Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G208000.1
Synonym Sb04g025370, ATNIC1, NIC1
Functional annotation isochorismatase family protein, putative, expressed
UniProt A0A194YQT3
Pfam PF00857
Panther DB PTHR11080 PTHR11080:SF24
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0008152; metabolic process GO:0003824catalytic activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G22570 : nicotinamidase 1
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g39400.1 : isochorismatase family protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a021254 , Zm00025a031873
Brachypodium KQK00242
Barley HORVU6Hr1G055250.3 , HORVU6Hr1G055250.2 , HORVU6Hr1G055250.1
Wheat TraesCS6A02G216800 , TraesCS6B02G246000 , TraesCS6D02G198700
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.004G208000


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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20 Sobic.001G523150 - -


Gene co-expression network
sample Sobic004G208000 Sobic004G208000 Sobic004G192001 Sobic004G192001 Sobic004G208000--Sobic004G192001 Sobic001G360300 Sobic001G360300 Sobic004G208000--Sobic001G360300 Sobic008G064750 Sobic008G064750 Sobic004G208000--Sobic008G064750 Sobic005G126900 Sobic005G126900 Sobic004G208000--Sobic005G126900 Sobic004G044401 Sobic004G044401 Sobic004G208000--Sobic004G044401 Sobic007G099300 Sobic007G099300 Sobic004G208000--Sobic007G099300 Sobic002G275400 Sobic002G275400 Sobic004G208000--Sobic002G275400 Sobic001G217800 Sobic001G217800 Sobic004G208000--Sobic001G217800 Sobic003G249300 Sobic003G249300 Sobic004G208000--Sobic003G249300 Sobic004G192001--Sobic007G099300 Sobic004G260700 Sobic004G260700 Sobic004G192001--Sobic004G260700 Sobic001G124500 Sobic001G124500 Sobic004G192001--Sobic001G124500 Sobic004G019700 Sobic004G019700 Sobic004G192001--Sobic004G019700 Sobic008G013700 Sobic008G013700 Sobic004G192001--Sobic008G013700 Sobic010G178700 Sobic010G178700 Sobic004G192001--Sobic010G178700 Sobic010G111900 Sobic010G111900 Sobic004G192001--Sobic010G111900 Sobic004G125600 Sobic004G125600 Sobic004G192001--Sobic004G125600 Sobic003G439200 Sobic003G439200 Sobic004G192001--Sobic003G439200 Sobic002G072050 Sobic002G072050 Sobic001G360300--Sobic002G072050 Sobic004G160350 Sobic004G160350 Sobic001G360300--Sobic004G160350 Sobic009G192450 Sobic009G192450 Sobic001G360300--Sobic009G192450 Sobic002G025100 Sobic002G025100 Sobic001G360300--Sobic002G025100 Sobic001G360300--Sobic003G439200 Sobic003G313600 Sobic003G313600 Sobic001G360300--Sobic003G313600 Sobic001G360300--Sobic004G208000 Sobic002G331050 Sobic002G331050 Sobic001G360300--Sobic002G331050 Sobic006G201450 Sobic006G201450 Sobic001G360300--Sobic006G201450 Sobic008G064750--Sobic004G208000 Sobic008G064750--Sobic010G111900 Sobic005G044900 Sobic005G044900 Sobic008G064750--Sobic005G044900 Sobic005G167450 Sobic005G167450 Sobic008G064750--Sobic005G167450 Sobic008G064750--Sobic003G249300 Sobic008G064750--Sobic004G125600 Sobic008G064750--Sobic005G126900 Sobic001G302100 Sobic001G302100 Sobic008G064750--Sobic001G302100 Sobic008G064750--Sobic001G217800 Sobic005G126900--Sobic004G044401 Sobic005G101400 Sobic005G101400 Sobic005G126900--Sobic005G101400 Sobic004G272500 Sobic004G272500 Sobic005G126900--Sobic004G272500 Sobic005G126900--Sobic005G167450 Sobic005G126900--Sobic001G217800 Sobic007G085966 Sobic007G085966 Sobic005G126900--Sobic007G085966 Sobic003G166400 Sobic003G166400 Sobic005G126900--Sobic003G166400 Sobic001G118600 Sobic001G118600 Sobic005G126900--Sobic001G118600 Sobic009G069450 Sobic009G069450 Sobic005G126900--Sobic009G069450 Sobic009G029100 Sobic009G029100 Sobic004G044401--Sobic009G029100 Sobic001G523150 Sobic001G523150 Sobic004G044401--Sobic001G523150 Sobic004G044401--Sobic003G166400 Sobic002G270733 Sobic002G270733 Sobic004G044401--Sobic002G270733 Sobic007G052500 Sobic007G052500 Sobic004G044401--Sobic007G052500 Sobic004G337600 Sobic004G337600 Sobic004G044401--Sobic004G337600 Sobic008G039200 Sobic008G039200 Sobic004G044401--Sobic008G039200 Sobic004G044401--Sobic005G126900 Sobic002G165200 Sobic002G165200 Sobic004G044401--Sobic002G165200 Sobic007G099300--Sobic001G124500 Sobic007G099300--Sobic004G192001 Sobic006G142700 Sobic006G142700 Sobic007G099300--Sobic006G142700 Sobic004G125701 Sobic004G125701 Sobic007G099300--Sobic004G125701 Sobic007G099300--Sobic004G260700 Sobic007G099300--Sobic008G013700 Sobic007G099300--Sobic004G125600 Sobic007G099300--Sobic004G019700 Sobic010G150000 Sobic010G150000 Sobic007G099300--Sobic010G150000 Sobic002G275400--Sobic004G125701 Sobic002G275400--Sobic004G125600 Sobic003G386400 Sobic003G386400 Sobic002G275400--Sobic003G386400 Sobic004G299850 Sobic004G299850 Sobic002G275400--Sobic004G299850 Sobic002G275400--Sobic007G099300 Sobic003G412500 Sobic003G412500 Sobic002G275400--Sobic003G412500 Sobic002G275400--Sobic009G029100 Sobic002G341600 Sobic002G341600 Sobic002G275400--Sobic002G341600 Sobic001G523932 Sobic001G523932 Sobic002G275400--Sobic001G523932 Sobic001G217800--Sobic005G101400 Sobic009G104850 Sobic009G104850 Sobic001G217800--Sobic009G104850 Sobic001G217800--Sobic003G249300 Sobic001G217800--Sobic005G167450 Sobic001G540250 Sobic001G540250 Sobic001G217800--Sobic001G540250 Sobic001G217800--Sobic004G272500 Sobic001G217800--Sobic002G341600 Sobic001G217800--Sobic009G029100 Sobic001G217800--Sobic001G302100 Sobic003G249300--Sobic001G540250 Sobic003G249300--Sobic001G217800 Sobic003G249300--Sobic001G302100 Sobic003G249300--Sobic005G167450 Sobic003G249300--Sobic002G341600 Sobic003G249300--Sobic004G125701 Sobic003G249300--Sobic005G101400 Sobic003G249300--Sobic004G125600 Sobic003G249300--Sobic009G104850
Octagon: transcription factors


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