Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G085966.2,Sobic.007G085966.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5R8R9
Pfam -
Panther DB PTHR10784 PTHR10784:SF1
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G55620 : Translation initiation factor IF6
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g44620.1 : eukaryotic translation initiation factor 6, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G123500 - -
2 Sobic.005G101400 pyruvate kinase, putative, expressed K00873: PK, pyruvate kinase
3 Sobic.001G540250 - -
4 Sobic.001G448350 - -
5 Sobic.001G217800 - -
6 Sobic.005G126900 - -
7 Sobic.003G249300 expressed protein -
8 Sobic.006G247400 transferase family protein, putative, expressed -
9 Sobic.001G477100 purine permease, putative, expressed -
10 Sobic.005G167450 - -
11 Sobic.003G137300 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@LOI1, putative, expressed -
12 Sobic.009G069450 - -
13 Sobic.001G163000 hypothetical protein -
14 Sobic.005G183450 - -
15 Sobic.007G164101 - -
16 Sobic.004G201800 expressed protein -
17 Sobic.003G159000 - -
18 Sobic.001G048300 - -
19 Sobic.005G008101 - -
20 Sobic.005G169900 CDK5RAP1, putative, expressed -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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