Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G044401.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RLE4
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g31074.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G029100 serine/threonine-protein kinase receptor precursor, putative, expressed -
2 Sobic.001G523150 - -
3 Sobic.003G166400 - K02911: RP-L32, MRPL32, large subunit ribosomal protein L32
4 Sobic.002G270733 - -
5 Sobic.007G052500 - -
6 Sobic.004G337600 - -
7 Sobic.008G039200 - -
8 Sobic.005G126900 - -
9 Sobic.002G165200 - -
10 Sobic.007G109200 ATP synthase epsilon chain, putative, expressed K02114: ATPF1E, F-type H+-transporting ATPase subunit epsilon
11 Sobic.009G148950 - -
12 Sobic.003G412500 - -
13 Sobic.004G087000 ATP synthase subunit beta, putative, expressed K02112: ATPF1B, F-type H+/Na+-transporting ATPase subunit beta
14 Sobic.003G172701 - -
15 Sobic.004G272500 ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase, family 1, putative, expressed -
16 Sobic.003G137300 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@LOI1, putative, expressed -
17 Sobic.004G251400 - -
18 Sobic.001G075500 - -
19 Sobic.003G173266 - K02956: RP-S15, MRPS15, small subunit ribosomal protein S15
20 Sobic.006G057050 - -


Gene co-expression network
sample Sobic004G044401 Sobic004G044401 Sobic009G029100 Sobic009G029100 Sobic004G044401--Sobic009G029100 Sobic001G523150 Sobic001G523150 Sobic004G044401--Sobic001G523150 Sobic003G166400 Sobic003G166400 Sobic004G044401--Sobic003G166400 Sobic002G270733 Sobic002G270733 Sobic004G044401--Sobic002G270733 Sobic007G052500 Sobic007G052500 Sobic004G044401--Sobic007G052500 Sobic004G337600 Sobic004G337600 Sobic004G044401--Sobic004G337600 Sobic008G039200 Sobic008G039200 Sobic004G044401--Sobic008G039200 Sobic005G126900 Sobic005G126900 Sobic004G044401--Sobic005G126900 Sobic002G165200 Sobic002G165200 Sobic004G044401--Sobic002G165200 Sobic003G412500 Sobic003G412500 Sobic009G029100--Sobic003G412500 Sobic009G029100--Sobic002G165200 Sobic006G057100 Sobic006G057100 Sobic009G029100--Sobic006G057100 Sobic004G299850 Sobic004G299850 Sobic009G029100--Sobic004G299850 Sobic010G185250 Sobic010G185250 Sobic009G029100--Sobic010G185250 Sobic004G272500 Sobic004G272500 Sobic009G029100--Sobic004G272500 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Octagon: transcription factors


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