Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G123500.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6Q2R9
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G448350 - -
2 Sobic.007G085966 - -
3 Sobic.001G195550 - -
4 Sobic.004G346700 expressed protein -
5 Sobic.007G114401 - -
6 Sobic.007G115050 - -
7 Sobic.001G417100 - -
8 Sobic.003G156800 - -
9 Sobic.001G260900 - -
10 Sobic.008G139100 MLA12, putative, expressed -
11 Sobic.002G174000 pleiotropic drug resistance protein, putative, expressed -
12 Sobic.001G071250 - -
13 Sobic.005G134301 - -
14 Sobic.002G288800 serine/threonine-protein kinase receptor precursor, putative, expressed -
15 Sobic.007G135301 - -
16 Sobic.004G346800 transporter, monovalent cation:proton antiporter-2 family, putative, expressed -
17 Sobic.001G353700 expressed protein -
18 Sobic.001G317900 glutathione S-transferase, putative, expressed K00799: GST, glutathione S-transferase
19 Sobic.001G317900 glutathione S-transferase, putative, expressed K00799: GST, glutathione S-transferase
20 Sobic.001G317900 glutathione S-transferase, putative, expressed K00799: GST, glutathione S-transferase


Gene co-expression network
sample Sobic003G123500 Sobic003G123500 Sobic001G448350 Sobic001G448350 Sobic003G123500--Sobic001G448350 Sobic007G085966 Sobic007G085966 Sobic003G123500--Sobic007G085966 Sobic001G195550 Sobic001G195550 Sobic003G123500--Sobic001G195550 Sobic004G346700 Sobic004G346700 Sobic003G123500--Sobic004G346700 Sobic007G114401 Sobic007G114401 Sobic003G123500--Sobic007G114401 Sobic007G115050 Sobic007G115050 Sobic003G123500--Sobic007G115050 Sobic001G417100 Sobic001G417100 Sobic003G123500--Sobic001G417100 Sobic003G156800 Sobic003G156800 Sobic003G123500--Sobic003G156800 Sobic001G260900 Sobic001G260900 Sobic003G123500--Sobic001G260900 Sobic001G448350--Sobic001G195550 Sobic001G448350--Sobic004G346700 Sobic002G174000 Sobic002G174000 Sobic001G448350--Sobic002G174000 Sobic001G448350--Sobic001G260900 Sobic001G448350--Sobic007G115050 Sobic001G448350--Sobic003G123500 Sobic008G139100 Sobic008G139100 Sobic001G448350--Sobic008G139100 Sobic002G288800 Sobic002G288800 Sobic001G448350--Sobic002G288800 Sobic004G198701 Sobic004G198701 Sobic001G448350--Sobic004G198701 Sobic007G085966--Sobic003G123500 Sobic005G101400 Sobic005G101400 Sobic007G085966--Sobic005G101400 Sobic001G540250 Sobic001G540250 Sobic007G085966--Sobic001G540250 Sobic007G085966--Sobic001G448350 Sobic001G217800 Sobic001G217800 Sobic007G085966--Sobic001G217800 Sobic005G126900 Sobic005G126900 Sobic007G085966--Sobic005G126900 Sobic003G249300 Sobic003G249300 Sobic007G085966--Sobic003G249300 Sobic006G247400 Sobic006G247400 Sobic007G085966--Sobic006G247400 Sobic001G477100 Sobic001G477100 Sobic007G085966--Sobic001G477100 Sobic001G195550--Sobic004G346700 Sobic001G195550--Sobic002G174000 Sobic001G195550--Sobic001G417100 Sobic001G365332 Sobic001G365332 Sobic001G195550--Sobic001G365332 Sobic001G195550--Sobic007G115050 Sobic001G195550--Sobic008G139100 Sobic001G195550--Sobic001G260900 Sobic003G168350 Sobic003G168350 Sobic001G195550--Sobic003G168350 Sobic004G346800 Sobic004G346800 Sobic001G195550--Sobic004G346800 Sobic004G346700--Sobic001G195550 Sobic004G346700--Sobic002G174000 Sobic004G346700--Sobic001G365332 Sobic004G346700--Sobic007G115050 Sobic005G008400 Sobic005G008400 Sobic004G346700--Sobic005G008400 Sobic004G346700--Sobic008G139100 Sobic004G346700--Sobic001G260900 Sobic004G346700--Sobic003G168350 Sobic004G346700--Sobic004G198701 Sobic001G353700 Sobic001G353700 Sobic007G114401--Sobic001G353700 Sobic007G114401--Sobic003G123500 Sobic007G135301 Sobic007G135301 Sobic007G114401--Sobic007G135301 Sobic006G165900 Sobic006G165900 Sobic007G114401--Sobic006G165900 Sobic003G159000 Sobic003G159000 Sobic007G114401--Sobic003G159000 Sobic006G087250 Sobic006G087250 Sobic007G114401--Sobic006G087250 Sobic008G152400 Sobic008G152400 Sobic007G114401--Sobic008G152400 Sobic001G163000 Sobic001G163000 Sobic007G114401--Sobic001G163000 Sobic007G114401--Sobic001G195550 Sobic007G115050--Sobic001G260900 Sobic001G317900 Sobic001G317900 Sobic007G115050--Sobic001G317900 Sobic005G083932 Sobic005G083932 Sobic007G115050--Sobic005G083932 Sobic005G134301 Sobic005G134301 Sobic007G115050--Sobic005G134301 Sobic008G174400 Sobic008G174400 Sobic007G115050--Sobic008G174400 Sobic002G191200 Sobic002G191200 Sobic007G115050--Sobic002G191200 Sobic001G417100--Sobic007G115050 Sobic001G417100--Sobic001G260900 Sobic001G417100--Sobic001G195550 Sobic001G417100--Sobic001G317900 Sobic001G417100--Sobic005G083932 Sobic001G417100--Sobic008G174400 Sobic003G156800--Sobic001G260900 Sobic003G156800--Sobic007G115050 Sobic003G156800--Sobic002G288800 Sobic003G156800--Sobic002G174000 Sobic003G156800--Sobic004G198701 Sobic003G156800--Sobic001G317900 Sobic001G260900--Sobic007G115050 Sobic001G260900--Sobic001G317900 Sobic001G260900--Sobic005G134301 Sobic001G260900--Sobic005G083932 Sobic001G260900--Sobic002G174000 Sobic001G260900--Sobic002G288800
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.