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Transcriptome id Sobic.004G087050.1
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Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RLQ5
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NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G139200 photosystem II P680 chlorophyll A apoprotein, putative, expressed -
2 Sobic.003G168425 - K02963: RP-S18, MRPS18, small subunit ribosomal protein S18
3 Sobic.005G110493 - -
4 Sobic.003G172500 - -
5 Sobic.003G168200 - -
6 Sobic.009G123100 - K02710: photosystem II PsbI protein
K02712: photosystem II PsbK protein
7 Sobic.003G169300 chloroplast 30S ribosomal protein S2, putative, expressed K02967: RP-S2, MRPS2, small subunit ribosomal protein S2
8 Sobic.003G171900 - -
9 Sobic.004G210400 expressed protein -
10 Sobic.008G160300 NADPH-dependent oxidoreductase, putative K05576: NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4L
11 Sobic.K032300 uncharacterized protein ycf72, putative -
12 Sobic.003G130200 embryonic protein DC-8, putative, expressed -
13 Sobic.010G052866 - K02892: RP-L23, MRPL23, large subunit ribosomal protein L23
14 Sobic.003G172701 - -
15 Sobic.006G124700 chloroplast 30S ribosomal protein S8, putative, expressed K02994: RP-S8, small subunit ribosomal protein S8
16 Sobic.002G278100 armadillo/beta-catenin repeat family protein, putative, expressed -
17 Sobic.009G148950 - -
18 Sobic.006G057050 - -
19 Sobic.007G149200 "DEP1/GGC2(Ortholog in rice:Huang et al., 2009(PubMedID : 31659905)@keratin-associated protein 5-4, putative, expressed -
20 Sobic.002G150200 cytochrome c biogenesis protein ccsA, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic004G087050 Sobic004G087050 Sobic010G139200 Sobic010G139200 Sobic004G087050--Sobic010G139200 Sobic003G168425 Sobic003G168425 Sobic004G087050--Sobic003G168425 Sobic005G110493 Sobic005G110493 Sobic004G087050--Sobic005G110493 Sobic003G172500 Sobic003G172500 Sobic004G087050--Sobic003G172500 Sobic003G168200 Sobic003G168200 Sobic004G087050--Sobic003G168200 Sobic009G123100 Sobic009G123100 Sobic004G087050--Sobic009G123100 Sobic003G169300 Sobic003G169300 Sobic004G087050--Sobic003G169300 Sobic003G171900 Sobic003G171900 Sobic004G087050--Sobic003G171900 Sobic004G210400 Sobic004G210400 Sobic004G087050--Sobic004G210400 Sobic010G139200--Sobic004G087050 Sobic010G139200--Sobic003G168425 Sobic010G139200--Sobic005G110493 Sobic010G139200--Sobic003G172500 Sobic010G139200--Sobic003G168200 Sobic010G139200--Sobic004G210400 Sobic010G139200--Sobic003G169300 SobicK032300 SobicK032300 Sobic010G139200--SobicK032300 Sobic010G139200--Sobic009G123100 Sobic003G168425--Sobic004G087050 Sobic003G168425--Sobic005G110493 Sobic003G168425--Sobic010G139200 Sobic003G168425--Sobic003G169300 Sobic003G168425--Sobic003G171900 Sobic003G168425--Sobic003G172500 Sobic003G130200 Sobic003G130200 Sobic003G168425--Sobic003G130200 Sobic003G168425--Sobic004G210400 Sobic008G160300 Sobic008G160300 Sobic003G168425--Sobic008G160300 Sobic005G110493--Sobic003G169300 Sobic005G110493--Sobic003G168425 Sobic005G110493--Sobic004G087050 Sobic003G172701 Sobic003G172701 Sobic005G110493--Sobic003G172701 Sobic005G110493--Sobic010G139200 Sobic005G110493--Sobic003G172500 Sobic005G110493--Sobic003G130200 Sobic002G148166 Sobic002G148166 Sobic005G110493--Sobic002G148166 Sobic010G052866 Sobic010G052866 Sobic005G110493--Sobic010G052866 Sobic003G172500--Sobic010G052866 Sobic003G172500--Sobic004G087050 Sobic003G172500--Sobic009G123100 Sobic003G172500--SobicK032300 Sobic003G172500--Sobic010G139200 Sobic003G172500--Sobic005G110493 Sobic006G124700 Sobic006G124700 Sobic003G172500--Sobic006G124700 Sobic003G172500--Sobic003G168425 Sobic003G172500--Sobic003G169300 Sobic007G149200 Sobic007G149200 Sobic003G168200--Sobic007G149200 Sobic002G278100 Sobic002G278100 Sobic003G168200--Sobic002G278100 Sobic003G352000 Sobic003G352000 Sobic003G168200--Sobic003G352000 SobicK029400 SobicK029400 Sobic003G168200--SobicK029400 Sobic003G168200--Sobic004G087050 Sobic010G201266 Sobic010G201266 Sobic003G168200--Sobic010G201266 Sobic003G168200--Sobic010G139200 Sobic003G168200--Sobic008G160300 Sobic003G168200--Sobic003G171900 Sobic009G123100--Sobic003G172500 Sobic009G148950 Sobic009G148950 Sobic009G123100--Sobic009G148950 Sobic009G123100--Sobic004G087050 Sobic006G057050 Sobic006G057050 Sobic009G123100--Sobic006G057050 Sobic009G123100--SobicK032300 Sobic007G145801 Sobic007G145801 Sobic009G123100--Sobic007G145801 Sobic009G123100--Sobic006G124700 Sobic009G123100--Sobic010G139200 Sobic004G337850 Sobic004G337850 Sobic009G123100--Sobic004G337850 Sobic003G169300--Sobic005G110493 Sobic003G169300--Sobic003G168425 Sobic003G173266 Sobic003G173266 Sobic003G169300--Sobic003G173266 Sobic003G169300--Sobic010G052866 Sobic003G169300--Sobic004G087050 Sobic003G169300--Sobic003G172701 Sobic003G169300--Sobic003G172500 Sobic003G169300--Sobic002G148166 Sobic004G251400 Sobic004G251400 Sobic003G169300--Sobic004G251400 Sobic003G171900--Sobic008G160300 Sobic003G168500 Sobic003G168500 Sobic003G171900--Sobic003G168500 Sobic003G172400 Sobic003G172400 Sobic003G171900--Sobic003G172400 Sobic003G171900--Sobic002G278100 Sobic003G171900--Sobic010G201266 Sobic010G107601 Sobic010G107601 Sobic003G171900--Sobic010G107601 Sobic003G171900--Sobic003G168425 Sobic003G171900--Sobic004G087050 Sobic003G171900--Sobic003G168200 Sobic004G210400--Sobic003G130200 Sobic002G150200 Sobic002G150200 Sobic004G210400--Sobic002G150200 Sobic004G210400--Sobic002G148166 Sobic004G210400--Sobic003G168425 Sobic004G210400--Sobic005G110493 Sobic004G210400--Sobic010G139200 Sobic004G210400--Sobic004G087050 Sobic004G210400--Sobic003G172701 Sobic005G002050 Sobic005G002050 Sobic004G210400--Sobic005G002050
Octagon: transcription factors


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