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Transcriptome id Sobic.003G336550.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1W0W038
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G030850 - -
2 Sobic.006G041200 - -
3 Sobic.006G021100 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@L-ascorbate peroxidase (Os)(PubMedID : 27208977)@Up-reguralion under heat(PubMedID : 24916767)@Up-reguralion under combine stress of drought and heat(PubMedID : 24916767)@OsAPx3 - Peroxisomal Ascorbate Peroxidase encoding gene 5,8, expressed K00434: L-ascorbate peroxidase
4 Sobic.004G084600 similar to Putative uncharacterized protein(PubMedID : 29862293)@AP2 domain containing protein, expressed -
5 Sobic.006G111000 expressed protein -
6 Sobic.004G255550 - -
7 Sobic.001G485901 - -
8 Sobic.007G203800 - -
9 Sobic.008G113200 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@pentatricopeptide, putative, expressed -
10 Sobic.003G313600 - -
11 Sobic.006G201450 - -
12 Sobic.006G072701 - -
13 Sobic.009G192400 - -
14 Sobic.003G135900 OsRhmbd3 - Putative Rhomboid homologue, expressed K09651: rhomboid domain-containing protein 1
15 Sobic.001G283400 CSLD1 - cellulose synthase-like family D, expressed -
16 Sobic.007G182300 Plant PDR ABC transporter associated domain containing protein, expressed -
17 Sobic.002G171901 - -
18 Sobic.002G231400 - -
19 Sobic.009G199750 - -
20 Sobic.003G096950 - -


Gene co-expression network
sample Sobic003G336550 Sobic003G336550 Sobic004G030850 Sobic004G030850 Sobic003G336550--Sobic004G030850 Sobic006G041200 Sobic006G041200 Sobic003G336550--Sobic006G041200 Sobic006G021100 Sobic006G021100 Sobic003G336550--Sobic006G021100 Sobic004G084600 Sobic004G084600 Sobic003G336550--Sobic004G084600 Sobic006G111000 Sobic006G111000 Sobic003G336550--Sobic006G111000 Sobic004G255550 Sobic004G255550 Sobic003G336550--Sobic004G255550 Sobic001G485901 Sobic001G485901 Sobic003G336550--Sobic001G485901 Sobic007G203800 Sobic007G203800 Sobic003G336550--Sobic007G203800 Sobic008G113200 Sobic008G113200 Sobic003G336550--Sobic008G113200 Sobic004G030850--Sobic003G336550 Sobic004G030850--Sobic004G084600 Sobic010G088100 Sobic010G088100 Sobic004G030850--Sobic010G088100 Sobic004G030850--Sobic008G113200 Sobic006G072701 Sobic006G072701 Sobic004G030850--Sobic006G072701 Sobic004G030850--Sobic004G255550 Sobic002G171901 Sobic002G171901 Sobic004G030850--Sobic002G171901 Sobic003G053750 Sobic003G053750 Sobic004G030850--Sobic003G053750 Sobic004G030850--Sobic006G041200 Sobic006G041200--Sobic006G111000 Sobic006G041200--Sobic004G255550 Sobic007G182300 Sobic007G182300 Sobic006G041200--Sobic007G182300 Sobic006G041200--Sobic003G336550 Sobic006G041200--Sobic004G084600 Sobic003G219300 Sobic003G219300 Sobic006G041200--Sobic003G219300 Sobic006G041200--Sobic002G171901 Sobic002G200400 Sobic002G200400 Sobic006G041200--Sobic002G200400 Sobic004G180950 Sobic004G180950 Sobic006G041200--Sobic004G180950 Sobic006G021100--Sobic003G336550 Sobic006G021100--Sobic006G041200 Sobic007G089566 Sobic007G089566 Sobic006G021100--Sobic007G089566 Sobic006G021100--Sobic003G219300 Sobic006G021100--Sobic007G203800 Sobic002G226200 Sobic002G226200 Sobic006G021100--Sobic002G226200 Sobic006G021100--Sobic004G030850 Sobic006G021100--Sobic006G111000 Sobic006G021100--Sobic004G084600 Sobic004G084600--Sobic002G171901 Sobic004G084600--Sobic006G072701 Sobic004G084600--Sobic004G030850 Sobic004G084600--Sobic006G041200 Sobic004G084600--Sobic006G111000 Sobic004G084600--Sobic003G336550 Sobic004G084600--Sobic007G203800 Sobic004G084600--Sobic010G088100 Sobic004G117850 Sobic004G117850 Sobic004G084600--Sobic004G117850 Sobic006G111000--Sobic006G041200 Sobic008G100900 Sobic008G100900 Sobic006G111000--Sobic008G100900 Sobic006G111000--Sobic007G182300 Sobic006G111000--Sobic004G117850 Sobic006G111000--Sobic004G084600 Sobic006G111000--Sobic004G255550 Sobic006G111000--Sobic002G171901 Sobic006G111000--Sobic003G336550 Sobic009G176100 Sobic009G176100 Sobic006G111000--Sobic009G176100 Sobic004G255550--Sobic006G041200 Sobic004G255550--Sobic008G113200 Sobic004G255550--Sobic002G226200 Sobic004G255550--Sobic006G111000 Sobic004G255550--Sobic003G336550 Sobic008G083100 Sobic008G083100 Sobic004G255550--Sobic008G083100 Sobic004G255550--Sobic004G030850 Sobic004G255550--Sobic007G182300 Sobic007G078700 Sobic007G078700 Sobic004G255550--Sobic007G078700 Sobic001G485901--Sobic003G336550 Sobic007G108600 Sobic007G108600 Sobic001G485901--Sobic007G108600 Sobic001G485901--Sobic004G030850 Sobic003G313600 Sobic003G313600 Sobic001G485901--Sobic003G313600 Sobic003G253100 Sobic003G253100 Sobic001G485901--Sobic003G253100 Sobic004G118000 Sobic004G118000 Sobic001G485901--Sobic004G118000 Sobic001G485901--Sobic008G113200 Sobic009G026700 Sobic009G026700 Sobic001G485901--Sobic009G026700 Sobic001G485901--Sobic004G255550 Sobic007G203800--Sobic002G171901 Sobic007G203800--Sobic004G084600 Sobic009G192400 Sobic009G192400 Sobic007G203800--Sobic009G192400 Sobic007G203800--Sobic006G041200 Sobic007G225050 Sobic007G225050 Sobic007G203800--Sobic007G225050 Sobic007G206400 Sobic007G206400 Sobic007G203800--Sobic007G206400 Sobic007G203800--Sobic003G336550 Sobic007G203800--Sobic006G021100 Sobic008G085800 Sobic008G085800 Sobic007G203800--Sobic008G085800 Sobic008G113200--Sobic004G255550 Sobic008G113200--Sobic008G083100 Sobic008G113200--Sobic004G030850 Sobic008G113200--Sobic006G111000 Sobic008G113200--Sobic003G336550 Sobic008G113200--Sobic002G226200 Sobic008G113200--Sobic004G084600 Sobic008G113200--Sobic009G192400 Sobic009G137401 Sobic009G137401 Sobic008G113200--Sobic009G137401
Octagon: transcription factors


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