Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G008500.2
Synonym
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A194YGQ0
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os10g41910.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G188000 receptor kinase, putative, expressed -
2 Sobic.009G038800 SLD5 - Putative GINS complex subunit, expressed K10735: GINS4, GINS complex subunit 4
3 Sobic.006G181150 - -
4 Sobic.008G064900 growth regulator related protein, putative, expressed -
5 Sobic.009G250000 helix-loop-helix DNA-binding protein, putative, expressed -
6 Sobic.001G477100 purine permease, putative, expressed -
7 Sobic.003G378500 expressed protein -
8 Sobic.001G541166 - -
9 Sobic.004G019700 expressed protein -
10 Sobic.002G004200 expressed protein -
11 Sobic.008G173700 cyclic nucleotide-gated ion channel, putative, expressed K05391: cyclic nucleotide gated channel, plant
12 Sobic.006G142700 expressed protein -
13 Sobic.004G302550 - -
14 Sobic.008G152100 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed -
15 Sobic.004G177400 T-complex protein 11, putative, expressed -
16 Sobic.005G077532 - -
17 Sobic.005G091400 - -
18 Sobic.001G124500 elongation of fatty acids protein 2, putative, expressed -
19 Sobic.001G300750 - -
20 Sobic.001G520200 glycosylphosphatidylinositol anchor biosynthesis protein 11, putative, expressed K05287: GPI ethanolamine phosphate transferase 2/3 subunit F


Gene co-expression network
sample Sobic010G008500 Sobic010G008500 Sobic002G188000 Sobic002G188000 Sobic010G008500--Sobic002G188000 Sobic009G038800 Sobic009G038800 Sobic010G008500--Sobic009G038800 Sobic006G181150 Sobic006G181150 Sobic010G008500--Sobic006G181150 Sobic008G064900 Sobic008G064900 Sobic010G008500--Sobic008G064900 Sobic009G250000 Sobic009G250000 Sobic010G008500--Sobic009G250000 Sobic001G477100 Sobic001G477100 Sobic010G008500--Sobic001G477100 Sobic003G378500 Sobic003G378500 Sobic010G008500--Sobic003G378500 Sobic001G541166 Sobic001G541166 Sobic010G008500--Sobic001G541166 Sobic004G019700 Sobic004G019700 Sobic010G008500--Sobic004G019700 Sobic002G188000--Sobic008G064900 Sobic002G188000--Sobic003G378500 Sobic002G188000--Sobic004G019700 Sobic002G188000--Sobic010G008500 Sobic002G188000--Sobic009G038800 Sobic008G173700 Sobic008G173700 Sobic002G188000--Sobic008G173700 Sobic007G047450 Sobic007G047450 Sobic002G188000--Sobic007G047450 Sobic008G013700 Sobic008G013700 Sobic002G188000--Sobic008G013700 Sobic004G302550 Sobic004G302550 Sobic002G188000--Sobic004G302550 Sobic009G038800--Sobic008G013700 Sobic001G124500 Sobic001G124500 Sobic009G038800--Sobic001G124500 Sobic009G038800--Sobic009G250000 Sobic002G038200 Sobic002G038200 Sobic009G038800--Sobic002G038200 Sobic001G520200 Sobic001G520200 Sobic009G038800--Sobic001G520200 Sobic010G178700 Sobic010G178700 Sobic009G038800--Sobic010G178700 Sobic009G038800--Sobic004G019700 Sobic005G001600 Sobic005G001600 Sobic009G038800--Sobic005G001600 Sobic009G038800--Sobic008G173700 Sobic008G152100 Sobic008G152100 Sobic006G181150--Sobic008G152100 Sobic005G077532 Sobic005G077532 Sobic006G181150--Sobic005G077532 Sobic006G181150--Sobic009G250000 Sobic006G181150--Sobic001G541166 Sobic006G181150--Sobic008G173700 Sobic007G016300 Sobic007G016300 Sobic006G181150--Sobic007G016300 Sobic003G385800 Sobic003G385800 Sobic006G181150--Sobic003G385800 Sobic006G181150--Sobic004G302550 Sobic002G331200 Sobic002G331200 Sobic006G181150--Sobic002G331200 Sobic008G064900--Sobic004G302550 Sobic008G064900--Sobic008G173700 Sobic004G177400 Sobic004G177400 Sobic008G064900--Sobic004G177400 Sobic002G426650 Sobic002G426650 Sobic008G064900--Sobic002G426650 Sobic008G064900--Sobic003G378500 Sobic008G064900--Sobic002G188000 Sobic005G091400 Sobic005G091400 Sobic008G064900--Sobic005G091400 Sobic008G112400 Sobic008G112400 Sobic008G064900--Sobic008G112400 Sobic008G064900--Sobic001G541166 Sobic009G250000--Sobic002G038200 Sobic005G169900 Sobic005G169900 Sobic009G250000--Sobic005G169900 Sobic006G142700 Sobic006G142700 Sobic009G250000--Sobic006G142700 Sobic009G250000--Sobic001G520200 Sobic009G250000--Sobic001G124500 Sobic009G250000--Sobic006G181150 Sobic003G194900 Sobic003G194900 Sobic009G250000--Sobic003G194900 Sobic001G163000 Sobic001G163000 Sobic009G250000--Sobic001G163000 Sobic009G250000--Sobic009G038800 Sobic004G192001 Sobic004G192001 Sobic001G477100--Sobic004G192001 Sobic001G477100--Sobic008G013700 Sobic001G477100--Sobic001G520200 Sobic001G477100--Sobic001G124500 Sobic001G540250 Sobic001G540250 Sobic001G477100--Sobic001G540250 Sobic003G249300 Sobic003G249300 Sobic001G477100--Sobic003G249300 Sobic007G099300 Sobic007G099300 Sobic001G477100--Sobic007G099300 Sobic004G125701 Sobic004G125701 Sobic001G477100--Sobic004G125701 Sobic001G217800 Sobic001G217800 Sobic001G477100--Sobic001G217800 Sobic003G378500--Sobic004G019700 Sobic003G378500--Sobic008G064900 Sobic003G378500--Sobic008G173700 Sobic008G019466 Sobic008G019466 Sobic003G378500--Sobic008G019466 Sobic003G378500--Sobic001G124500 Sobic003G378500--Sobic004G177400 Sobic003G378500--Sobic008G013700 Sobic003G378500--Sobic004G192001 Sobic003G378500--Sobic002G188000 Sobic001G541166--Sobic005G091400 Sobic006G162300 Sobic006G162300 Sobic001G541166--Sobic006G162300 Sobic001G541166--Sobic004G302550 Sobic004G211501 Sobic004G211501 Sobic001G541166--Sobic004G211501 Sobic004G302400 Sobic004G302400 Sobic001G541166--Sobic004G302400 Sobic006G222650 Sobic006G222650 Sobic001G541166--Sobic006G222650 Sobic001G541166--Sobic003G385800 Sobic001G541166--Sobic008G152100 Sobic010G035300 Sobic010G035300 Sobic001G541166--Sobic010G035300 Sobic004G019700--Sobic001G124500 Sobic004G019700--Sobic004G192001 Sobic004G019700--Sobic008G013700 Sobic004G019700--Sobic003G378500 Sobic004G019700--Sobic007G099300 Sobic004G019700--Sobic010G178700 Sobic001G302100 Sobic001G302100 Sobic004G019700--Sobic001G302100 Sobic004G125600 Sobic004G125600 Sobic004G019700--Sobic004G125600 Sobic004G019700--Sobic006G142700
Octagon: transcription factors


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