Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G360300.1,Sobic.001G360300.2
Synonym anac081, ATAF2, Sb01g034410
Functional annotation NAC domain-containing protein 67, putative, expressed
UniProt C5WYQ3
Pfam PF02365
Panther DB PTHR31719 PTHR31719:SF32
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0006355; regulation of transcription, DNA-templated GO:0003677DNA binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G08790 : NAC (No Apical Meristem) domain transcriptional regulator superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g60080.1 : NAC domain-containing protein 67, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G072050 - -
2 Sobic.004G160350 - -
3 Sobic.009G192450 - -
4 Sobic.002G025100 expressed protein -
5 Sobic.003G439200 RNA polymerase IV largest subunit, putative, expressed K16251: DNA-directed RNA polymerase V subunit 1
6 Sobic.003G313600 - -
7 Sobic.004G208000 isochorismatase family protein, putative, expressed -
8 Sobic.002G331050 - -
9 Sobic.006G201450 - -
10 Sobic.003G368450 - -
11 Sobic.001G523932 - -
12 Sobic.007G113000 expressed protein -
13 Sobic.003G336550 - -
14 Sobic.006G162750 - -
15 Sobic.003G169800 - -
16 Sobic.008G100801 - -
17 Sobic.004G260700 - -
18 Sobic.008G100900 - -
19 Sobic.004G192001 - -
20 Sobic.010G169950 - -


Gene co-expression network
sample Sobic001G360300 Sobic001G360300 Sobic002G072050 Sobic002G072050 Sobic001G360300--Sobic002G072050 Sobic004G160350 Sobic004G160350 Sobic001G360300--Sobic004G160350 Sobic009G192450 Sobic009G192450 Sobic001G360300--Sobic009G192450 Sobic002G025100 Sobic002G025100 Sobic001G360300--Sobic002G025100 Sobic003G439200 Sobic003G439200 Sobic001G360300--Sobic003G439200 Sobic003G313600 Sobic003G313600 Sobic001G360300--Sobic003G313600 Sobic004G208000 Sobic004G208000 Sobic001G360300--Sobic004G208000 Sobic002G331050 Sobic002G331050 Sobic001G360300--Sobic002G331050 Sobic006G201450 Sobic006G201450 Sobic001G360300--Sobic006G201450 Sobic002G072050--Sobic004G160350 Sobic002G072050--Sobic003G313600 Sobic002G072050--Sobic001G360300 Sobic010G169950 Sobic010G169950 Sobic002G072050--Sobic010G169950 Sobic002G204050 Sobic002G204050 Sobic002G072050--Sobic002G204050 Sobic002G072050--Sobic009G192450 Sobic002G072050--Sobic002G025100 Sobic006G205300 Sobic006G205300 Sobic002G072050--Sobic006G205300 Sobic001G037033 Sobic001G037033 Sobic002G072050--Sobic001G037033 Sobic004G160350--Sobic002G072050 Sobic004G160350--Sobic002G025100 Sobic004G160350--Sobic009G192450 Sobic004G160350--Sobic003G313600 Sobic004G160350--Sobic010G169950 Sobic004G160350--Sobic001G360300 Sobic004G084600 Sobic004G084600 Sobic004G160350--Sobic004G084600 Sobic001G523150 Sobic001G523150 Sobic004G160350--Sobic001G523150 Sobic003G096950 Sobic003G096950 Sobic004G160350--Sobic003G096950 Sobic009G192450--Sobic004G160350 Sobic003G368450 Sobic003G368450 Sobic009G192450--Sobic003G368450 Sobic009G192450--Sobic002G025100 Sobic004G117850 Sobic004G117850 Sobic009G192450--Sobic004G117850 Sobic009G192450--Sobic003G313600 Sobic009G192450--Sobic001G360300 Sobic009G192450--Sobic002G072050 Sobic009G192450--Sobic004G084600 Sobic007G113000 Sobic007G113000 Sobic009G192450--Sobic007G113000 Sobic002G025100--Sobic004G160350 Sobic002G025100--Sobic009G192450 Sobic002G025100--Sobic002G072050 Sobic002G025100--Sobic001G360300 Sobic003G336550 Sobic003G336550 Sobic002G025100--Sobic003G336550 Sobic002G025100--Sobic003G313600 Sobic002G025100--Sobic004G084600 Sobic002G025100--Sobic010G169950 Sobic001G073550 Sobic001G073550 Sobic002G025100--Sobic001G073550 Sobic003G305250 Sobic003G305250 Sobic003G439200--Sobic003G305250 Sobic008G013700 Sobic008G013700 Sobic003G439200--Sobic008G013700 Sobic004G192001 Sobic004G192001 Sobic003G439200--Sobic004G192001 Sobic004G260700 Sobic004G260700 Sobic003G439200--Sobic004G260700 Sobic010G178700 Sobic010G178700 Sobic003G439200--Sobic010G178700 Sobic003G439200--Sobic006G201450 Sobic003G439200--Sobic001G360300 Sobic003G439200--Sobic009G192450 Sobic005G024300 Sobic005G024300 Sobic003G439200--Sobic005G024300 Sobic003G313600--Sobic002G072050 Sobic003G313600--Sobic006G205300 Sobic003G313600--Sobic004G160350 Sobic003G313600--Sobic010G169950 Sobic003G253100 Sobic003G253100 Sobic003G313600--Sobic003G253100 Sobic010G264150 Sobic010G264150 Sobic003G313600--Sobic010G264150 Sobic003G313600--Sobic003G336550 Sobic008G039200 Sobic008G039200 Sobic003G313600--Sobic008G039200 Sobic003G313600--Sobic007G113000 Sobic004G208000--Sobic004G192001 Sobic004G208000--Sobic001G360300 Sobic008G064750 Sobic008G064750 Sobic004G208000--Sobic008G064750 Sobic005G126900 Sobic005G126900 Sobic004G208000--Sobic005G126900 Sobic004G044401 Sobic004G044401 Sobic004G208000--Sobic004G044401 Sobic007G099300 Sobic007G099300 Sobic004G208000--Sobic007G099300 Sobic002G275400 Sobic002G275400 Sobic004G208000--Sobic002G275400 Sobic001G217800 Sobic001G217800 Sobic004G208000--Sobic001G217800 Sobic003G249300 Sobic003G249300 Sobic004G208000--Sobic003G249300 Sobic003G253900 Sobic003G253900 Sobic002G331050--Sobic003G253900 Sobic004G007032 Sobic004G007032 Sobic002G331050--Sobic004G007032 Sobic002G316301 Sobic002G316301 Sobic002G331050--Sobic002G316301 Sobic002G331050--Sobic003G439200 Sobic002G331050--Sobic001G360300 Sobic001G316500 Sobic001G316500 Sobic002G331050--Sobic001G316500 Sobic002G331050--Sobic009G192450 Sobic008G108000 Sobic008G108000 Sobic002G331050--Sobic008G108000 Sobic003G386400 Sobic003G386400 Sobic002G331050--Sobic003G386400 Sobic001G311700 Sobic001G311700 Sobic006G201450--Sobic001G311700 Sobic006G201450--Sobic003G336550 Sobic006G201450--Sobic004G260700 Sobic002G231400 Sobic002G231400 Sobic006G201450--Sobic002G231400 Sobic006G201450--Sobic003G305250 Sobic006G045301 Sobic006G045301 Sobic006G201450--Sobic006G045301 Sobic004G200000 Sobic004G200000 Sobic006G201450--Sobic004G200000 Sobic005G083866 Sobic005G083866 Sobic006G201450--Sobic005G083866 Sobic006G021100 Sobic006G021100 Sobic006G201450--Sobic006G021100
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.