Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G172701.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A120GUT2 , A0A1W0VXQ0
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os05g22868.1 : uncharacterized protein ycf73, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium KQK18207 , KQJ95763 , KQJ95663 , KQJ82786 , KQJ96840
Barley HORVU4Hr1G089550.1
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G109200 ATP synthase epsilon chain, putative, expressed K02114: ATPF1E, F-type H+-transporting ATPase subunit epsilon
2 Sobic.009G148950 - -
3 Sobic.005G110493 - -
4 Sobic.002G148166 - -
5 Sobic.006G057050 - -
6 Sobic.004G087000 ATP synthase subunit beta, putative, expressed K02112: ATPF1B, F-type H+/Na+-transporting ATPase subunit beta
7 Sobic.003G169300 chloroplast 30S ribosomal protein S2, putative, expressed K02967: RP-S2, MRPS2, small subunit ribosomal protein S2
8 Sobic.002G270733 - -
9 Sobic.004G210400 expressed protein -
10 Sobic.004G251400 - -
11 Sobic.003G130200 embryonic protein DC-8, putative, expressed -
12 Sobic.003G168425 - K02963: RP-S18, MRPS18, small subunit ribosomal protein S18
13 Sobic.009G123100 - K02710: photosystem II PsbI protein
K02712: photosystem II PsbK protein
14 Sobic.004G087050 - -
15 Sobic.002G150200 cytochrome c biogenesis protein ccsA, putative, expressed -
16 Sobic.003G172500 - -
17 Sobic.010G052866 - K02892: RP-L23, MRPL23, large subunit ribosomal protein L23
18 Sobic.003G173266 - K02956: RP-S15, MRPS15, small subunit ribosomal protein S15
19 Sobic.003G172900 NADPH-dependent oxidoreductase, putative, expressed K05581: NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit J
20 Sobic.010G139200 photosystem II P680 chlorophyll A apoprotein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic003G172701 Sobic003G172701 Sobic007G109200 Sobic007G109200 Sobic003G172701--Sobic007G109200 Sobic009G148950 Sobic009G148950 Sobic003G172701--Sobic009G148950 Sobic005G110493 Sobic005G110493 Sobic003G172701--Sobic005G110493 Sobic002G148166 Sobic002G148166 Sobic003G172701--Sobic002G148166 Sobic006G057050 Sobic006G057050 Sobic003G172701--Sobic006G057050 Sobic004G087000 Sobic004G087000 Sobic003G172701--Sobic004G087000 Sobic003G169300 Sobic003G169300 Sobic003G172701--Sobic003G169300 Sobic002G270733 Sobic002G270733 Sobic003G172701--Sobic002G270733 Sobic004G210400 Sobic004G210400 Sobic003G172701--Sobic004G210400 Sobic007G109200--Sobic004G087000 Sobic007G109200--Sobic003G172701 Sobic004G251400 Sobic004G251400 Sobic007G109200--Sobic004G251400 Sobic003G172900 Sobic003G172900 Sobic007G109200--Sobic003G172900 Sobic007G109200--Sobic002G148166 Sobic007G109200--Sobic006G057050 Sobic007G109200--Sobic003G169300 Sobic003G173266 Sobic003G173266 Sobic007G109200--Sobic003G173266 Sobic007G109200--Sobic005G110493 Sobic009G148950--Sobic002G270733 Sobic009G148950--Sobic003G172701 Sobic009G123100 Sobic009G123100 Sobic009G148950--Sobic009G123100 Sobic009G148950--Sobic006G057050 Sobic009G148950--Sobic005G110493 Sobic003G172500 Sobic003G172500 Sobic009G148950--Sobic003G172500 Sobic009G148950--Sobic004G210400 Sobic004G087050 Sobic004G087050 Sobic009G148950--Sobic004G087050 SobicK032300 SobicK032300 Sobic009G148950--SobicK032300 Sobic005G110493--Sobic003G169300 Sobic003G168425 Sobic003G168425 Sobic005G110493--Sobic003G168425 Sobic005G110493--Sobic004G087050 Sobic005G110493--Sobic003G172701 Sobic010G139200 Sobic010G139200 Sobic005G110493--Sobic010G139200 Sobic005G110493--Sobic003G172500 Sobic003G130200 Sobic003G130200 Sobic005G110493--Sobic003G130200 Sobic005G110493--Sobic002G148166 Sobic010G052866 Sobic010G052866 Sobic005G110493--Sobic010G052866 Sobic002G150200 Sobic002G150200 Sobic002G148166--Sobic002G150200 Sobic002G148166--Sobic003G130200 Sobic002G148166--Sobic003G172701 Sobic002G148166--Sobic005G110493 Sobic002G148166--Sobic004G210400 Sobic005G002050 Sobic005G002050 Sobic002G148166--Sobic005G002050 Sobic002G148166--Sobic003G169300 Sobic002G148166--Sobic004G087000 Sobic002G222000 Sobic002G222000 Sobic002G148166--Sobic002G222000 Sobic006G057050--Sobic003G172701 Sobic006G057050--Sobic009G123100 Sobic004G337850 Sobic004G337850 Sobic006G057050--Sobic004G337850 Sobic006G057050--Sobic009G148950 Sobic006G057050--Sobic003G172500 Sobic006G057050--Sobic005G110493 Sobic006G057050--Sobic007G109200 Sobic006G057050--Sobic004G087050 Sobic006G057050--Sobic010G052866 Sobic004G087000--Sobic007G109200 Sobic004G087000--Sobic004G251400 Sobic004G087000--Sobic003G172900 Sobic004G087000--Sobic003G172701 Sobic004G087000--Sobic002G148166 Sobic004G087000--Sobic003G173266 Sobic004G087000--Sobic003G169300 Sobic004G087000--Sobic005G110493 Sobic004G087000--Sobic002G222000 Sobic003G169300--Sobic005G110493 Sobic003G169300--Sobic003G168425 Sobic003G169300--Sobic003G173266 Sobic003G169300--Sobic010G052866 Sobic003G169300--Sobic004G087050 Sobic003G169300--Sobic003G172701 Sobic003G169300--Sobic003G172500 Sobic003G169300--Sobic002G148166 Sobic003G169300--Sobic004G251400 Sobic002G270733--Sobic009G148950 Sobic002G270733--Sobic003G172701 Sobic002G270733--Sobic004G210400 Sobic002G270733--Sobic009G123100 Sobic002G270733--Sobic005G110493 Sobic002G270733--SobicK032300 Sobic002G270733--Sobic006G057050 Sobic002G270733--Sobic003G172500 Sobic002G270733--Sobic002G148166 Sobic004G210400--Sobic003G130200 Sobic004G210400--Sobic002G150200 Sobic004G210400--Sobic002G148166 Sobic004G210400--Sobic003G168425 Sobic004G210400--Sobic005G110493 Sobic004G210400--Sobic010G139200 Sobic004G210400--Sobic004G087050 Sobic004G210400--Sobic003G172701 Sobic004G210400--Sobic005G002050
Octagon: transcription factors


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