Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G126900.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6PS22
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G044401 - -
2 Sobic.005G101400 pyruvate kinase, putative, expressed K00873: PK, pyruvate kinase
3 Sobic.004G272500 ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase, family 1, putative, expressed -
4 Sobic.005G167450 - -
5 Sobic.001G217800 - -
6 Sobic.007G085966 - -
7 Sobic.003G166400 - K02911: RP-L32, MRPL32, large subunit ribosomal protein L32
8 Sobic.001G118600 Up-reguralion under heat(PubMedID : 24916767)@Up-reguralion under combine stress of drought and heat(PubMedID : 24916767)@DnaK family protein, putative, expressed K09490: HSPA5, endoplasmic reticulum chaperone BiP
9 Sobic.009G069450 - -
10 Sobic.005G183450 - -
11 Sobic.004G208000 isochorismatase family protein, putative, expressed -
12 Sobic.007G164101 - -
13 Sobic.006G124850 - K02948: RP-S11, MRPS11, small subunit ribosomal protein S11
14 Sobic.003G290050 - -
15 Sobic.002G149966 - -
16 Sobic.003G137300 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@LOI1, putative, expressed -
17 Sobic.002G150032 - -
18 Sobic.002G044500 chloroplast 30S ribosomal protein S16, putative, expressed K02959: RP-S16, MRPS16, small subunit ribosomal protein S16
19 Sobic.004G337600 - -
20 Sobic.002G014900 OsFBD13 - F-box and FBD domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic005G126900 Sobic005G126900 Sobic004G044401 Sobic004G044401 Sobic005G126900--Sobic004G044401 Sobic005G101400 Sobic005G101400 Sobic005G126900--Sobic005G101400 Sobic004G272500 Sobic004G272500 Sobic005G126900--Sobic004G272500 Sobic005G167450 Sobic005G167450 Sobic005G126900--Sobic005G167450 Sobic001G217800 Sobic001G217800 Sobic005G126900--Sobic001G217800 Sobic007G085966 Sobic007G085966 Sobic005G126900--Sobic007G085966 Sobic003G166400 Sobic003G166400 Sobic005G126900--Sobic003G166400 Sobic001G118600 Sobic001G118600 Sobic005G126900--Sobic001G118600 Sobic009G069450 Sobic009G069450 Sobic005G126900--Sobic009G069450 Sobic009G029100 Sobic009G029100 Sobic004G044401--Sobic009G029100 Sobic001G523150 Sobic001G523150 Sobic004G044401--Sobic001G523150 Sobic004G044401--Sobic003G166400 Sobic002G270733 Sobic002G270733 Sobic004G044401--Sobic002G270733 Sobic007G052500 Sobic007G052500 Sobic004G044401--Sobic007G052500 Sobic004G337600 Sobic004G337600 Sobic004G044401--Sobic004G337600 Sobic008G039200 Sobic008G039200 Sobic004G044401--Sobic008G039200 Sobic004G044401--Sobic005G126900 Sobic002G165200 Sobic002G165200 Sobic004G044401--Sobic002G165200 Sobic005G101400--Sobic001G217800 Sobic009G104850 Sobic009G104850 Sobic005G101400--Sobic009G104850 Sobic005G101400--Sobic005G167450 Sobic005G101400--Sobic004G272500 Sobic001G540250 Sobic001G540250 Sobic005G101400--Sobic001G540250 Sobic005G101400--Sobic009G069450 Sobic003G249300 Sobic003G249300 Sobic005G101400--Sobic003G249300 Sobic002G322101 Sobic002G322101 Sobic005G101400--Sobic002G322101 Sobic003G169400 Sobic003G169400 Sobic005G101400--Sobic003G169400 Sobic004G272500--Sobic009G104850 Sobic008G160300 Sobic008G160300 Sobic004G272500--Sobic008G160300 Sobic010G107601 Sobic010G107601 Sobic004G272500--Sobic010G107601 Sobic004G272500--Sobic004G337600 Sobic003G172400 Sobic003G172400 Sobic004G272500--Sobic003G172400 Sobic005G096500 Sobic005G096500 Sobic004G272500--Sobic005G096500 Sobic004G272500--Sobic003G169400 Sobic003G168500 Sobic003G168500 Sobic004G272500--Sobic003G168500 Sobic003G171900 Sobic003G171900 Sobic004G272500--Sobic003G171900 Sobic005G167450--Sobic001G217800 Sobic005G167450--Sobic005G101400 Sobic005G167450--Sobic009G104850 Sobic005G167450--Sobic003G249300 Sobic005G167450--Sobic004G272500 Sobic010G225400 Sobic010G225400 Sobic005G167450--Sobic010G225400 Sobic004G234766 Sobic004G234766 Sobic005G167450--Sobic004G234766 Sobic010G107901 Sobic010G107901 Sobic005G167450--Sobic010G107901 Sobic006G093550 Sobic006G093550 Sobic005G167450--Sobic006G093550 Sobic001G217800--Sobic005G101400 Sobic001G217800--Sobic009G104850 Sobic001G217800--Sobic003G249300 Sobic001G217800--Sobic005G167450 Sobic001G217800--Sobic001G540250 Sobic001G217800--Sobic004G272500 Sobic002G341600 Sobic002G341600 Sobic001G217800--Sobic002G341600 Sobic001G217800--Sobic009G029100 Sobic001G302100 Sobic001G302100 Sobic001G217800--Sobic001G302100 Sobic003G123500 Sobic003G123500 Sobic007G085966--Sobic003G123500 Sobic007G085966--Sobic005G101400 Sobic007G085966--Sobic001G540250 Sobic001G448350 Sobic001G448350 Sobic007G085966--Sobic001G448350 Sobic007G085966--Sobic001G217800 Sobic007G085966--Sobic005G126900 Sobic007G085966--Sobic003G249300 Sobic006G247400 Sobic006G247400 Sobic007G085966--Sobic006G247400 Sobic001G477100 Sobic001G477100 Sobic007G085966--Sobic001G477100 Sobic005G110493 Sobic005G110493 Sobic003G166400--Sobic005G110493 Sobic003G130200 Sobic003G130200 Sobic003G166400--Sobic003G130200 Sobic003G168425 Sobic003G168425 Sobic003G166400--Sobic003G168425 Sobic003G169300 Sobic003G169300 Sobic003G166400--Sobic003G169300 Sobic002G148166 Sobic002G148166 Sobic003G166400--Sobic002G148166 Sobic002G150200 Sobic002G150200 Sobic003G166400--Sobic002G150200 Sobic002G222000 Sobic002G222000 Sobic003G166400--Sobic002G222000 Sobic005G002050 Sobic005G002050 Sobic003G166400--Sobic005G002050 Sobic003G173266 Sobic003G173266 Sobic003G166400--Sobic003G173266 Sobic001G118600--Sobic005G126900 Sobic004G208000 Sobic004G208000 Sobic001G118600--Sobic004G208000 Sobic001G118600--Sobic005G167450 Sobic001G118600--Sobic004G044401 Sobic001G118600--Sobic001G217800 Sobic002G275400 Sobic002G275400 Sobic001G118600--Sobic002G275400 Sobic003G412500 Sobic003G412500 Sobic001G118600--Sobic003G412500 Sobic002G373900 Sobic002G373900 Sobic001G118600--Sobic002G373900 Sobic001G118600--Sobic005G101400 Sobic005G183450 Sobic005G183450 Sobic009G069450--Sobic005G183450 Sobic006G020350 Sobic006G020350 Sobic009G069450--Sobic006G020350 Sobic006G017266 Sobic006G017266 Sobic009G069450--Sobic006G017266 Sobic003G128575 Sobic003G128575 Sobic009G069450--Sobic003G128575 Sobic008G157700 Sobic008G157700 Sobic009G069450--Sobic008G157700 Sobic006G124850 Sobic006G124850 Sobic009G069450--Sobic006G124850 Sobic006G147350 Sobic006G147350 Sobic009G069450--Sobic006G147350 Sobic005G093600 Sobic005G093600 Sobic009G069450--Sobic005G093600 Sobic003G290050 Sobic003G290050 Sobic009G069450--Sobic003G290050
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.