic009G039300 Sobic009G039300 Sobic008G120066--Sobic009G039300 Sobic008G120066--Sobic001G300750 Sobic001G096800 Sobic001G096800 Sobic008G120066--Sobic001G096800 Sobic008G120066--Sobic001G163000 Sobic005G002500 Sobic005G002500 Sobic008G120066--Sobic005G002500 Sobic009G114900 Sobic009G114900 Sobic008G120066--Sobic009G114900 Sobic009G236000 Sobic009G236000 Sobic008G120066--Sobic009G236000 Sobic002G038200 Sobic002G038200 Sobic008G120066--Sobic002G038200 Sobic001G344450--Sobic008G120066 Sobic001G344450--Sobic009G039300 Sobic001G344450--Sobic001G096800 Sobic001G344450--Sobic005G002500 Sobic001G344450--Sobic001G163000 Sobic001G501500 Sobic001G501500 Sobic001G344450--Sobic001G501500 Sobic001G344450--Sobic009G114900 Sobic001G344450--Sobic009G236000 Sobic008G192800 Sobic008G192800 Sobic001G344450--Sobic008G192800 Sobic010G005401--Sobic003G224000 Sobic010G005401--Sobic001G543600 Sobic010G005401--Sobic001G535601 Sobic002G065300 Sobic002G065300 Sobic010G005401--Sobic002G065300 Sobic001G009200 Sobic001G009200 Sobic010G005401--Sobic001G009200 Sobic009G174600 Sobic009G174600 Sobic010G005401--Sobic009G174600 Sobic004G302400 Sobic004G302400 Sobic010G005401--Sobic004G302400 Sobic007G119300 Sobic007G119300 Sobic010G005401--Sobic007G119300 Sobic010G181000 Sobic010G181000 Sobic010G005401--Sobic010G181000 Sobic005G091400 Sobic005G091400 Sobic001G541166--Sobic005G091400 Sobic006G162300 Sobic006G162300 Sobic001G541166--Sobic006G162300 Sobic004G302550 Sobic004G302550 Sobic001G541166--Sobic004G302550 Sobic004G211501 Sobic004G211501 Sobic001G541166--Sobic004G211501 Sobic001G541166--Sobic004G302400 Sobic006G222650 Sobic006G222650 Sobic001G541166--Sobic006G222650 Sobic003G385800 Sobic003G385800 Sobic001G541166--Sobic003G385800 Sobic008G152100 Sobic008G152100 Sobic001G541166--Sobic008G152100 Sobic010G035300 Sobic010G035300 Sobic001G541166--Sobic010G035300 Sobic009G250000--Sobic002G038200 Sobic005G169900 Sobic005G169900 Sobic009G250000--Sobic005G169900 Sobic006G142700 Sobic006G142700 Sobic009G250000--Sobic006G142700 Sobic001G520200 Sobic001G520200 Sobic009G250000--Sobic001G520200 Sobic001G124500 Sobic001G124500 Sobic009G250000--Sobic001G124500 Sobic006G181150 Sobic006G181150 Sobic009G250000--Sobic006G181150 Sobic003G194900 Sobic003G194900 Sobic009G250000--Sobic003G194900 Sobic009G250000--Sobic001G163000 Sobic009G038800 Sobic009G038800 Sobic009G250000--Sobic009G038800 Sobic002G285950 Sobic002G285950 Sobic001G378150--Sobic002G285950 Sobic001G378150--Sobic007G119300 Sobic010G217466 Sobic010G217466 Sobic001G378150--Sobic010G217466 Sobic009G221701 Sobic009G221701 Sobic001G378150--Sobic009G221701 Sobic002G429200 Sobic002G429200 Sobic001G378150--Sobic002G429200 Sobic002G149550 Sobic002G149550 Sobic001G378150--Sobic002G149550 Sobic002G246950 Sobic002G246950 Sobic001G378150--Sobic002G246950 Sobic003G336400 Sobic003G336400 Sobic001G378150--Sobic003G336400 Sobic001G378150--Sobic003G224000 Sobic006G165900 Sobic006G165900 Sobic001G163000--Sobic006G165900 Sobic001G353700 Sobic001G353700 Sobic001G163000--Sobic001G353700 Sobic001G163000--Sobic009G250000 Sobic001G163000--Sobic005G169900 Sobic001G163000--Sobic001G344450 Sobic001G163000--Sobic001G501500 Sobic001G163000--Sobic008G120066 Sobic001G163000--Sobic001G520200 Sobic004G230500 Sobic004G230500 Sobic001G163000--Sobic004G230500 Sobic007G070600--Sobic003G224000 Sobic007G070600--Sobic001G535601 Sobic007G070600--Sobic001G378150 Sobic005G008301 Sobic005G008301 Sobic007G070600--Sobic005G008301 Sobic001G062400 Sobic001G062400 Sobic007G070600--Sobic001G062400 Sobic003G013400 Sobic003G013400 Sobic007G070600--Sobic003G013400 Sobic005G232200 Sobic005G232200 Sobic007G070600--Sobic005G232200 Sobic007G070600--Sobic002G218200 Sobic001G139600 Sobic001G139600 Sobic007G070600--Sobic001G139600
Octagon: transcription factors


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