Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G166400.2
Synonym Sb03g015875
Functional annotation -
UniProt A0A1L1VU75 , A0A1W0VXN6 , A0A1L1VY26 , A1E9X2
Pfam -
Panther DB PTHR36083 PTHR36083:SF1
NCBI CDD -
KEGG Orthology K02911; RP-L32, MRPL32, large subunit ribosomal protein L32
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium PNT70214 , PNT64001 , KQK16040
Barley HORVU0Hr1G035230.1 , HORVU1Hr1G048160.1 , HORVU0Hr1G038020.1 , HORVU0Hr1G033090.1 , HORVU0Hr1G036490.1 , AGP50803 , HORVU0Hr1G024990.1 , HORVU1Hr1G064900.1 , HORVU0Hr1G034510.1 , HORVU0Hr1G025100.1 , HORVU5Hr1G056750.1 , HORVU0Hr1G033300.1 , HORVU0Hr1G036320.1
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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11 Sobic.004G210400 expressed protein -
12 Sobic.004G087050 - -
13 Sobic.010G139200 photosystem II P680 chlorophyll A apoprotein, putative, expressed -
14 Sobic.004G337600 - -
15 Sobic.003G172701 - -
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20 Sobic.004G251400 - -


Gene co-expression network
sample Sobic003G166400 Sobic003G166400 Sobic005G110493 Sobic005G110493 Sobic003G166400--Sobic005G110493 Sobic003G130200 Sobic003G130200 Sobic003G166400--Sobic003G130200 Sobic003G168425 Sobic003G168425 Sobic003G166400--Sobic003G168425 Sobic003G169300 Sobic003G169300 Sobic003G166400--Sobic003G169300 Sobic002G148166 Sobic002G148166 Sobic003G166400--Sobic002G148166 Sobic002G150200 Sobic002G150200 Sobic003G166400--Sobic002G150200 Sobic002G222000 Sobic002G222000 Sobic003G166400--Sobic002G222000 Sobic005G002050 Sobic005G002050 Sobic003G166400--Sobic005G002050 Sobic003G173266 Sobic003G173266 Sobic003G166400--Sobic003G173266 Sobic005G110493--Sobic003G169300 Sobic005G110493--Sobic003G168425 Sobic004G087050 Sobic004G087050 Sobic005G110493--Sobic004G087050 Sobic003G172701 Sobic003G172701 Sobic005G110493--Sobic003G172701 Sobic010G139200 Sobic010G139200 Sobic005G110493--Sobic010G139200 Sobic003G172500 Sobic003G172500 Sobic005G110493--Sobic003G172500 Sobic005G110493--Sobic003G130200 Sobic005G110493--Sobic002G148166 Sobic010G052866 Sobic010G052866 Sobic005G110493--Sobic010G052866 Sobic003G130200--Sobic002G150200 Sobic004G210400 Sobic004G210400 Sobic003G130200--Sobic004G210400 Sobic003G130200--Sobic002G148166 Sobic003G130200--Sobic005G002050 Sobic003G130200--Sobic005G110493 Sobic003G130200--Sobic003G168425 Sobic003G130200--Sobic003G169300 Sobic003G130200--Sobic010G139200 Sobic003G130200--Sobic004G087050 Sobic003G168425--Sobic004G087050 Sobic003G168425--Sobic005G110493 Sobic003G168425--Sobic010G139200 Sobic003G168425--Sobic003G169300 Sobic003G171900 Sobic003G171900 Sobic003G168425--Sobic003G171900 Sobic003G168425--Sobic003G172500 Sobic003G168425--Sobic003G130200 Sobic003G168425--Sobic004G210400 Sobic008G160300 Sobic008G160300 Sobic003G168425--Sobic008G160300 Sobic003G169300--Sobic005G110493 Sobic003G169300--Sobic003G168425 Sobic003G169300--Sobic003G173266 Sobic003G169300--Sobic010G052866 Sobic003G169300--Sobic004G087050 Sobic003G169300--Sobic003G172701 Sobic003G169300--Sobic003G172500 Sobic003G169300--Sobic002G148166 Sobic004G251400 Sobic004G251400 Sobic003G169300--Sobic004G251400 Sobic002G148166--Sobic002G150200 Sobic002G148166--Sobic003G130200 Sobic002G148166--Sobic003G172701 Sobic002G148166--Sobic005G110493 Sobic002G148166--Sobic004G210400 Sobic002G148166--Sobic005G002050 Sobic002G148166--Sobic003G169300 Sobic004G087000 Sobic004G087000 Sobic002G148166--Sobic004G087000 Sobic002G148166--Sobic002G222000 Sobic002G150200--Sobic003G130200 Sobic002G150200--Sobic004G210400 Sobic002G150200--Sobic002G148166 Sobic002G150200--Sobic005G002050 Sobic007G207100 Sobic007G207100 Sobic002G150200--Sobic007G207100 Sobic002G150200--Sobic005G110493 Sobic002G150200--Sobic003G168425 Sobic002G150200--Sobic003G172701 Sobic002G150200--Sobic003G169300 Sobic003G172900 Sobic003G172900 Sobic002G222000--Sobic003G172900 Sobic002G222000--Sobic002G148166 Sobic010G254000 Sobic010G254000 Sobic002G222000--Sobic010G254000 Sobic002G222000--Sobic003G173266 Sobic001G266000 Sobic001G266000 Sobic002G222000--Sobic001G266000 Sobic002G222000--Sobic005G002050 Sobic002G222000--Sobic003G169300 Sobic002G222000--Sobic005G110493 Sobic002G222000--Sobic003G130200 Sobic005G002050--Sobic003G130200 Sobic005G002050--Sobic002G150200 Sobic005G002050--Sobic002G148166 Sobic005G002050--Sobic010G254000 Sobic005G002050--Sobic004G210400 Sobic005G002050--Sobic002G222000 Sobic005G002050--Sobic003G168425 Sobic005G002050--Sobic005G110493 Sobic005G002050--Sobic003G166400 Sobic003G173266--Sobic003G169300 Sobic003G173266--Sobic003G172900 Sobic003G172850 Sobic003G172850 Sobic003G173266--Sobic003G172850 Sobic003G173266--Sobic001G266000 Sobic003G173266--Sobic004G251400 Sobic003G173266--Sobic002G222000 Sobic003G173266--Sobic005G110493 Sobic003G173266--Sobic002G148166 Sobic003G173266--Sobic010G052866
Octagon: transcription factors


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