Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G251400.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A194YRL6
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G172900 NADPH-dependent oxidoreductase, putative, expressed K05581: NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit J
2 Sobic.004G087000 ATP synthase subunit beta, putative, expressed K02112: ATPF1B, F-type H+/Na+-transporting ATPase subunit beta
3 Sobic.007G109200 ATP synthase epsilon chain, putative, expressed K02114: ATPF1E, F-type H+-transporting ATPase subunit epsilon
4 Sobic.003G173266 - K02956: RP-S15, MRPS15, small subunit ribosomal protein S15
5 Sobic.003G169300 chloroplast 30S ribosomal protein S2, putative, expressed K02967: RP-S2, MRPS2, small subunit ribosomal protein S2
6 Sobic.003G172850 - K03043: DNA-directed RNA polymerase subunit beta
7 Sobic.004G337600 - -
8 Sobic.003G172701 - -
9 Sobic.005G110493 - -
10 Sobic.002G150032 - -
11 Sobic.001G266000 OsClp10 - Putative Clp protease homologue, expressed -
12 Sobic.002G044500 chloroplast 30S ribosomal protein S16, putative, expressed K02959: RP-S16, MRPS16, small subunit ribosomal protein S16
13 Sobic.002G148166 - -
14 Sobic.003G168500 chloroplast 50S ribosomal protein L20, putative, expressed K02887: RP-L20, MRPL20, large subunit ribosomal protein L20
15 Sobic.010G254000 cycloartenol synthase, putative, expressed K19011: achilleol B synthase
16 Sobic.006G057050 - -
17 Sobic.010G052866 - K02892: RP-L23, MRPL23, large subunit ribosomal protein L23
18 Sobic.002G222000 - -
19 Sobic.002G014900 OsFBD13 - F-box and FBD domain containing protein, expressed -
20 Sobic.002G149966 - -


Gene co-expression network
sample Sobic004G251400 Sobic004G251400 Sobic003G172900 Sobic003G172900 Sobic004G251400--Sobic003G172900 Sobic004G087000 Sobic004G087000 Sobic004G251400--Sobic004G087000 Sobic007G109200 Sobic007G109200 Sobic004G251400--Sobic007G109200 Sobic003G173266 Sobic003G173266 Sobic004G251400--Sobic003G173266 Sobic003G169300 Sobic003G169300 Sobic004G251400--Sobic003G169300 Sobic003G172850 Sobic003G172850 Sobic004G251400--Sobic003G172850 Sobic004G337600 Sobic004G337600 Sobic004G251400--Sobic004G337600 Sobic003G172701 Sobic003G172701 Sobic004G251400--Sobic003G172701 Sobic005G110493 Sobic005G110493 Sobic004G251400--Sobic005G110493 Sobic003G172900--Sobic004G251400 Sobic002G150032 Sobic002G150032 Sobic003G172900--Sobic002G150032 Sobic001G266000 Sobic001G266000 Sobic003G172900--Sobic001G266000 Sobic003G172900--Sobic003G173266 Sobic003G172900--Sobic004G087000 Sobic003G172900--Sobic003G172850 Sobic002G044500 Sobic002G044500 Sobic003G172900--Sobic002G044500 Sobic002G222000 Sobic002G222000 Sobic003G172900--Sobic002G222000 Sobic002G149966 Sobic002G149966 Sobic003G172900--Sobic002G149966 Sobic004G087000--Sobic007G109200 Sobic004G087000--Sobic004G251400 Sobic004G087000--Sobic003G172900 Sobic004G087000--Sobic003G172701 Sobic002G148166 Sobic002G148166 Sobic004G087000--Sobic002G148166 Sobic004G087000--Sobic003G173266 Sobic004G087000--Sobic003G169300 Sobic004G087000--Sobic005G110493 Sobic004G087000--Sobic002G222000 Sobic007G109200--Sobic004G087000 Sobic007G109200--Sobic003G172701 Sobic007G109200--Sobic004G251400 Sobic007G109200--Sobic003G172900 Sobic007G109200--Sobic002G148166 Sobic006G057050 Sobic006G057050 Sobic007G109200--Sobic006G057050 Sobic007G109200--Sobic003G169300 Sobic007G109200--Sobic003G173266 Sobic007G109200--Sobic005G110493 Sobic003G173266--Sobic003G169300 Sobic003G173266--Sobic003G172900 Sobic003G173266--Sobic003G172850 Sobic003G173266--Sobic001G266000 Sobic003G173266--Sobic004G251400 Sobic003G173266--Sobic002G222000 Sobic003G173266--Sobic005G110493 Sobic003G173266--Sobic002G148166 Sobic010G052866 Sobic010G052866 Sobic003G173266--Sobic010G052866 Sobic003G169300--Sobic005G110493 Sobic003G168425 Sobic003G168425 Sobic003G169300--Sobic003G168425 Sobic003G169300--Sobic003G173266 Sobic003G169300--Sobic010G052866 Sobic004G087050 Sobic004G087050 Sobic003G169300--Sobic004G087050 Sobic003G169300--Sobic003G172701 Sobic003G172500 Sobic003G172500 Sobic003G169300--Sobic003G172500 Sobic003G169300--Sobic002G148166 Sobic003G169300--Sobic004G251400 Sobic003G168500 Sobic003G168500 Sobic003G172850--Sobic003G168500 Sobic003G172850--Sobic001G266000 Sobic003G172850--Sobic003G173266 Sobic003G172850--Sobic002G044500 Sobic003G172850--Sobic003G172900 Sobic003G172850--Sobic002G150032 Sobic003G172850--Sobic003G169300 Sobic003G168800 Sobic003G168800 Sobic003G172850--Sobic003G168800 Sobic003G172850--Sobic004G251400 Sobic004G337600--Sobic003G168500 Sobic004G337600--Sobic002G044500 Sobic008G160300 Sobic008G160300 Sobic004G337600--Sobic008G160300 Sobic004G337600--Sobic004G251400 Sobic003G171900 Sobic003G171900 Sobic004G337600--Sobic003G171900 Sobic004G337600--Sobic003G172900 Sobic004G337600--Sobic003G169300 Sobic004G337600--Sobic003G172850 Sobic004G337600--Sobic005G110493 Sobic003G172701--Sobic007G109200 Sobic009G148950 Sobic009G148950 Sobic003G172701--Sobic009G148950 Sobic003G172701--Sobic005G110493 Sobic003G172701--Sobic002G148166 Sobic003G172701--Sobic006G057050 Sobic003G172701--Sobic004G087000 Sobic003G172701--Sobic003G169300 Sobic002G270733 Sobic002G270733 Sobic003G172701--Sobic002G270733 Sobic004G210400 Sobic004G210400 Sobic003G172701--Sobic004G210400 Sobic005G110493--Sobic003G169300 Sobic005G110493--Sobic003G168425 Sobic005G110493--Sobic004G087050 Sobic005G110493--Sobic003G172701 Sobic010G139200 Sobic010G139200 Sobic005G110493--Sobic010G139200 Sobic005G110493--Sobic003G172500 Sobic003G130200 Sobic003G130200 Sobic005G110493--Sobic003G130200 Sobic005G110493--Sobic002G148166 Sobic005G110493--Sobic010G052866
Octagon: transcription factors


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