Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G100400.1
Synonym ATTLP1, TLP1
Functional annotation thaumatin-like protein 1 precursor, putative, expressed
UniProt A0A194YNT8
Pfam PF00314
Panther DB PTHR31048 PTHR31048:SF4
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G24180 : THAUMATIN-LIKE PROTEIN 1
RAP-DB (Rice) LOC_Os09g36580.1 : thaumatin, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a017965
Brachypodium -
Barley HORVU3Hr1G035410.1 , HORVU2Hr1G125500.2 , HORVU2Hr1G125500.1
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G119000 cysteine protease, putative, expressed -
2 Sobic.009G085600 acetyltransferase, GNAT family, putative, expressed -
3 Sobic.001G460800 nucleotidyltransferase, putative, expressed -
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5 Sobic.003G167825 - -
6 Sobic.003G126400 expressed protein -
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8 Sobic.007G116600 5-AMP-activated protein kinase beta-1 subunit-related, putative, expressed -
9 Sobic.006G162300 expressed protein -
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11 Sobic.006G180500 - -
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13 Sobic.003G099500 invertase/pectin methylesterase inhibitor family protein, putative, expressed -
14 Sobic.010G136601 - -
15 Sobic.001G525000 polygalacturonase, putative, expressed -
16 Sobic.006G058300 expressed protein -
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18 Sobic.003G120400 expressed protein -
19 Sobic.001G223400 glucosyltransferase, putative, expressed -
20 Sobic.006G229600 serine/threonine-protein kinase receptor precursor, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic004G100400 Sobic004G100400 Sobic008G119000 Sobic008G119000 Sobic004G100400--Sobic008G119000 Sobic009G085600 Sobic009G085600 Sobic004G100400--Sobic009G085600 Sobic001G460800 Sobic001G460800 Sobic004G100400--Sobic001G460800 Sobic006G069050 Sobic006G069050 Sobic004G100400--Sobic006G069050 Sobic003G167825 Sobic003G167825 Sobic004G100400--Sobic003G167825 Sobic003G126400 Sobic003G126400 Sobic004G100400--Sobic003G126400 Sobic003G038300 Sobic003G038300 Sobic004G100400--Sobic003G038300 Sobic007G116600 Sobic007G116600 Sobic004G100400--Sobic007G116600 Sobic006G162300 Sobic006G162300 Sobic004G100400--Sobic006G162300 Sobic008G119000--Sobic009G085600 Sobic006G180500 Sobic006G180500 Sobic008G119000--Sobic006G180500 Sobic007G204500 Sobic007G204500 Sobic008G119000--Sobic007G204500 Sobic004G016600 Sobic004G016600 Sobic008G119000--Sobic004G016600 Sobic008G119000--Sobic003G167825 Sobic008G119000--Sobic007G116600 Sobic006G222800 Sobic006G222800 Sobic008G119000--Sobic006G222800 Sobic009G082400 Sobic009G082400 Sobic008G119000--Sobic009G082400 Sobic004G251350 Sobic004G251350 Sobic008G119000--Sobic004G251350 Sobic009G085600--Sobic003G167825 Sobic009G085600--Sobic008G119000 Sobic002G004100 Sobic002G004100 Sobic009G085600--Sobic002G004100 Sobic009G085600--Sobic004G016600 Sobic009G085600--Sobic007G116600 Sobic009G085600--Sobic006G180500 Sobic007G111600 Sobic007G111600 Sobic009G085600--Sobic007G111600 Sobic009G085600--Sobic007G204500 Sobic001G016900 Sobic001G016900 Sobic009G085600--Sobic001G016900 Sobic001G525000 Sobic001G525000 Sobic001G460800--Sobic001G525000 Sobic001G460800--Sobic003G167825 Sobic001G460800--Sobic002G004100 Sobic002G320900 Sobic002G320900 Sobic001G460800--Sobic002G320900 Sobic003G120400 Sobic003G120400 Sobic001G460800--Sobic003G120400 Sobic007G093400 Sobic007G093400 Sobic001G460800--Sobic007G093400 Sobic001G460800--Sobic009G085600 Sobic002G284901 Sobic002G284901 Sobic001G460800--Sobic002G284901 Sobic001G460800--Sobic001G016900 Sobic006G069050--Sobic003G126400 Sobic006G069050--Sobic003G038300 Sobic004G152501 Sobic004G152501 Sobic006G069050--Sobic004G152501 Sobic001G115900 Sobic001G115900 Sobic006G069050--Sobic001G115900 Sobic003G065001 Sobic003G065001 Sobic006G069050--Sobic003G065001 Sobic006G058300 Sobic006G058300 Sobic006G069050--Sobic006G058300 Sobic010G201000 Sobic010G201000 Sobic006G069050--Sobic010G201000 Sobic006G069050--Sobic003G167825 Sobic010G074980 Sobic010G074980 Sobic006G069050--Sobic010G074980 Sobic003G167825--Sobic009G085600 Sobic003G167825--Sobic001G460800 Sobic003G167825--Sobic002G004100 Sobic003G167825--Sobic004G016600 Sobic003G167825--Sobic008G119000 Sobic003G167825--Sobic003G038300 Sobic003G167825--Sobic001G016900 Sobic002G285800 Sobic002G285800 Sobic003G167825--Sobic002G285800 Sobic003G167825--Sobic003G126400 Sobic003G126400--Sobic006G069050 Sobic003G126400--Sobic001G115900 Sobic003G126400--Sobic003G038300 Sobic003G427500 Sobic003G427500 Sobic003G126400--Sobic003G427500 Sobic003G126400--Sobic003G167825 Sobic003G126400--Sobic010G201000 Sobic003G126400--Sobic007G093400 Sobic003G126400--Sobic003G065001 Sobic003G126400--Sobic004G152501 Sobic003G038300--Sobic003G126400 Sobic003G038300--Sobic003G167825 Sobic003G038300--Sobic009G085600 Sobic003G038300--Sobic006G069050 Sobic003G038300--Sobic001G115900 Sobic003G038300--Sobic004G016600 Sobic003G038300--Sobic010G201000 Sobic003G038300--Sobic001G016900 Sobic003G038300--Sobic004G152501 Sobic007G116600--Sobic007G111600 Sobic007G013100 Sobic007G013100 Sobic007G116600--Sobic007G013100 Sobic003G099500 Sobic003G099500 Sobic007G116600--Sobic003G099500 Sobic007G116600--Sobic001G016900 Sobic007G116600--Sobic007G204500 Sobic004G239000 Sobic004G239000 Sobic007G116600--Sobic004G239000 Sobic008G131800 Sobic008G131800 Sobic007G116600--Sobic008G131800 Sobic010G179150 Sobic010G179150 Sobic007G116600--Sobic010G179150 Sobic007G116600--Sobic004G251350 Sobic005G091400 Sobic005G091400 Sobic006G162300--Sobic005G091400 Sobic004G211501 Sobic004G211501 Sobic006G162300--Sobic004G211501 Sobic007G161450 Sobic007G161450 Sobic006G162300--Sobic007G161450 Sobic010G035300 Sobic010G035300 Sobic006G162300--Sobic010G035300 Sobic004G302400 Sobic004G302400 Sobic006G162300--Sobic004G302400 Sobic006G222650 Sobic006G222650 Sobic006G162300--Sobic006G222650 Sobic006G162300--Sobic006G180500 Sobic006G162300--Sobic008G119000 Sobic006G162300--Sobic009G085600
Octagon: transcription factors


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