Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G188000.1
Synonym Sb02g023590
Functional annotation receptor kinase, putative, expressed
UniProt C5XBE6
Pfam PF07714
Panther DB PTHR27008 PTHR27008:SF10
NCBI CDD KOG1187; Serine/threonine protein kinase
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0006468; protein phosphorylation GO:0004672protein kinase activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G26730 : Leucine-rich repeat protein kinase family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os09g20970.1 : receptor kinase, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a028679 , Zm00025a046806 , Zm00025a053035 , Zm00025a053037 , Zm00025a038475 , Zm00025a035948
Brachypodium KQJ90086 , KQK22829 , KQK02152
Barley HORVU4Hr1G066900.3 , HORVU4Hr1G066900.2 , HORVU4Hr1G066900.1 , HORVU5Hr1G059170.1
Wheat TraesCS4D02G173400 , TraesCS4A02G133400 , TraesCS5B02G197100 , TraesCS3A02G148400 , TraesCS4D02G241100 , TraesCS5A02G198400 , TraesCS5D02G204300 , TraesCS4A02G064200 , TraesCS4B02G241500
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G064900 growth regulator related protein, putative, expressed -
2 Sobic.003G378500 expressed protein -
3 Sobic.004G019700 expressed protein -
4 Sobic.010G008500 expressed protein -
5 Sobic.009G038800 SLD5 - Putative GINS complex subunit, expressed K10735: GINS4, GINS complex subunit 4
6 Sobic.008G173700 cyclic nucleotide-gated ion channel, putative, expressed K05391: cyclic nucleotide gated channel, plant
7 Sobic.007G047450 - -
8 Sobic.008G013700 - -
9 Sobic.004G302550 - -
10 Sobic.009G250000 helix-loop-helix DNA-binding protein, putative, expressed -
11 Sobic.004G177400 T-complex protein 11, putative, expressed -
12 Sobic.006G142700 expressed protein -
13 Sobic.001G300750 - -
14 Sobic.001G302100 holliday junction resolvase, putative, expressed K07447: putative holliday junction resolvase
15 Sobic.002G426650 - -
16 Sobic.001G124500 elongation of fatty acids protein 2, putative, expressed -
17 Sobic.001G541166 - -
18 Sobic.006G181150 - -
19 Sobic.001G477100 purine permease, putative, expressed -
20 Sobic.003G249300 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic002G188000 Sobic002G188000 Sobic008G064900 Sobic008G064900 Sobic002G188000--Sobic008G064900 Sobic003G378500 Sobic003G378500 Sobic002G188000--Sobic003G378500 Sobic004G019700 Sobic004G019700 Sobic002G188000--Sobic004G019700 Sobic010G008500 Sobic010G008500 Sobic002G188000--Sobic010G008500 Sobic009G038800 Sobic009G038800 Sobic002G188000--Sobic009G038800 Sobic008G173700 Sobic008G173700 Sobic002G188000--Sobic008G173700 Sobic007G047450 Sobic007G047450 Sobic002G188000--Sobic007G047450 Sobic008G013700 Sobic008G013700 Sobic002G188000--Sobic008G013700 Sobic004G302550 Sobic004G302550 Sobic002G188000--Sobic004G302550 Sobic008G064900--Sobic004G302550 Sobic008G064900--Sobic008G173700 Sobic004G177400 Sobic004G177400 Sobic008G064900--Sobic004G177400 Sobic002G426650 Sobic002G426650 Sobic008G064900--Sobic002G426650 Sobic008G064900--Sobic003G378500 Sobic008G064900--Sobic002G188000 Sobic005G091400 Sobic005G091400 Sobic008G064900--Sobic005G091400 Sobic008G112400 Sobic008G112400 Sobic008G064900--Sobic008G112400 Sobic001G541166 Sobic001G541166 Sobic008G064900--Sobic001G541166 Sobic003G378500--Sobic004G019700 Sobic003G378500--Sobic008G064900 Sobic003G378500--Sobic008G173700 Sobic008G019466 Sobic008G019466 Sobic003G378500--Sobic008G019466 Sobic001G124500 Sobic001G124500 Sobic003G378500--Sobic001G124500 Sobic003G378500--Sobic004G177400 Sobic003G378500--Sobic008G013700 Sobic004G192001 Sobic004G192001 Sobic003G378500--Sobic004G192001 Sobic003G378500--Sobic002G188000 Sobic004G019700--Sobic001G124500 Sobic004G019700--Sobic004G192001 Sobic004G019700--Sobic008G013700 Sobic004G019700--Sobic003G378500 Sobic007G099300 Sobic007G099300 Sobic004G019700--Sobic007G099300 Sobic010G178700 Sobic010G178700 Sobic004G019700--Sobic010G178700 Sobic001G302100 Sobic001G302100 Sobic004G019700--Sobic001G302100 Sobic004G125600 Sobic004G125600 Sobic004G019700--Sobic004G125600 Sobic006G142700 Sobic006G142700 Sobic004G019700--Sobic006G142700 Sobic010G008500--Sobic002G188000 Sobic010G008500--Sobic009G038800 Sobic006G181150 Sobic006G181150 Sobic010G008500--Sobic006G181150 Sobic010G008500--Sobic008G064900 Sobic009G250000 Sobic009G250000 Sobic010G008500--Sobic009G250000 Sobic001G477100 Sobic001G477100 Sobic010G008500--Sobic001G477100 Sobic010G008500--Sobic003G378500 Sobic010G008500--Sobic001G541166 Sobic010G008500--Sobic004G019700 Sobic009G038800--Sobic008G013700 Sobic009G038800--Sobic001G124500 Sobic009G038800--Sobic009G250000 Sobic002G038200 Sobic002G038200 Sobic009G038800--Sobic002G038200 Sobic001G520200 Sobic001G520200 Sobic009G038800--Sobic001G520200 Sobic009G038800--Sobic010G178700 Sobic009G038800--Sobic004G019700 Sobic005G001600 Sobic005G001600 Sobic009G038800--Sobic005G001600 Sobic009G038800--Sobic008G173700 Sobic008G173700--Sobic004G177400 Sobic008G173700--Sobic004G302550 Sobic008G173700--Sobic008G064900 Sobic008G173700--Sobic005G091400 Sobic008G173700--Sobic001G541166 Sobic006G222650 Sobic006G222650 Sobic008G173700--Sobic006G222650 Sobic008G173700--Sobic005G001600 Sobic008G173700--Sobic008G112400 Sobic004G211501 Sobic004G211501 Sobic008G173700--Sobic004G211501 Sobic007G047450--Sobic008G013700 Sobic003G249300 Sobic003G249300 Sobic007G047450--Sobic003G249300 Sobic001G540250 Sobic001G540250 Sobic007G047450--Sobic001G540250 Sobic007G047450--Sobic004G019700 Sobic007G047450--Sobic001G302100 Sobic007G047450--Sobic001G124500 Sobic007G047450--Sobic004G192001 Sobic007G047450--Sobic007G099300 Sobic006G243900 Sobic006G243900 Sobic007G047450--Sobic006G243900 Sobic008G013700--Sobic001G124500 Sobic008G013700--Sobic004G019700 Sobic008G013700--Sobic004G192001 Sobic004G125701 Sobic004G125701 Sobic008G013700--Sobic004G125701 Sobic008G013700--Sobic007G099300 Sobic008G013700--Sobic004G125600 Sobic008G013700--Sobic010G178700 Sobic004G224400 Sobic004G224400 Sobic008G013700--Sobic004G224400 Sobic008G013700--Sobic009G038800 Sobic004G302550--Sobic004G177400 Sobic004G302550--Sobic006G222650 Sobic004G302550--Sobic005G091400 Sobic004G302400 Sobic004G302400 Sobic004G302550--Sobic004G302400 Sobic004G302550--Sobic008G173700 Sobic002G065300 Sobic002G065300 Sobic004G302550--Sobic002G065300 Sobic004G302550--Sobic004G211501 Sobic004G269500 Sobic004G269500 Sobic004G302550--Sobic004G269500 Sobic010G035300 Sobic010G035300 Sobic004G302550--Sobic010G035300
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.