Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G004200.1
Synonym Sb02g000570
Functional annotation expressed protein
UniProt C5X754
Pfam PF04578 PF13968
Panther DB PTHR31325 PTHR31325:SF32
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G45480 : Protein of unknown function (DUF594)
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g01520.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a016262
Brachypodium KQK21222 , KQK21223
Barley -
Wheat TraesCS3D02G531100 , TraesCS6B02G106000 , TraesCS5A02G358100
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G152100 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed -
2 Sobic.005G077532 - -
3 Sobic.006G181150 - -
4 Sobic.001G541166 - -
5 Sobic.003G385800 - -
6 Sobic.005G091400 - -
7 Sobic.004G211501 - -
8 Sobic.001G520700 expressed protein -
9 Sobic.002G188000 receptor kinase, putative, expressed -
10 Sobic.009G083000 OsRhmbd12 - Putative Rhomboid homologue, expressed -
11 Sobic.006G162300 expressed protein -
12 Sobic.004G177400 T-complex protein 11, putative, expressed -
13 Sobic.010G008500 expressed protein -
14 Sobic.008G173700 cyclic nucleotide-gated ion channel, putative, expressed K05391: cyclic nucleotide gated channel, plant
15 Sobic.004G302550 - -
16 Sobic.004G230500 - -
17 Sobic.004G100400 thaumatin-like protein 1 precursor, putative, expressed -
18 Sobic.008G064900 growth regulator related protein, putative, expressed -
19 Sobic.008G015000 cytochrome P450, putative, expressed -
20 Sobic.004G001900 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic002G004200 Sobic002G004200 Sobic008G152100 Sobic008G152100 Sobic002G004200--Sobic008G152100 Sobic005G077532 Sobic005G077532 Sobic002G004200--Sobic005G077532 Sobic006G181150 Sobic006G181150 Sobic002G004200--Sobic006G181150 Sobic001G541166 Sobic001G541166 Sobic002G004200--Sobic001G541166 Sobic003G385800 Sobic003G385800 Sobic002G004200--Sobic003G385800 Sobic005G091400 Sobic005G091400 Sobic002G004200--Sobic005G091400 Sobic004G211501 Sobic004G211501 Sobic002G004200--Sobic004G211501 Sobic001G520700 Sobic001G520700 Sobic002G004200--Sobic001G520700 Sobic002G188000 Sobic002G188000 Sobic002G004200--Sobic002G188000 Sobic008G152100--Sobic005G077532 Sobic008G152100--Sobic003G385800 Sobic008G152100--Sobic001G541166 Sobic010G009532 Sobic010G009532 Sobic008G152100--Sobic010G009532 Sobic008G152100--Sobic006G181150 Sobic008G152100--Sobic005G091400 Sobic004G230500 Sobic004G230500 Sobic008G152100--Sobic004G230500 Sobic007G045800 Sobic007G045800 Sobic008G152100--Sobic007G045800 Sobic002G165401 Sobic002G165401 Sobic008G152100--Sobic002G165401 Sobic005G077532--Sobic008G152100 Sobic001G501500 Sobic001G501500 Sobic005G077532--Sobic001G501500 Sobic005G077532--Sobic004G230500 Sobic005G077532--Sobic006G181150 Sobic005G077532--Sobic010G009532 Sobic001G180500 Sobic001G180500 Sobic005G077532--Sobic001G180500 Sobic005G077532--Sobic001G541166 Sobic005G077532--Sobic007G045800 Sobic005G077532--Sobic003G385800 Sobic006G181150--Sobic008G152100 Sobic006G181150--Sobic005G077532 Sobic009G250000 Sobic009G250000 Sobic006G181150--Sobic009G250000 Sobic006G181150--Sobic001G541166 Sobic008G173700 Sobic008G173700 Sobic006G181150--Sobic008G173700 Sobic007G016300 Sobic007G016300 Sobic006G181150--Sobic007G016300 Sobic006G181150--Sobic003G385800 Sobic004G302550 Sobic004G302550 Sobic006G181150--Sobic004G302550 Sobic002G331200 Sobic002G331200 Sobic006G181150--Sobic002G331200 Sobic001G541166--Sobic005G091400 Sobic006G162300 Sobic006G162300 Sobic001G541166--Sobic006G162300 Sobic001G541166--Sobic004G302550 Sobic001G541166--Sobic004G211501 Sobic004G302400 Sobic004G302400 Sobic001G541166--Sobic004G302400 Sobic006G222650 Sobic006G222650 Sobic001G541166--Sobic006G222650 Sobic001G541166--Sobic003G385800 Sobic001G541166--Sobic008G152100 Sobic010G035300 Sobic010G035300 Sobic001G541166--Sobic010G035300 Sobic003G385800--Sobic008G152100 Sobic003G385800--Sobic001G541166 Sobic006G180500 Sobic006G180500 Sobic003G385800--Sobic006G180500 Sobic003G385800--Sobic005G091400 Sobic003G385800--Sobic002G165401 Sobic008G119000 Sobic008G119000 Sobic003G385800--Sobic008G119000 Sobic003G385800--Sobic001G520700 Sobic001G481201 Sobic001G481201 Sobic003G385800--Sobic001G481201 Sobic009G082400 Sobic009G082400 Sobic003G385800--Sobic009G082400 Sobic005G091400--Sobic001G541166 Sobic005G091400--Sobic006G162300 Sobic005G091400--Sobic004G211501 Sobic005G091400--Sobic004G302550 Sobic005G091400--Sobic010G035300 Sobic005G091400--Sobic004G302400 Sobic005G091400--Sobic006G222650 Sobic002G116300 Sobic002G116300 Sobic005G091400--Sobic002G116300 Sobic004G001900 Sobic004G001900 Sobic005G091400--Sobic004G001900 Sobic004G211501--Sobic006G162300 Sobic007G161450 Sobic007G161450 Sobic004G211501--Sobic007G161450 Sobic004G211501--Sobic005G091400 Sobic004G211501--Sobic004G001900 Sobic004G211501--Sobic010G035300 Sobic004G211501--Sobic004G302550 Sobic004G211501--Sobic001G520700 Sobic004G211501--Sobic006G180500 Sobic004G211501--Sobic004G302400 Sobic001G520700--Sobic001G481201 Sobic001G520700--Sobic007G161450 Sobic007G204500 Sobic007G204500 Sobic001G520700--Sobic007G204500 Sobic001G493800 Sobic001G493800 Sobic001G520700--Sobic001G493800 Sobic010G179150 Sobic010G179150 Sobic001G520700--Sobic010G179150 Sobic001G520700--Sobic006G180500 Sobic001G520700--Sobic004G001900 Sobic001G520700--Sobic002G165401 Sobic007G111600 Sobic007G111600 Sobic001G520700--Sobic007G111600 Sobic008G064900 Sobic008G064900 Sobic002G188000--Sobic008G064900 Sobic003G378500 Sobic003G378500 Sobic002G188000--Sobic003G378500 Sobic004G019700 Sobic004G019700 Sobic002G188000--Sobic004G019700 Sobic010G008500 Sobic010G008500 Sobic002G188000--Sobic010G008500 Sobic009G038800 Sobic009G038800 Sobic002G188000--Sobic009G038800 Sobic002G188000--Sobic008G173700 Sobic007G047450 Sobic007G047450 Sobic002G188000--Sobic007G047450 Sobic008G013700 Sobic008G013700 Sobic002G188000--Sobic008G013700 Sobic002G188000--Sobic004G302550
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.