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Transcriptome id Sobic.010G136601.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1W0VSV8
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G223400 glucosyltransferase, putative, expressed -
2 Sobic.002G285800 "domain confirmed by Pfam database, expression not supported"(PubMedID : 20499123)@OsSAUR52 - Auxin-responsive SAUR gene family member, expressed -
3 Sobic.001G460800 nucleotidyltransferase, putative, expressed -
4 Sobic.003G427500 cytochrome P450, putative, expressed -
5 Sobic.004G357033 - -
6 Sobic.002G320900 patatin-like phospholipase family protein, expressed -
7 Sobic.003G167825 - -
8 Sobic.006G065700 DUF677 domain containing protein, putative, expressed -
9 Sobic.007G093400 - -
10 Sobic.001G519300 plasma membrane ATPase, putative, expressed K01535: PMA1, H+-transporting ATPase
11 Sobic.001G410800 OsTOP6A3 - Topoisomerase 6 subunit A homolog 3, expressed K10878: meiotic recombination protein SPO11
12 Sobic.002G284901 - -
13 Sobic.001G525000 polygalacturonase, putative, expressed -
14 Sobic.007G224600 - -
15 Sobic.010G074980 - -
16 Sobic.003G120400 expressed protein -
17 Sobic.002G210200 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during salt-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@Core histone H2A/H2B/H3/H4 domain containing protein, putative, expressed K11252: histone H2B
18 Sobic.003G126400 expressed protein -
19 Sobic.003G200501 - K11252: histone H2B
20 Sobic.002G004100 kinesin motor domain containing protein, putative, expressed K10405: kinesin family member C1


Gene co-expression network
sample Sobic010G136601 Sobic010G136601 Sobic001G223400 Sobic001G223400 Sobic010G136601--Sobic001G223400 Sobic002G285800 Sobic002G285800 Sobic010G136601--Sobic002G285800 Sobic001G460800 Sobic001G460800 Sobic010G136601--Sobic001G460800 Sobic003G427500 Sobic003G427500 Sobic010G136601--Sobic003G427500 Sobic004G357033 Sobic004G357033 Sobic010G136601--Sobic004G357033 Sobic002G320900 Sobic002G320900 Sobic010G136601--Sobic002G320900 Sobic003G167825 Sobic003G167825 Sobic010G136601--Sobic003G167825 Sobic006G065700 Sobic006G065700 Sobic010G136601--Sobic006G065700 Sobic007G093400 Sobic007G093400 Sobic010G136601--Sobic007G093400 Sobic001G223400--Sobic010G136601 Sobic001G519300 Sobic001G519300 Sobic001G223400--Sobic001G519300 Sobic001G223400--Sobic006G065700 Sobic001G223400--Sobic002G320900 Sobic001G223400--Sobic001G460800 Sobic001G223400--Sobic002G285800 Sobic001G223400--Sobic004G357033 Sobic001G223400--Sobic003G427500 Sobic002G284901 Sobic002G284901 Sobic001G223400--Sobic002G284901 Sobic002G285800--Sobic010G136601 Sobic002G285800--Sobic003G167825 Sobic002G285800--Sobic001G460800 Sobic002G285800--Sobic003G427500 Sobic002G285800--Sobic001G223400 Sobic009G085600 Sobic009G085600 Sobic002G285800--Sobic009G085600 Sobic002G285800--Sobic004G357033 Sobic006G103601 Sobic006G103601 Sobic002G285800--Sobic006G103601 Sobic009G238200 Sobic009G238200 Sobic002G285800--Sobic009G238200 Sobic001G525000 Sobic001G525000 Sobic001G460800--Sobic001G525000 Sobic001G460800--Sobic003G167825 Sobic002G004100 Sobic002G004100 Sobic001G460800--Sobic002G004100 Sobic001G460800--Sobic002G320900 Sobic003G120400 Sobic003G120400 Sobic001G460800--Sobic003G120400 Sobic001G460800--Sobic007G093400 Sobic001G460800--Sobic009G085600 Sobic001G460800--Sobic002G284901 Sobic001G016900 Sobic001G016900 Sobic001G460800--Sobic001G016900 Sobic010G074980 Sobic010G074980 Sobic003G427500--Sobic010G074980 Sobic003G126400 Sobic003G126400 Sobic003G427500--Sobic003G126400 Sobic003G427500--Sobic006G065700 Sobic003G427500--Sobic007G093400 Sobic004G082151 Sobic004G082151 Sobic003G427500--Sobic004G082151 Sobic010G201000 Sobic010G201000 Sobic003G427500--Sobic010G201000 Sobic003G427500--Sobic003G167825 Sobic003G427500--Sobic002G320900 Sobic003G427500--Sobic003G120400 Sobic004G344301 Sobic004G344301 Sobic004G357033--Sobic004G344301 Sobic001G220200 Sobic001G220200 Sobic004G357033--Sobic001G220200 Sobic004G225450 Sobic004G225450 Sobic004G357033--Sobic004G225450 Sobic004G357066 Sobic004G357066 Sobic004G357033--Sobic004G357066 Sobic001G410800 Sobic001G410800 Sobic004G357033--Sobic001G410800 Sobic004G357033--Sobic010G136601 Sobic004G357033--Sobic001G223400 Sobic010G158766 Sobic010G158766 Sobic004G357033--Sobic010G158766 Sobic004G357033--Sobic002G285800 Sobic002G320900--Sobic002G284901 Sobic002G320900--Sobic001G525000 Sobic002G320900--Sobic003G120400 Sobic002G210200 Sobic002G210200 Sobic002G320900--Sobic002G210200 Sobic003G200501 Sobic003G200501 Sobic002G320900--Sobic003G200501 Sobic002G320900--Sobic007G093400 Sobic002G320900--Sobic006G065700 Sobic002G320900--Sobic001G460800 Sobic003G367401 Sobic003G367401 Sobic002G320900--Sobic003G367401 Sobic003G167825--Sobic009G085600 Sobic003G167825--Sobic001G460800 Sobic003G167825--Sobic002G004100 Sobic004G016600 Sobic004G016600 Sobic003G167825--Sobic004G016600 Sobic008G119000 Sobic008G119000 Sobic003G167825--Sobic008G119000 Sobic003G038300 Sobic003G038300 Sobic003G167825--Sobic003G038300 Sobic003G167825--Sobic001G016900 Sobic003G167825--Sobic002G285800 Sobic003G167825--Sobic003G126400 Sobic006G065700--Sobic002G320900 Sobic006G065700--Sobic002G284901 Sobic006G065700--Sobic007G093400 Sobic006G065700--Sobic002G210200 Sobic006G065700--Sobic003G200501 Sobic006G065700--Sobic003G120400 Sobic006G065700--Sobic001G525000 Sobic006G065700--Sobic010G074980 Sobic006G065700--Sobic003G427500 Sobic007G093400--Sobic003G120400 Sobic007G093400--Sobic002G320900 Sobic007G093400--Sobic001G525000 Sobic007G093400--Sobic010G201000 Sobic007G093400--Sobic003G367401 Sobic003G065001 Sobic003G065001 Sobic007G093400--Sobic003G065001 Sobic007G093400--Sobic002G210200 Sobic007G093400--Sobic003G200501 Sobic007G093400--Sobic010G074980
Octagon: transcription factors


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