Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G029100.1
Synonym Sb09g002440
Functional annotation serine/threonine-protein kinase receptor precursor, putative, expressed
UniProt C5YZF4
Pfam PF00954 PF07714 PF08276
Panther DB PTHR27002 PTHR27002:SF69
NCBI CDD KOG1187; Serine/threonine protein kinase
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0006468; protein phosphorylation GO:0004672protein kinase activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G11330 : S-locus lectin protein kinase family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g54002.1 : serine/threonine-protein kinase receptor precursor, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a040707
Brachypodium -
Barley -
Wheat TraesCS2D02G537100 , TraesCS2B02G565100
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G412500 - -
2 Sobic.002G165200 - -
3 Sobic.006G057100 - -
4 Sobic.004G299850 - -
5 Sobic.010G185250 - -
6 Sobic.004G272500 ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase, family 1, putative, expressed -
7 Sobic.007G052500 - -
8 Sobic.003G218950 - -
9 Sobic.008G108300 peroxisomal membrane protein, putative, expressed K13348: protein Mpv17
10 Sobic.001G523150 - -
11 Sobic.006G258600 thiol-disulphide oxidoreductase DCC, putative, expressed -
12 Sobic.003G137300 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@LOI1, putative, expressed -
13 Sobic.003G369566 - -
14 Sobic.004G337600 - -
15 Sobic.006G131700 CRS1/YhbY domain containing protein, putative, expressed -
16 Sobic.004G044401 - -
17 Sobic.001G182800 disease resistance RPP13-like protein 1, putative, expressed -
18 Sobic.009G104850 - -
19 Sobic.003G113100 OsFBX320 - F-box domain containing protein, expressed -
20 Sobic.001G011600 glutathione S-transferase, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic009G029100 Sobic009G029100 Sobic003G412500 Sobic003G412500 Sobic009G029100--Sobic003G412500 Sobic002G165200 Sobic002G165200 Sobic009G029100--Sobic002G165200 Sobic006G057100 Sobic006G057100 Sobic009G029100--Sobic006G057100 Sobic004G299850 Sobic004G299850 Sobic009G029100--Sobic004G299850 Sobic010G185250 Sobic010G185250 Sobic009G029100--Sobic010G185250 Sobic004G272500 Sobic004G272500 Sobic009G029100--Sobic004G272500 Sobic007G052500 Sobic007G052500 Sobic009G029100--Sobic007G052500 Sobic003G218950 Sobic003G218950 Sobic009G029100--Sobic003G218950 Sobic008G108300 Sobic008G108300 Sobic009G029100--Sobic008G108300 Sobic003G412500--Sobic009G029100 Sobic003G412500--Sobic002G165200 Sobic003G412500--Sobic010G185250 Sobic003G412500--Sobic006G057100 Sobic003G160400 Sobic003G160400 Sobic003G412500--Sobic003G160400 Sobic001G182900 Sobic001G182900 Sobic003G412500--Sobic001G182900 Sobic005G216900 Sobic005G216900 Sobic003G412500--Sobic005G216900 Sobic003G412500--Sobic003G218950 Sobic003G113100 Sobic003G113100 Sobic003G412500--Sobic003G113100 Sobic002G165200--Sobic010G185250 Sobic002G165200--Sobic001G182900 Sobic002G165200--Sobic003G218950 SobicK029400 SobicK029400 Sobic002G165200--SobicK029400 Sobic003G369533 Sobic003G369533 Sobic002G165200--Sobic003G369533 Sobic010G035600 Sobic010G035600 Sobic002G165200--Sobic010G035600 Sobic006G192600 Sobic006G192600 Sobic002G165200--Sobic006G192600 Sobic002G165200--Sobic003G412500 Sobic003G172500 Sobic003G172500 Sobic002G165200--Sobic003G172500 Sobic006G057100--Sobic003G218950 Sobic003G352000 Sobic003G352000 Sobic006G057100--Sobic003G352000 Sobic007G085900 Sobic007G085900 Sobic006G057100--Sobic007G085900 Sobic006G057100--SobicK029400 Sobic006G131700 Sobic006G131700 Sobic006G057100--Sobic006G131700 Sobic006G057100--Sobic003G113100 Sobic006G057100--Sobic003G369533 Sobic006G057100--Sobic003G160400 Sobic006G057100--Sobic010G185250 Sobic004G299850--Sobic009G029100 Sobic001G167000 Sobic001G167000 Sobic004G299850--Sobic001G167000 Sobic004G299850--Sobic003G412500 Sobic001G011600 Sobic001G011600 Sobic004G299850--Sobic001G011600 Sobic003G330350 Sobic003G330350 Sobic004G299850--Sobic003G330350 Sobic006G258600 Sobic006G258600 Sobic004G299850--Sobic006G258600 Sobic002G012100 Sobic002G012100 Sobic004G299850--Sobic002G012100 Sobic006G130100 Sobic006G130100 Sobic004G299850--Sobic006G130100 Sobic004G299850--Sobic006G131700 Sobic010G185250--Sobic002G165200 Sobic010G185250--Sobic001G182900 Sobic010G185250--Sobic010G035600 Sobic010G185250--SobicK029400 Sobic010G185250--Sobic003G369533 Sobic010G185250--Sobic006G057100 Sobic010G185250--Sobic003G218950 Sobic003G168800 Sobic003G168800 Sobic010G185250--Sobic003G168800 Sobic010G185250--Sobic003G172500 Sobic009G104850 Sobic009G104850 Sobic004G272500--Sobic009G104850 Sobic008G160300 Sobic008G160300 Sobic004G272500--Sobic008G160300 Sobic010G107601 Sobic010G107601 Sobic004G272500--Sobic010G107601 Sobic004G337600 Sobic004G337600 Sobic004G272500--Sobic004G337600 Sobic003G172400 Sobic003G172400 Sobic004G272500--Sobic003G172400 Sobic005G096500 Sobic005G096500 Sobic004G272500--Sobic005G096500 Sobic003G169400 Sobic003G169400 Sobic004G272500--Sobic003G169400 Sobic003G168500 Sobic003G168500 Sobic004G272500--Sobic003G168500 Sobic003G171900 Sobic003G171900 Sobic004G272500--Sobic003G171900 Sobic003G253100 Sobic003G253100 Sobic007G052500--Sobic003G253100 Sobic001G523150 Sobic001G523150 Sobic007G052500--Sobic001G523150 Sobic007G052500--Sobic009G029100 Sobic008G039200 Sobic008G039200 Sobic007G052500--Sobic008G039200 Sobic001G283800 Sobic001G283800 Sobic007G052500--Sobic001G283800 Sobic009G160300 Sobic009G160300 Sobic007G052500--Sobic009G160300 Sobic007G094000 Sobic007G094000 Sobic007G052500--Sobic007G094000 Sobic004G044401 Sobic004G044401 Sobic007G052500--Sobic004G044401 Sobic007G052500--Sobic003G412500 Sobic003G218950--Sobic006G057100 Sobic003G218950--Sobic003G369533 Sobic003G218950--Sobic003G352000 Sobic003G218950--SobicK029400 Sobic003G218950--Sobic006G131700 Sobic003G218950--Sobic002G165200 Sobic003G218950--Sobic007G085900 Sobic003G218950--Sobic003G113100 Sobic003G169000 Sobic003G169000 Sobic003G218950--Sobic003G169000 Sobic008G108300--Sobic002G165200 Sobic001G182800 Sobic001G182800 Sobic008G108300--Sobic001G182800 Sobic008G108300--Sobic006G192600 Sobic003G393600 Sobic003G393600 Sobic008G108300--Sobic003G393600 Sobic008G108300--Sobic010G185250 Sobic010G254000 Sobic010G254000 Sobic008G108300--Sobic010G254000 Sobic008G108300--Sobic003G218950 Sobic008G108300--Sobic003G369533 Sobic001G182700 Sobic001G182700 Sobic008G108300--Sobic001G182700
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.