Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G217800.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6QK76
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
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cDNA sequences
Sobic.001G217800


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G101400 pyruvate kinase, putative, expressed K00873: PK, pyruvate kinase
2 Sobic.009G104850 - -
3 Sobic.003G249300 expressed protein -
4 Sobic.005G167450 - -
5 Sobic.001G540250 - -
6 Sobic.004G272500 ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase, family 1, putative, expressed -
7 Sobic.002G341600 lipase, putative, expressed -
8 Sobic.009G029100 serine/threonine-protein kinase receptor precursor, putative, expressed -
9 Sobic.001G302100 holliday junction resolvase, putative, expressed K07447: putative holliday junction resolvase
10 Sobic.001G519700 regulatory protein, putative, expressed -
11 Sobic.010G225400 expressed protein -
12 Sobic.003G160400 zinc knuckle family protein, expressed -
13 Sobic.003G412500 - -
14 Sobic.004G125701 - -
15 Sobic.003G137300 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@LOI1, putative, expressed -
16 Sobic.006G258600 thiol-disulphide oxidoreductase DCC, putative, expressed -
17 Sobic.005G167100 - -
18 Sobic.001G535500 folylpolyglutamate synthase(PubMedID : 33924915)@folylpolyglutamate synthase, mitochondrial precursor, putative, expressed K01930: folylpolyglutamate synthase
19 Sobic.004G234766 - -
20 Sobic.010G107601 - -


Gene co-expression network
sample Sobic001G217800 Sobic001G217800 Sobic005G101400 Sobic005G101400 Sobic001G217800--Sobic005G101400 Sobic009G104850 Sobic009G104850 Sobic001G217800--Sobic009G104850 Sobic003G249300 Sobic003G249300 Sobic001G217800--Sobic003G249300 Sobic005G167450 Sobic005G167450 Sobic001G217800--Sobic005G167450 Sobic001G540250 Sobic001G540250 Sobic001G217800--Sobic001G540250 Sobic004G272500 Sobic004G272500 Sobic001G217800--Sobic004G272500 Sobic002G341600 Sobic002G341600 Sobic001G217800--Sobic002G341600 Sobic009G029100 Sobic009G029100 Sobic001G217800--Sobic009G029100 Sobic001G302100 Sobic001G302100 Sobic001G217800--Sobic001G302100 Sobic005G101400--Sobic001G217800 Sobic005G101400--Sobic009G104850 Sobic005G101400--Sobic005G167450 Sobic005G101400--Sobic004G272500 Sobic005G101400--Sobic001G540250 Sobic009G069450 Sobic009G069450 Sobic005G101400--Sobic009G069450 Sobic005G101400--Sobic003G249300 Sobic002G322101 Sobic002G322101 Sobic005G101400--Sobic002G322101 Sobic003G169400 Sobic003G169400 Sobic005G101400--Sobic003G169400 Sobic009G104850--Sobic004G272500 Sobic009G104850--Sobic001G217800 Sobic010G225400 Sobic010G225400 Sobic009G104850--Sobic010G225400 Sobic009G104850--Sobic005G101400 Sobic003G160400 Sobic003G160400 Sobic009G104850--Sobic003G160400 Sobic005G167100 Sobic005G167100 Sobic009G104850--Sobic005G167100 Sobic009G104850--Sobic005G167450 Sobic010G107601 Sobic010G107601 Sobic009G104850--Sobic010G107601 Sobic004G234766 Sobic004G234766 Sobic009G104850--Sobic004G234766 Sobic003G249300--Sobic001G540250 Sobic003G249300--Sobic001G217800 Sobic003G249300--Sobic001G302100 Sobic003G249300--Sobic005G167450 Sobic003G249300--Sobic002G341600 Sobic004G125701 Sobic004G125701 Sobic003G249300--Sobic004G125701 Sobic003G249300--Sobic005G101400 Sobic004G125600 Sobic004G125600 Sobic003G249300--Sobic004G125600 Sobic003G249300--Sobic009G104850 Sobic005G167450--Sobic001G217800 Sobic005G167450--Sobic005G101400 Sobic005G167450--Sobic009G104850 Sobic005G167450--Sobic003G249300 Sobic005G167450--Sobic004G272500 Sobic005G167450--Sobic010G225400 Sobic005G167450--Sobic004G234766 Sobic010G107901 Sobic010G107901 Sobic005G167450--Sobic010G107901 Sobic006G093550 Sobic006G093550 Sobic005G167450--Sobic006G093550 Sobic001G540250--Sobic003G249300 Sobic001G540250--Sobic001G217800 Sobic001G540250--Sobic005G101400 Sobic001G540250--Sobic004G125701 Sobic001G540250--Sobic001G302100 Sobic001G540250--Sobic002G341600 Sobic001G540250--Sobic009G104850 Sobic001G540250--Sobic005G167450 Sobic008G013700 Sobic008G013700 Sobic001G540250--Sobic008G013700 Sobic004G272500--Sobic009G104850 Sobic008G160300 Sobic008G160300 Sobic004G272500--Sobic008G160300 Sobic004G272500--Sobic010G107601 Sobic004G337600 Sobic004G337600 Sobic004G272500--Sobic004G337600 Sobic003G172400 Sobic003G172400 Sobic004G272500--Sobic003G172400 Sobic005G096500 Sobic005G096500 Sobic004G272500--Sobic005G096500 Sobic004G272500--Sobic003G169400 Sobic003G168500 Sobic003G168500 Sobic004G272500--Sobic003G168500 Sobic003G171900 Sobic003G171900 Sobic004G272500--Sobic003G171900 Sobic002G341600--Sobic001G302100 Sobic006G258600 Sobic006G258600 Sobic002G341600--Sobic006G258600 Sobic002G341600--Sobic003G249300 Sobic002G341600--Sobic001G217800 Sobic002G341600--Sobic001G540250 Sobic002G341600--Sobic004G125701 Sobic002G341600--Sobic009G029100 Sobic007G099300 Sobic007G099300 Sobic002G341600--Sobic007G099300 Sobic003G325000 Sobic003G325000 Sobic002G341600--Sobic003G325000 Sobic003G412500 Sobic003G412500 Sobic009G029100--Sobic003G412500 Sobic002G165200 Sobic002G165200 Sobic009G029100--Sobic002G165200 Sobic006G057100 Sobic006G057100 Sobic009G029100--Sobic006G057100 Sobic004G299850 Sobic004G299850 Sobic009G029100--Sobic004G299850 Sobic010G185250 Sobic010G185250 Sobic009G029100--Sobic010G185250 Sobic009G029100--Sobic004G272500 Sobic007G052500 Sobic007G052500 Sobic009G029100--Sobic007G052500 Sobic003G218950 Sobic003G218950 Sobic009G029100--Sobic003G218950 Sobic008G108300 Sobic008G108300 Sobic009G029100--Sobic008G108300 Sobic001G302100--Sobic003G249300 Sobic001G302100--Sobic002G341600 Sobic001G302100--Sobic004G125701 Sobic001G302100--Sobic001G540250 Sobic001G302100--Sobic004G125600 Sobic001G302100--Sobic001G217800 Sobic004G019700 Sobic004G019700 Sobic001G302100--Sobic004G019700 Sobic001G302100--Sobic007G099300 Sobic001G124500 Sobic001G124500 Sobic001G302100--Sobic001G124500
Octagon: transcription factors


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