Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G083000.1
Synonym ATRBL11, RBL11, Sb09g007300
Functional annotation OsRhmbd12 - Putative Rhomboid homologue, expressed
UniProt C5YV37
Pfam PF01694
Panther DB PTHR22936 PTHR22936:SF32
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0016021; integral component of membrane GO:0004252serine-type endopeptidase activity GO:0006508proteolysis


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G25752 : rhomboid-like protein 11
RAP-DB (Rice) LOC_Os05g13370.1 : OsRhmbd12 - Putative Rhomboid homologue, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a037575
Brachypodium -
Barley HORVU1Hr1G030040.16 , HORVU1Hr1G030040.14 , HORVU1Hr1G030040.15 , HORVU1Hr1G030040.11 , HORVU1Hr1G030040.8 , HORVU1Hr1G030040.9 , HORVU1Hr1G030040.5 , HORVU1Hr1G030040.6 , HORVU1Hr1G030040.7 , HORVU1Hr1G030040.1 , HORVU1Hr1G030040.2 , HORVU1Hr1G030040.3
Wheat TraesCS1A02G127400 , TraesCS1B02G147500 , TraesCS1B02G147500 , TraesCS1D02G126800
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
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Gene co-expression network
sample Sobic009G083000 Sobic009G083000 Sobic002G004200 Sobic002G004200 Sobic009G083000--Sobic002G004200 Sobic008G152100 Sobic008G152100 Sobic009G083000--Sobic008G152100 Sobic010G258700 Sobic010G258700 Sobic009G083000--Sobic010G258700 Sobic004G007850 Sobic004G007850 Sobic009G083000--Sobic004G007850 Sobic005G091400 Sobic005G091400 Sobic009G083000--Sobic005G091400 Sobic005G077532 Sobic005G077532 Sobic009G083000--Sobic005G077532 Sobic001G541166 Sobic001G541166 Sobic009G083000--Sobic001G541166 Sobic006G079100 Sobic006G079100 Sobic009G083000--Sobic006G079100 Sobic002G247100 Sobic002G247100 Sobic009G083000--Sobic002G247100 Sobic002G004200--Sobic008G152100 Sobic002G004200--Sobic005G077532 Sobic006G181150 Sobic006G181150 Sobic002G004200--Sobic006G181150 Sobic002G004200--Sobic001G541166 Sobic003G385800 Sobic003G385800 Sobic002G004200--Sobic003G385800 Sobic002G004200--Sobic005G091400 Sobic004G211501 Sobic004G211501 Sobic002G004200--Sobic004G211501 Sobic001G520700 Sobic001G520700 Sobic002G004200--Sobic001G520700 Sobic002G188000 Sobic002G188000 Sobic002G004200--Sobic002G188000 Sobic008G152100--Sobic005G077532 Sobic008G152100--Sobic003G385800 Sobic008G152100--Sobic001G541166 Sobic010G009532 Sobic010G009532 Sobic008G152100--Sobic010G009532 Sobic008G152100--Sobic006G181150 Sobic008G152100--Sobic005G091400 Sobic004G230500 Sobic004G230500 Sobic008G152100--Sobic004G230500 Sobic007G045800 Sobic007G045800 Sobic008G152100--Sobic007G045800 Sobic002G165401 Sobic002G165401 Sobic008G152100--Sobic002G165401 Sobic001G115800 Sobic001G115800 Sobic010G258700--Sobic001G115800 Sobic003G102800 Sobic003G102800 Sobic010G258700--Sobic003G102800 Sobic006G204000 Sobic006G204000 Sobic010G258700--Sobic006G204000 Sobic008G139900 Sobic008G139900 Sobic010G258700--Sobic008G139900 Sobic003G309600 Sobic003G309600 Sobic010G258700--Sobic003G309600 Sobic004G275500 Sobic004G275500 Sobic010G258700--Sobic004G275500 Sobic005G042700 Sobic005G042700 Sobic010G258700--Sobic005G042700 Sobic010G136601 Sobic010G136601 Sobic010G258700--Sobic010G136601 Sobic003G120400 Sobic003G120400 Sobic010G258700--Sobic003G120400 Sobic002G116300 Sobic002G116300 Sobic004G007850--Sobic002G116300 Sobic004G007850--Sobic002G247100 Sobic006G222800 Sobic006G222800 Sobic004G007850--Sobic006G222800 Sobic010G035300 Sobic010G035300 Sobic004G007850--Sobic010G035300 Sobic002G114600 Sobic002G114600 Sobic004G007850--Sobic002G114600 Sobic004G007850--Sobic002G165401 Sobic005G076100 Sobic005G076100 Sobic004G007850--Sobic005G076100 Sobic001G212701 Sobic001G212701 Sobic004G007850--Sobic001G212701 Sobic007G174100 Sobic007G174100 Sobic004G007850--Sobic007G174100 Sobic005G091400--Sobic001G541166 Sobic006G162300 Sobic006G162300 Sobic005G091400--Sobic006G162300 Sobic005G091400--Sobic004G211501 Sobic004G302550 Sobic004G302550 Sobic005G091400--Sobic004G302550 Sobic005G091400--Sobic010G035300 Sobic004G302400 Sobic004G302400 Sobic005G091400--Sobic004G302400 Sobic006G222650 Sobic006G222650 Sobic005G091400--Sobic006G222650 Sobic005G091400--Sobic002G116300 Sobic004G001900 Sobic004G001900 Sobic005G091400--Sobic004G001900 Sobic005G077532--Sobic008G152100 Sobic001G501500 Sobic001G501500 Sobic005G077532--Sobic001G501500 Sobic005G077532--Sobic004G230500 Sobic005G077532--Sobic006G181150 Sobic005G077532--Sobic010G009532 Sobic001G180500 Sobic001G180500 Sobic005G077532--Sobic001G180500 Sobic005G077532--Sobic001G541166 Sobic005G077532--Sobic007G045800 Sobic005G077532--Sobic003G385800 Sobic001G541166--Sobic005G091400 Sobic001G541166--Sobic006G162300 Sobic001G541166--Sobic004G302550 Sobic001G541166--Sobic004G211501 Sobic001G541166--Sobic004G302400 Sobic001G541166--Sobic006G222650 Sobic001G541166--Sobic003G385800 Sobic001G541166--Sobic008G152100 Sobic001G541166--Sobic010G035300 Sobic004G297800 Sobic004G297800 Sobic006G079100--Sobic004G297800 Sobic010G014200 Sobic010G014200 Sobic006G079100--Sobic010G014200 Sobic001G263500 Sobic001G263500 Sobic006G079100--Sobic001G263500 Sobic004G128600 Sobic004G128600 Sobic006G079100--Sobic004G128600 Sobic010G161300 Sobic010G161300 Sobic006G079100--Sobic010G161300 Sobic005G226900 Sobic005G226900 Sobic006G079100--Sobic005G226900 Sobic008G131200 Sobic008G131200 Sobic006G079100--Sobic008G131200 Sobic006G247500 Sobic006G247500 Sobic006G079100--Sobic006G247500 Sobic010G179000 Sobic010G179000 Sobic006G079100--Sobic010G179000 Sobic002G247100--Sobic002G116300 Sobic008G119000 Sobic008G119000 Sobic002G247100--Sobic008G119000 Sobic002G247100--Sobic006G222800 Sobic002G247100--Sobic010G035300 Sobic006G180500 Sobic006G180500 Sobic002G247100--Sobic006G180500 Sobic009G085600 Sobic009G085600 Sobic002G247100--Sobic009G085600 Sobic002G247100--Sobic004G001900 Sobic003G167825 Sobic003G167825 Sobic002G247100--Sobic003G167825 Sobic002G247100--Sobic006G162300
Octagon: transcription factors


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